OTOANCORIN; OTOA

HGNC 批准的基因符号:OTOA

细胞遗传学定位:16p12.2 基因组坐标(GRCh38):16:21,663,968-21,760,729(来自 NCBI)

▼ 说明

OTOA 基因编码 otoancorin,它属于哺乳动物内耳非细胞凝胶的一组非胶原糖蛋白。例子包括 α-tectorin(602574)、β-tectorin(602653) 和 otogelin(OTOG; 604487),所有这些都是内耳独有的(Zwaenepoel 等,2002)。

▼ 克隆与表达

兹瓦内普尔等人(2002) 报道了第一个蛋白质的例子,耳锚蛋白(OTOA),专门位于感觉上皮的顶端表面与其上覆的非细胞凝胶之间的界面,并且对内耳也完全具有特异性。通过搜索从小鼠前庭器感觉上皮制备的消减cDNA文库,然后搜索序列数据库,他们获得了编码小鼠和人OTOA的cDNA。预测的 1,153 个氨基酸的人类蛋白质与小鼠蛋白质有 77% 的相同性。小鼠 Otoa 具有信号肽、11 个潜在的 N-糖基化位点以及 GPI 连接膜结合蛋白的 C 端序列特征。RT-PCR 分析检测到小鼠 Otoa 仅在内耳中表达。

▼ 基因结构

Zwaenepoel 等人通过使用基因预测程序进行序列分析(2002) 确定 OTOA 基因有 28 个外显子,跨度约为 82 kb。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Zwaenepoel 等人(2002) 将 OTOA 基因定位在染色体 16p12.2 上标记 D16S3046 和 D16S412 之间。

▼ 分子遗传学

由于小鼠 Otoa 基因仅在内耳中表达,Zwaenepoel 等人(2002)认为人类基因是孤立性耳聋的一个有吸引力的候选基因。他们搜索了 200 个受影响的大家庭,以确定其中的耳聋基因座是否对应到 16p12.2。在一个近亲巴勒斯坦家庭中,中度至重度语前感音神经性隐性耳聋与染色体 16p13.1-q11.2 上的一个名为 DFNB22(607039) 的基因座分离。兹瓦内普尔等人(2002) 在该家族 1 名受影响的孩子中,在纯合状态下的 OTOA 基因(607038.0001) 的外显子 12/内含子 12 连接处发现了 T 到 C 的转变。发现这种突变与该亲属的听力障碍共分离,并且在约旦人、黎巴嫩人、巴勒斯坦人、

Shahin 等人在患有常染色体隐性遗传性语前耳聋的巴勒斯坦近亲家庭受影响的同胞中(2010) 鉴定了一个纯合的 500-kb 缺失,导致 OTOA 基因完全缺失(607038.0002)。该缺失的两侧是染色体 16q 的片段重复,表明非等位同源重组是其机制。在 288 个不相关的巴勒斯坦对照中,有 3 个(1.0%) 在杂合状态下观察到了该缺失。

在 3 个患有 DFNB22 的巴基斯坦近亲家庭的受影响成员中,Lee 等人(2013) 鉴定了 OTOA 基因中的 2 个不同的纯合错义突变(G451D,607038.0003 和 P627S,608038.0004)。尚未对这些变体进行功能研究,但预计这两种突变都会中断 OTOA 的超螺旋结构,这将导致 Otoancorin 无法稳定内耳感觉毛细胞顶部的盖层成员。患者在语前出现严重至极重度听力损失,影响所有频率。

▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):

.0001 耳聋,常染色体隐性遗传 22
OTOA,IVS12DS,TC,+2

在一个巴勒斯坦近亲大家庭中,Zwaenepoel 等人(2002) 发现中度至重度舌前感音神经性隐性耳聋(DFNB22; 607039) 因 OTOA 基因突变而分离,即纯合状态下外显子 12/内含子 12 连接处的 T 到 C 转变。IVS12+2T-C突变影响供体剪接位点GT二核苷酸的不变T,预计会导致异常剪接,例如外显子12跳跃,导致72个氨基酸的框内缺失,或使用神秘的位点。

.0002 耳聋,常染色体隐性 22
OTOA,500-KB DEL

Shahin 等人在患有常染色体隐性遗传性语前耳聋(DFNB22; 607039) 的巴勒斯坦近亲家庭受影响的同胞中(2010) 鉴定了一个纯合的 500-kb 缺失,导致 OTOA 基因完全缺失。该缺失的两侧是染色体 16q 的片段重复,表明非等位同源重组是其机制。在 288 个不相关的巴勒斯坦对照中,有 3 个(1.0%) 在杂合状态下观察到了该缺失。

.0003 耳聋,常染色体隐性遗传 22
OTOA,GLY451ASP

在一个患有 DFNB22(607039) 的巴基斯坦大家族的 4 名成员中,Lee 等人(2013) 鉴定了 OTOA 基因中的纯合 c.1352G-A 转变,导致埋藏 α 螺旋片段内高度保守的残基处发生 gly451 至 asp(G451D) 取代。通过连锁分析和候选基因测序发现的突变在 670 条对照染色体中不存在。尚未对该变体进行功能研究,但预计该突变会破坏 OTOA 的超螺旋结构。患者在语前出现严重至极重度听力损失,影响所有频率。

.0004 耳聋,常染色体隐性遗传 22
OTOA,PRO627SER

Lee 等人在来自 2 个无关近亲巴基斯坦家庭的 4 名 DFNB22 患者(607039) 中(2013) 鉴定了 OTOA 基因中的纯合 c.1879C-T 转变,导致暴露卷曲区域内高度保守的残基处发生 pro627 到 Ser(P627S) 取代,作为结构域接头。通过连锁分析和候选基因测序发现的突变在 670 条对照染色体中不存在。尚未对该变体进行功能研究,但预计该突变会破坏 OTOA 的超螺旋结构。患者在语前出现严重至极重度听力损失,影响所有频率。