SURFEIT 6; SURF6

HGNC 批准的基因符号:SURF6

细胞遗传学位置:9q34.2 基因组坐标(GRCh38):9:133,328,776-133,336,188(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Magoulas 和 Fried(1996) 分离出小鼠 Surf6。推导的小鼠Surf6蛋白含有355个氨基酸,呈高碱性。Surf6 具有管家基因的共同特征,包括其转录本的普遍表达。免疫荧光和免疫印迹分析将 Surf6 蛋白定位于核仁。免疫细胞化学显微镜将 Surf6 主要定位于核仁颗粒成分,这是一种参与核糖体成熟的结构。

通过用小鼠 Surf6 筛选人胎脑 cDNA 文库,然后对淋巴细胞 RNA 进行 5-prime RACE,Magoulas 和 Fried(2000) 克隆了人 SURF6。推导的 361 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 41.2 kD,具有高碱性,并具有假定的核定位基序。SURF6 与小鼠蛋白有 72% 的同一性。Northern 印迹分析显示主要 2.0-kb 转录物的普遍表达,并且在一些组织中还检测到次要 4.2-kb 转录物。

▼ 基因功能

马古拉斯等人(1998)发现重组小鼠Surf6以高亲和力结合RNA,以较低亲和力结合DNA。同步化小鼠成纤维细胞的免疫荧光分析表明,Surf6 在细胞周期中保持核仁定位,但在间期和有丝分裂期间并未与主要核仁蛋白 B23(NPM1; 164040) 和 fibrillarin(FBL; 134795) 完全共定位。马古拉斯等人(1998)提出SURF6可能通过其与核酸的结合来支持核仁基质结构和功能,并且它可能参与rRNA的加工。

罗曼诺娃等人(2006) 发现 Surf6 mRNA 在小鼠卵母细胞中表达,并在受精卵中通过母系遗传。Surf6 首先在 2 细胞中期胚胎的细胞核中清晰可见,它在核仁前体周围积累,这些前体很可能是卡哈尔(卷曲)体。在4细胞和8细胞胚胎中,Surf6保留在核仁前体周围,但其定位比在2细胞胚胎中更广泛。在桑葚和囊胚中,Surf6 的定位与小鼠体细胞核仁中的定位基本相似。通过 RNA 干扰敲低 Surf6 表达导致 8 细胞/桑葚胚阶段发育停滞,以及 18S rRNA 水平下降。罗曼诺娃等人(2006) 得出结论,当卵母细胞和胚胎核具有转录能力时,SURF6 会在卵母细胞和胚胎核中积累,并且其定位与 B23 和原纤维蛋白的定位相似但不相同。

▼ 基因结构

Magoulas 和 Fried(2000) 确定 SURF6 基因包含 5 个外显子,长度约为 4.3 kb。它至少有 2 个转录起始位点。上游区域包含一个 CpG 岛,但没有 TATA 基序,内含子区域包含 4 个重复的 Alu 元件。

▼ 测绘

SURF6 基因位于染色体 9q34.1 的 surfeit 基因簇内(Yon 等,1993)。Magoulas 和 Fried(2000) 通过序列分析确定 SURF6 基因的 5 素末端和 SURF5 基因(MED22; 185641) 的 3 素末端相隔 3.2 kb,并且基因间区域包含经过加工的RPL21(603636) 的假基因。