支架蛋白 依恋因子 B; SAFB

SAFB1
HSP27 雌激素反应元件和 TATA 框结合蛋白；HET

HGNC 批准的基因符号：SAFB

细胞遗传学定位：19p13.3 基因组坐标（GRCh38）：19:5,623,083-5,668,478（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

真核染色质以更高阶的结构组织，由数千个离散的、拓扑约束的环结构域组成。这些环的基部固定在由蛋白质和 RNA 组成的网络上，通常称为核基质或支架。有证据表明，染色质与核支架的紧密结合不仅对于染色质纤维的压缩很重要，而且还涉及核酸代谢的许多方面。染色质与核支架的附着似乎是通过称为支架附着区（SAR） 的特殊 DNA 元件发生的。罗米格等人（1992） 鉴定了 4 种核蛋白，称为支架附着因子（SAF） A（602869）、B、C 和 D，它们与 SAR DNA 元件特异性相互作用。Renz 和 Fackelmayer（1996） 从 HeLa 细胞核提取物中纯化了 SAFB 蛋白。通过 SDS-PAGE 检测，SAFB 是一种分子量为 150 kD 的单体。它是一种 DNA 结合蛋白，对 SAR DNA 元件具有高度特异性。生化分级分离研究表明，SAFB 是染色质的组成部分，但不是核基质的组成部分。通过使用抗纯化 SAFB 的抗体筛选人 HeLa 细胞 cDNA 表达文库，Renz 和 Fackelmayer（1996） 分离出了编码 SAFB 的部分 cDNA。Northern 印迹分析在所有检查的人体组织中检测到 3.4 kb SAFB 转录物。

热休克蛋白 27（HSP27; 602195） 是一种雌激素调节蛋白，可增强乳腺癌的增殖和耐药性。其启动子区域包含一个不完善的雌激素反应元件和一个 TATA 框。奥斯特赖希等人（1997） 在凝胶阻滞测定中将 HET 鉴定为 HSP27 启动子结合蛋白。他们通过筛选具有HSP27启动子区域的人乳腺癌细胞（MCF-7）cDNA表达文库，克隆了部分HET cDNA。作者利用该部分 cDNA 筛选第二个 MCF-7 cDNA 文库，孤立出全长 HET cDNA。奥斯特赖希等人（1997）指出HET基因可能与Renz和Fackelmayer（1996）研究的SAFB基因相同。预测的 915 个氨基酸的 HET 蛋白（GenBank 2828537） 带高电荷，有 221 个带负电荷的残基和 164 个带正电荷的残基，并包含几个潜在的磷酸化、糖基化和肉豆蔻酰化位点。通过 MCF-7 提取物的 SDS-PAGE 和 Southwestern blot 分析，HET 的分子量为 120 kD，高于其计算质量 100 kD。奥斯特赖希等人（1997） 表明 HET 蛋白定位于各种乳腺癌细胞系的核基质，这一结果与 Renz 和 Fackelmayer（1996） 的定位研究不一致。

▼ 基因功能

奥斯特赖希等人（1997） 发现 HET 的过度表达降低了各种乳腺癌细胞系中 HSP27 启动子的活性。

Hammerich-Hille 等人使用芯片上染色质免疫沉淀（ChIP） 和基因表达阵列对 MCF7 人乳腺癌细胞进行分析（2010） 在已知基因的启动子中鉴定出 541 个 SAFB1 和/或 SAFB2（608066） 结合位点。在含有组蛋白基因簇的 1 号和 6 号染色体区域观察到结合位点富集。基因表达阵列分析显示，通过小干扰 RNA 敲低 SAFB1 或 SAFB2 后，大多数靶基因上调。总体而言，SAFB2 调控的基因比 SAFB1 少，并且 SAFB1 和 SAFB2 调控的基因重叠相对较少。在SAFB1调控的所有基因中，38%涉及免疫调节，28%涉及细胞信号传导，11%涉及细胞凋亡。SAFB1 敲低导致 C8ORF4（607702） 和 GABBR1（603540） 的表达增加约 11 倍。

▼ 测绘

杜邦等人使用体细胞杂交分析和荧光原位杂交（1997） 将 SAFB 基因定位到 19p13.3-p13.2。