微管相关蛋白,RP/EB 家族,成员 3; MAPRE3
腺瘤性息肉病大肠杆菌结合蛋白 EB3;EB3
APC 结合蛋白 RP3;RP3
EB1 家庭,成员 3;EBF3
HGNC 批准的基因符号:MAPRE3
细胞遗传学位置:2p23.3 基因组坐标(GRCh38):2:26,970,637-27,027,219(来自 NCBI)
▼ 说明
EB1 家族蛋白,例如 MAPRE3,与间期细胞中的细胞质微管、有丝分裂纺锤体以及腺瘤性息肉病大肠杆菌(APC; 611731) 肿瘤抑制基因相互作用(Nakakawa 等人总结,2000)。
▼ 克隆与表达
Nakakawa 等人使用酵母 2-杂交筛选,以 APC 样(APCL) 的 C 末端作为诱饵(2000) 分离出编码 MAPRE3 的 cDNA,他们将其命名为 EB3。预测的 282 个氨基酸蛋白与 MAPRE1(603108) 具有 54% 的相同性。Northern 印迹分析显示 2.2 kb 转录物主要在大脑和肌肉中表达。GST Pull-down 分析确定 APC 和 APCL C 末端的同源区域与 MAPRE3 结合。免疫荧光和共聚焦显微镜证明 MAPRE3 定位于微管网络中,并与 APCL 共定位于核周和微管网络中。
Su和Qi(2001)通过EST数据库检索、RT-PCR和筛选胎儿脑cDNA文库,孤立出编码与Nakakawa等人报道的EB3蛋白相同的蛋白的cDNA(2000),他们将其称为 EBF3,以及编码 266 个氨基酸蛋白质的替代转录物。RT-PCR 和蛋白质印迹分析表明这两种转录物都普遍表达。
▼ 基因结构
Nakakawa 等人使用基因组序列分析(2000) 表明最有可能存在 3 个 MAPRE 基因: MAPRE1 编码 EB1;MAPRE2(605789) 编码 RP1 和 EB2 片段;MAPRE3编码EBF3和片段RP3。MAPRE3 与 MAPRE1 和 MAPRE2 一样,包含 7 个外显子,但由于内含子相对较短,MAPRE3 的编码区仅跨度 4.2 kb。蛋白质印迹分析检测到在大多数测试的细胞系中两种亚型的表达约为 32-kD 蛋白质。结合分析确定两种亚型均与 APC 相互作用。
▼ 测绘
作者:FISH,中川等人(2000) 将 MAPRE3 基因对应到 2p23.3-p23.1。使用辐射杂交分析,Su 和 Qi(2001) 将 MAPRE3 基因定位到 2p23.3-p23.2,它与酮己糖激酶基因(KHK; 614058) 紧密相连且邻近。