CUGBP 和 ELAV 家族,成员 3; CELF3

含有三核苷酸重复的基因 4;TNRC4
BRUNO样 1;BRUNOL1
CUGBP 和 ETR3 样因子 3

HGNC 批准的基因符号:CELF3

细胞遗传学位置:1q21.3 基因组坐标(GRCh38):1:151,700,058-151,716,803(来自 NCBI)

▼ 说明

CELF 家族的成员,例如 CELF3,在共转录和转录后 RNA 加工中发挥各种作用。所有 CELF 蛋白似乎都会影响前 mRNA 剪接,但各个 CELF 在调节 mRNA 稳定性和翻译方面具有不同的作用(Wagnon 等人总结,2012)。

▼ 克隆与表达

Good 等人通过在数据库中搜索与 Xenopus Brunol1 相似的人类序列(2000) 鉴定了 TNRC4 的部分序列,他们将其称为 BRUNOL1。部分人类蛋白与非洲爪蟾 Brunol1 具有 91% 的氨基酸一致性。

Ladd 等人通过在 EST 数据库中搜索与 CUGBP(601074) 相似的序列,然后对人脑 cDNA 文库进行 PCR,得出了这一结论(2001) 克隆了 TNRC4,他们将其称为 CELF3。推导的 462 个氨基酸的蛋白质包含 2 个 N 端 RNA 识别基序(RRM)、一个 C 端 RRM、几个潜在的磷酸化位点以及 C 端附近的核定位信号。拉德等人(2001)还鉴定了CELF3中的等位基因变异区域,其中可变数量的CAG重复序列编码一段不固定长度的谷氨酰胺。RNA斑点印迹分析仅在大脑中检测到CELF3表达。

Ladd 等人使用 RNA 斑点印迹分析(2004) 发现 CELF3 在成人大脑的几个区域、垂体和胎儿大脑中高度表达。

Chapple 等人通过对成人皮质进行蛋白质印迹分析(2007) 表明全长 465 个氨基酸的 TNRC4 蛋白具有约 50 kD 的表观分子量。表位标记的 TNRC4 在转染的中国仓鼠卵巢细胞的细胞核和细胞质中表达。RRM3 的去除导致 TNRC4 从细胞核中排除,证实了 C 端核定位信号的存在。

▼ 基因功能

拉德等人(2001) 表明,所有人类 CELF 蛋白,包括 CELF3,都与含有肌肉特异性剪接增强子(MSE) 元件的 RNA 结合,并且可以在转染的鹌鹑成纤维细胞中激活心肌肌钙蛋白 T(TNNT2; 191045) 小基因的 MSE 依赖性外显子包含。

Chapple 等人通过对转染的中国仓鼠卵巢细胞进行 RT-PCR 分析(2007) 表明 TNRC4 激活了 tau(MAPT; 157140) 小基因中外显子 10 的包含。缺失和突变分析表明,TNRC4 对 tau 外显子 10 剪接的活性需要 TNRC4 中的 RRM2 和 tau 前体 mRNA 中的内含子元件。TNRC4 的聚谷氨酰胺序列对 tau 外显子 10 剪接没有影响。Tnrc4 -/- 小鼠表现出 tau mRNA 中外显子 10 的包含减少。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Good 等人(2000) 将 TNRC4 基因定位到染色体 1q21。