具有 1 型血小板反应蛋白基序的解整合素样金属蛋白酶,16; ADAMTS16
HGNC 批准的基因符号:ADAMTS16
细胞遗传学位置:5p15.32 基因组坐标(GRCh38):5:5,140,330-5,320,304(来自 NCBI)
▼ 说明
ADAMTS16 是锌依赖性蛋白酶 ADAMTS 大家族的成员。有关 ADAMTS 基因家族的一般描述,请参见 ADAMTS1(605174)。
▼ 克隆与表达
Cal 等人利用与 ADAMTS 蛋白金属蛋白酶结构域的同源性(2002) 在基因组数据库中鉴定出 ADAMTS16。他们通过PCR和胎儿组织cDNA文库的5-prime和3-prime RACE获得了全长克隆。推导的蛋白质包含一个N端信号肽,后面是一个前肽;包含 Zn 结合基序的金属蛋白酶催化结构域;解整合素样结构域;中央血小板反应蛋白 I(THBS1; 188060) 样基序;富含半胱氨酸的结构域;间隔区;和 3 个 C 端 THBS1 重复。它还具有 7 个 N-糖基化位点。ADAMTS16 与 ADAMTS18(607512) 具有 57% 的序列同一性,其中催化结构域内具有 85% 的同一性。PCR分析显示ADAMTS16在胎儿肺和肾以及成人前列腺和卵巢中表达。
乔等人(2009) 分离了大鼠 Adamts16,它编码 1,221 个氨基酸的蛋白质,他们在大鼠肾脏以及胸腺、肺、心脏、肝脏和脾脏中检测到了显着的表达。他们指出,人类 ADAMTS16 蛋白含有 1,224 个氨基酸。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Cal 等人(2002) 将 ADAMTS16 基因定位到染色体 5p15。
▼ 分子遗传学
乔等人(2009) 对来自魁北克家庭研究的 945 名法裔加拿大人的 12 个已知 ADAMTS16 SNP 进行了基因分型,并鉴定了 3 个 SNP,包括与人类静息收缩压(SBP) 和舒张压相关的 ala90-to-pro 变体(rs2086310)。舒张压)。GenNet 研究参与者的复制证实了 rs2086310 与 1,465 名白人中的 SBP 相关,并确定了 rs2964433 与白人中的 SBP 以及 725 名西班牙裔中的 SBP 和 DBP 相关。乔等人(2009)提出Adamts16是控制血压的候选基因。
▼ 动物模型
乔等人(2009) 进行了精细定位,以确定 1 号染色体上的大鼠 BPQTL2 基因座,并将其分离到包含 Adamts16 基因的 805 kb 同源片段。肾转录组分析表明,同系大鼠和达尔盐敏感大鼠之间与血压相关的基因网络存在差异。这些基因在有或没有 RNAi 敲除 Adamts16 的肾细胞系之间也存在差异表达。