A-激酶锚定蛋白 8 样蛋白; AKAP8L
AKAP8样蛋白
与 AKAP95 同源; HA95
AKAP95 的邻居; NAKAP95; NAKAP
解旋酶 A 结合蛋白,95-KD; HAP95
HGNC 批准的基因符号:AKAP8L
细胞遗传学位置:19p13.12 基因组坐标(GRCh38):19:15,380,050-15,418,988(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Orstavik 等人通过搜索与 AKAP95(AKAP8; 604692) 相似的序列,然后进行骨骼肌 cDNA 文库的 5-prime RACE 并筛选羊膜细胞 cDNA 文库(2000) 克隆了 AKAP8L,他们将其命名为 HA95。推导的 646 个氨基酸的蛋白质与 AKAP95 有 61% 的同源性。Northern 印迹分析显示 5.0-kb HA95 转录物普遍存在且一致的表达。在转染的人淋巴瘤细胞系的分裂间期,HA95 的 N 端一半定位于细胞核。
关等人(2000) 从胎儿大脑 cDNA 文库中克隆了 AKAP8L,并将其命名为 NAKAP95。推导的 646 个氨基酸的蛋白质与 AKAP95 有 30% 的同一性。两者均在相似位置包含 2 个 C2H2 型锌指基序和核定位信号,但 NAKAP95 缺乏 AKAP95 中发现的蛋白激酶 A(PKA;参见 176911)结合基序。PCR 分析在所有检查的组织中均检测到 NAPAK95。
Westberg 等人使用 RNA 解旋酶 A(RHA 或 DDX9;603115)的 C 端结构域作为白细胞 cDNA 文库的酵母 2 杂交筛选中的诱饵,然后筛选 T 细胞淋巴瘤细胞系(2000) 克隆了 AKAP8L,他们将其命名为 HAP95。预测的蛋白质的计算分子量为 72 kD,但 SDS-PAGE 显示表观分子量约为 100 kD。HAP95 的 N 末端包含串联和非串联 YG 二肽重复序列,后面是 3 个 FG 重复序列和中央核定位信号。C 端一半包含 2 个锌指基序和 2 个富含脯氨酸的 SH3 结合域。Northern 印迹分析在所有检查的细胞系中检测到 2.0 和 4.0 kb 的转录本。荧光标记的 HAP95 主要定位于转染的 HeLa 细胞的细胞核,但排除在核仁之外。异核分析表明HAP95在细胞核和细胞质之间穿梭。
▼ 基因功能
通过表位标记蛋白的免疫沉淀,Orstavik 等人(2000) 发现 HA95 与其自身相互作用,但不与 AKAP95 相互作用。
通过转染的 HeLa 细胞的免疫共沉淀,Westberg 等人(2000) 证实 HAP95 与 RHA 的 C 端结构域相互作用。HAP95 还与 D 型逆转录病毒组成型转运元件(CTE) 相互作用,在转染的人胚胎肾细胞中介导未剪接病毒转录本的核输出。使用 HAP95 和 TAP(NXF1;602647) 对 CTE RNA 进行免疫沉淀。HAP95过表达上调CTE依赖性基因表达,但对一般基因表达或人类免疫缺陷病毒1的Rev/Rev反应元件介导的表达没有影响。
Sayer 等人使用酵母 2 杂交筛选(2005) 发现小鼠 Hypa(PRPF40A; 612941) 与人 NAKAP 相互作用。缺失图谱表明结合是通过 NAKAP 的富含脯氨酸的结构域和 Hypa 的 WW 结构域发生的。在人胚胎肾细胞中,NAKAP 和 HYPA 位于细胞核内并与核基质共纯化。NAKAP 与正常人脑中的 HYPA 相关,并且两种蛋白均与亨廷顿病(143100) 脑中的亨廷顿蛋白(613004) 蛋白的一部分共纯化。
▼ 基因结构
奥斯塔维克等人(2000) 确定 AKAP8L 基因的编码区包含 14 个外显子,跨度约为 37 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Orstavik 等人(2000) 将 AKAP8L 基因图谱定位到紧邻 AKAP95 基因上游的染色体 19p13.1。这 2 个基因在同一条 DNA 链上串联排列,相距约 280 bp。
通过体细胞杂交和辐射杂交分析,Seki 等人(2000) 将 AKAP8L 基因定位到染色体 19p13.12-p13.11。