含锌指和 BTB 结构域的蛋白质 20; ZBTB20
锌指蛋白 288;ZNF288
树枝状衍生的 BTB/POZ 锌指;DPZF
HOF
HGNC 批准的基因符号:ZBTB20
细胞遗传学位置:3q13.31 基因组坐标(GRCh38):3:114,314,500-115,147,288(来自 NCBI)
▼ 说明
ZBTB20 是转录抑制因子 POK(POZ 和 Kruppel)家族的成员,通过其保守的 C2H2 Kruppel 型锌指和 BTB/POZ 结构域与 DNA 相互作用(Sutherland 等,2009)。
▼ 克隆与表达
使用具有不完整 ORF 的 EST,可能编码来自人树突细胞 cDNA 文库的 4 个 C2H2 锌指基序,然后是 5-prime RACE,Zhang 等人(2001) 分离出一种新型锌指 ZNF288 的全长 cDNA 克隆,他们将其称为 DPZF。推导的733个氨基酸的蛋白质的分子量为80 kD,包含N端BTB/POZ结构域和C端锌指结构域,具有4个典型的Kruppel型C2H2基序。在 BTB/POZ 结构域内,ZNF288 与 BCL6(109565) 具有高度同源性,BCL6 是一种推定参与淋巴细胞生成的 POK 蛋白。Northern blot分析检测ZNF288在脾脏、淋巴结、胸腺、外周血白细胞和胎儿肝脏中的表达;骨髓中未发现表达。大多数组织中存在大约 7.4 kb 和 2.8 kb 的两个转录本,其中 2.8 kb 转录本主要存在于脾脏、淋巴结和外周血白细胞中。RT-PCR 分析检测了树突状细胞、单核细胞、B 细胞和 T 细胞中的表达。在淋巴肿瘤,尤其是 B 淋巴瘤中可检测到 100 kD ZNF288 蛋白的表达。作者提出,ZNF288可能是与BCL6密切相关的转录因子,可能参与造血、肿瘤发生和免疫反应。
Mitchelmore 等人通过消减克隆鉴定小鼠少突胶质细胞中表达的 mRNA(2002) 克隆了小鼠 Zbtb20 的 2 个主要剪接变体,他们将其称为 Hofl 和 Hofs。推导的蛋白质分别含有 741 和 668 个氨基酸,与人类对应蛋白有 97% 的一致性。Hofl 和 Hofs 仅在 N 末端不同,Hofs 缺少 Hofl 的前 73 个氨基酸。米切尔莫尔等人(2002)还对编码与Hofl相同蛋白质的4个额外剪接变体和编码与Hofs相同蛋白质的2个额外剪接变体进行了测序。体外翻译的 Hofl 的蛋白质印迹分析产生了与 Hofl 和 Hofs 相对应的蛋白质,表明 Hofl 翻译起始位点不是最理想的。对发育中小鼠大脑的免疫组织化学分析表明,Hofl 和 Hofs 在早期海马神经元、小脑颗粒细胞、神经胶质祖细胞以及分化的神经胶质细胞中特异性表达。在发育中的大脑皮层中,Hof 表达仅限于海马区,其表达与假定的 CA1 和 CA3 锥体神经元和齿状回颗粒细胞的早期分化一致,但在 CA1/下边界表达急剧下降。Hof 表达在分化的海马细胞中下调。
▼ 基因结构
米切尔莫尔等人(2002) 确定 ZBTB20 基因包含 11 个外显子,跨度可达 700 kb。外显子 8 和 10 有翻译起始位点。
▼ 测绘
Harboe 等人通过 FISH 和辐射杂交分析(2000) 将 ZNF288 基因定位到染色体 3q13.2。
▼ 基因功能
甲胎蛋白基因(AFP;104150)在胎儿肝脏中高度激活,但在出生后不久就受到显着抑制。Xie 等人使用染色质免疫沉淀分析和报告基因检测(2008) 表明小鼠 Zbtb20 与 Afp 启动子结合并以剂量依赖性方式抑制 Afp 转录。免疫组织化学分析显示Zbtb20在成年小鼠肝细胞的细胞核中表达。此外,RT-PCR 和 Western blot 分析表明 Zbtb20 和 Afp 在胎儿和成人肝脏中的表达呈负相关。
Mitchelmore 等人使用蛋白质下拉分析(2002) 表明小鼠 Hofl 和 Hofs 在同型和异型相互作用中都有很强的相互作用,并且 BTB/POZ 结构域似乎是主要的相互作用界面。分离的 Hof 锌指结合了与 PLZF 相互作用的 DNA 序列(ZBTB16;176797)。
▼ 分子遗传学
Cordeddu 等人在 8 名樱草花综合征(PRIMS; 259050) 患者中进行了研究(2014)鉴定了ZBTB20基因中从头错义变体的杂合性(参见例如606025.0001-606025.0004)。功能分析表明,与野生型相比,所有突变体的 DNA 结合都大大减少,结果与对野生型等位基因具有显性负性影响的突变一致。
Mattioli 等人在一名患有樱草花综合症的 4 岁男孩中(2016) 鉴定了 ZBTB20 基因(606025.0005) 同一等位基因上 2 个从头错义突变的杂合性。
Grimsdottir 等人对一名患有樱草花综合症的 14 岁男孩进行了研究(2019) 鉴定了 ZBTB20 基因中的从头错义突变的杂合性(H600Q; 606025.0006)。
Stellacci 等人在 2 名无关的樱草花综合征患者中进行了研究(2018) 鉴定了 ZBTB20 基因中的从头杂合突变:首次报道的移码突变(c.1024delC; 606025.0007) 和蛋白质第三个锌指基序中的错义突变(T644I; 606025.0008)。作者指出,先前报道的突变发生在第一和第二锌指基序中。功能数据表明,这两种突变都会产生稳定但功能失调的蛋白质,其特征是与 DNA 的结合受损,这与显性负效应一致。
▼ 动物模型
谢等人(2008) 创造了针对肝脏的 Zbtb20 敲除小鼠。这些小鼠以预期的比例出生,外观正常,肝脏大小和结构正常。突变的肝细胞正常分化。RT-PCR显示,Zbtb20敲除的成人肝脏表达的Afp mRNA水平比正常成人肝脏高约3,000倍。Afp mRNA 在野生型和 Zbtb20 敲除胎儿肝脏中逐渐激活,但只有野生型肝脏在生命的前 4 周内表现出 Afp 表达急剧下降。在 Zbtb20 敲除肝脏中,Afp mRNA 水平下降不到 5 倍,并保持在较高水平,表明转录关闭失败。谢等人(2008) 得出结论,ZBTB20 是阻断成人肝脏中 AFP 表达的关键调节因子。
萨瑟兰等人(2009)发现Zbtb20 -/- 小鼠以孟德尔频率出生,但它们表现出生长迟缓并伴有低血糖,并且全部在12周龄时死亡。除海马体外的所有组织均显示正常。全面的血清化学分析显示严重的广泛代谢功能障碍,包括异常的葡萄糖稳态和激素反应。Zbtb20 -/- 小鼠在进食和禁食状态下均出现低血糖,并且几乎完全没有糖原储存。微阵列分析揭示了与生长、葡萄糖代谢和解毒有关的转录物表达的显着变化。Zbtb20在Zbtb20 -/- 小鼠肝脏中的重新表达不会导致生长或葡萄糖代谢的显着正常化,但与Zbtb20 -/- 小鼠相比,它显着延长了寿命。萨瑟兰等人(2009) 得出结论,Zbtb20 -/- 小鼠的表型是由肝脏依赖性和肝脏非依赖性缺陷引起的。
▼ 等位基因变异体(8 个精选示例):
.0001 报春花综合症
ZBTB20,HIS596ARG
Cordeddu 等人在一名患有樱草花综合征(PRIMS; 259050) 的 8 岁女孩中(2014) 鉴定了 ZBTB20 基因外显子 3 中从头 c.1787A-G 转变的杂合性,导致位于第一个锌指的高度保守残基处发生 his596-arg(H596R) 取代,该残基协调Zn(2+) 离子。HEK293T 细胞中的瞬时转染实验显示突变体的核定位,尽管观察到表明蛋白质聚集的独特的非均匀分布模式。用 CSK 缓冲液处理表明,与野生型蛋白相比,H596R 突变体与染色质的相互作用松散。DNA 结合测定表明 H596R 突变体的 DNA 结合显着降低,这与抑制报告基因转录的能力显着降低相关。在共表达野生型蛋白和 H596R 突变体的细胞中还观察到 DNA 结合的 ZBTB20 水平降低和 AFP 启动子抑制效率较低,这与突变体对野生型等位基因的显性负效应一致。
.0002 报春花综合症
ZBTB20,LEU621PHE
Cordeddu 等人最初由 Carvalho 和 Speck-Martins(2011) 报道,一名 26 岁男性患有樱草花综合征(PRIMS; 259050)(2014) 鉴定了 ZBTB20 基因外显子 4 中从头 c.1861C-T 转变的杂合性,导致第二锌指中高度保守的残基处 leu621 到 phe(L621F) 取代。转染的 HEK293T 细胞中的检测表明,L621F 突变体的 DNA 结合显着降低,这与抑制报告基因转录的能力显着降低相关。在共表达野生型蛋白和 L621F 突变体的细胞中还观察到 DNA 结合的 ZBTB20 水平降低和 AFP 启动子抑制效率较低,这与突变体对野生型等位基因的显性负效应一致。
.0003 报春花综合症
ZBTB20, LYS590GLN
一名 31 岁男性患有樱草花综合征(PRIMS; 259050),最初由 Posmyk 等人报道(2011),Cordeddu 等人(2014) 鉴定了 ZBTB20 基因外显子 3 中从头 c.1768A-C 颠换的杂合性,导致第一个锌指中高度保守的残基处发生 lys590 至 gln(K590Q) 取代。HEK293T 细胞中的瞬时转染实验显示突变体的核定位,尽管观察到表明蛋白质聚集的独特的非均匀分布模式。用 CSK 缓冲液处理表明,与野生型蛋白相比,K590Q 突变体与染色质的相互作用松散。DNA 结合测定表明 K590Q 突变体的 DNA 结合显着降低,这与抑制报告基因转录的能力显着降低相关。在共表达野生型蛋白和 K590Q 突变体的细胞中还观察到 DNA 结合的 ZBTB20 水平降低和 AFP 启动子抑制效率较低,这与突变体对野生型等位基因的显性负效应一致。
.0004 报春花综合症
ZBTB20,GLY602ALA
Cordeddu 等人在一名患有樱草花综合征(PRIMS; 259050) 的 43 岁男性中(2014) 鉴定了 ZBTB20 基因外显子 4 中从头 c.1805G-C 颠换的杂合性,导致第一个和第二个锌指之间的接头中高度保守的残基处发生 gly602-to-ala(G602A) 取代主题。转染的 HEK293T 细胞中的检测表明,G602A 突变体的 DNA 结合显着降低,这与抑制报告基因转录的能力显着降低相关。在共表达野生型蛋白和 G602A 突变体的细胞中还观察到 DNA 结合的 ZBTB20 水平降低和 AFP 启动子抑制效率较低,这与突变体对野生型等位基因的显性负效应一致。
.0005 报春花综合症
ZBTB20、SER616PHE 和 GLY741ARG
Mattioli 等人对一名患有樱草花综合征(PRIMS; 259050) 的 4 岁男孩进行了研究(2016) 鉴定了位于 ZBTB20 基因相同等位基因上的 2 个从头错义突变的杂合性:c.1847C-T(c.1847C-T, NM_001164342.1) 和 c.2221G-A(c.2221G-A, NM_001164342.1) 在最后一个编码外显子中转换,分别导致 C2H2 锌指结构域内高度保守的残基处的 ser616 到 phe(S616F) 和 gly741 到 arg(G741R) 取代。他未受影响的父母中不存在这两种突变,等位基因特异性扩增证实这些突变是顺式的。
.0006 报春花综合症
ZBTB20,HIS600GLN
Grimsdottir 等人对一名患有樱草花综合征(PRIMS; 259050) 的 14 岁男孩进行了研究(2019) 鉴定了 ZBTB20 基因外显子 4 中从头 c.1800C-G 颠换(c.1800C-G, NM_001164342.1) 的杂合性,导致高度保守的 his600 到 gln(H600Q) 取代锌指结构域中的残基被认为对于蛋白质稳定至关重要。该突变经全外显子组测序鉴定并经桑格测序证实,在他的父母、健康同胞或 gnomAD 数据库中均不存在。
.0007 报春花综合症
ZBTB20,1-BP DEL,1024C
Stellacci 等人对一名患有樱草花综合征(PRIMS; 259050) 的 8 岁男孩(患者 1)进行了研究(2018) 在 ZBTB20 基因的外显子 4 中发现了一个从头杂合的 1-bp 缺失(c.1024delC, NM_001164342.2),预计会导致移码和提前终止(Gln342SerfsTer42),突变蛋白缺乏整个 C -末端ZNF结构域并且具有破坏的DNA结合能力。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,
.0008 报春花综合症
ZBTB20,THR644ILE
Stellacci 等人对一名患有樱草花综合征(PRIMS; 259050) 的 3 岁女孩(患者 2)进行了研究(2018) 在 ZBTB20 基因的外显子 5 中鉴定出从头杂合的 c.1931C-T 转换(c.1931C-T,NM_001164342.2),导致高度保守残基处的 thr644 到 ile(T644I) 取代在第三个 ZNF 主题中。该突变是通过三重外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。功能数据表明,该突变会损害与 DNA 的正确结合,并产生显性失活效应。