四三肽重复结构域蛋白 3; TTC3
唐氏综合症区域的四三肽重复结构域;TPRD
DCRR1
HGNC 批准的基因符号:TTC3
细胞遗传学位置:21q22.13 基因组坐标(GRCh38):21:37,073,254-37,203,118(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
21 号染色体上的唐氏综合症(DS; 190685) 区域负责 DS 的主要特征,已通过对部分 21 三体性 DS 患者的分析来定义。在 DS 区域内,Ohira 等人(1996) 在 21q22.2 上构建了 1.6-Mb P1 重叠群图谱,并使用这些 P1 克隆和人胎脑 cDNA 文库进行 cDNA 文库筛选和外显子捕获。他们获得了 67 个 cDNA 片段和 52 个可能的外显子。其中,通过 P1 克隆定位和 Northern 分析,从单个基因衍生出 23 个 cDNA 片段和 4 个外显子。为了获得全长 cDNA 序列,从另一个富含更长 cDNA 种类的人类 cDNA 文库中进一步筛选更长的 cDNA 克隆。这些克隆被组装成 9,045 bp 的序列。该 cDNA 编码包含 3 个四肽重复(TPR) 基序(氨基酸残基 231-264、265-298 和 299-332)的 2,025 个氨基酸的蛋白质。作者将基因 TPRD 符号化为唐氏综合症区域包含 TPR 基序的基因。TPR 结构域存在于蛋白磷酸酶和其他参与 RNA 合成或有丝分裂调节的蛋白中。
孤立地,冢原等人(1996) 通过外显子捕获从唐氏综合症关键区域鉴定并克隆了 9,078 bp 的 cDNA,他们将其命名为 TPRDI。该 cDNA 编码 2,025 个氨基酸残基的推定蛋白(TPRDI)。还分离出两种异构体:TPRDII(8,992 bp) 和 TPRDIII(7,416 bp)。TPRDII 可能是 TPRD 基因转录本的替代剪接产物,编码 2 个大的开放解读码组,分别包含 200 和 1,792 个氨基酸残基。TPRDIII 可能是通过从 TPRD 基因的另一个起始位点转录产生的,编码一个由 1,715 个氨基酸残基组成的假定蛋白质。Northern 印迹分析显示,TPRDI 及其亚型存在于 7 至 17 天的小鼠胚胎以及所有检查的人类成人和胎儿组织中。TPRDI 具有 3 个 34 个氨基酸 TPR 基序单元,可能介导与各种蛋白质的相互作用。TPRDII 编码的较大开放解读码组也有 3 个 TPR 基序单元,但 TPRDIII 只有三分之二的该基序单元。因此,TPRD基因可能属于TPR基因家族。TPRD 的近中央和 C 末端区域与几种基质蛋白(如毛透明蛋白和大疱性类天疱疮抗原)表现出一定的同源性。作者推测 TPRD 基因的过度表达可能会导致唐氏综合症中观察到的几种形态异常。
通过EST数据库分析,筛选海马cDNA文库,以及5-prime和3-prime RACE,Eki等人(1997) 克隆了 TTC3,他们将其称为 DCRR1。推导的蛋白质含有1,941个氨基酸,计算分子量为220.2 kD。N 端结构域与多种蛋白磷酸酶具有相似性,C 端区域与肌球蛋白重链(参见 160730)或参与微管和细胞骨架动力学的蛋白质(包括 CENPE(117143))具有相似性。DCRR1 包含细胞色素 c 家族(参见 516030)血红素结合基序、Profilin(参见 176610)特征序列、跨膜结构域、N-糖基化、磷酸化和糖胺聚糖附着位点以及 3 个核定位信号。Northern 印迹分析在多个组织中检测到 7.9-和 9.0-kb 转录物,包括脾脏、胸腺、前列腺和卵巢。睾丸仅表达 7.9 kb 转录物,在胎盘、肺和肝脏中未检测到表达。
▼ 测绘
TTC3 基因定位于染色体 21q22.2(Ohira 等人,1996)。