腺苷脱氨酶,tRNA 特异性,3; ADAT3

  • TAD3,酿酒酵母,同源物;TAD3

HGNC 批准的基因符号:ADAT3

细胞遗传学位置:19p13.3 基因组坐标(GRCh38):19:1,905,399-1,913,447(来自 NCBI)

▼ 说明

ADAT3 属于通过 tRNA 上基因组编码的腺苷水解脱氨基形成肌苷的酶家族(Gerber 和 Keller,1999)。肌苷出现在 tRNA 反密码子的摆动位置,可以翻译以尿嘧啶、胞嘧啶或腺嘌呤结尾的密码子。

▼ 克隆与表达

Gerber 和 Keller(1999) 克隆了酿酒酵母 Tad3。推导的 322 个氨基酸的蛋白质包含一个中央核定位信号,后面是一个脱氨酶结构域,其中有 3 个参与锌配位的保守残基(组氨酸和 2 个胞嘧啶),以及脱氨酶基序 II 中的一个脯氨酸,预计与腺苷。

▼ 基因功能

Gerber 和 Keller(1999) 发现 Tad3 和 Tad2(ADAT2; 615388) 都是酵母活力所必需的。Tad3 和 Tad2 形成异二聚体,这是合成 tRNA(ala) 中腺苷 34 转化为肌苷 34 所必需的。Tad2 似乎是脱氨酶的催化亚基。

▼ 测绘

Hartz(2013) 根据 ADAT3 序列(GenBank BC011824) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 ADAT3 基因对应到染色体 19p13.3。

▼ 分子遗传学

Alazami 等人在 8 个患有神经发育障碍、大脑异常、生长不良和面容畸形的阿拉伯近亲家庭的受影响成员中(NEDBGF; 615286)(2013) 鉴定出 ADAT3 基因中的纯合错义突变(V128M; 615302.0001)。分子模型表明,突变发生在从蛋白质表面突出的钩子中,并且会破坏该突出物。该突变是通过纯合性作图和外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,在所有家族中都与该疾病分离,并且在几个大型对照外显子组数据库或 580 个种族匹配的等位基因中没有发现。单倍型分析表明存在创始人效应,估计发生在 65 至 111 代之前。

在 11 个明显与 NEDBGF 无关的阿拉伯家庭的 15 名受影响成员中,El-Hattab 等人(2016) 鉴定了 Alazami 等人先前鉴定的相同 ADAT3 V128M 创建者突变的纯合性(2013)。埃尔-哈塔布等人(2016) 指出,除了 1 个具有这种突变的家族外,所有家族都来自沙特阿拉伯。

一名 6 岁伊朗女孩,由近亲父母所生,与 NEDBGF、Salehi Chaleshtori 等人合作(2018) 鉴定了 ADAT3 基因(615302.0002) 中 8 bp 重复的纯合性,该重复与该家族的表型分离。ExAC、1000 基因组计划或 EVS 数据库中未发现该突变。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):

.0001 神经发育障碍,伴有大脑异常、生长不良和面部畸形
ADAT3、VAL128MET

在 8 个阿拉伯近亲家庭的受影响成员中,患有神经发育障碍,伴有大脑异常、生长不良和面容畸形(NEDBGF; 615286) Alazami 等人(2013) 鉴定出 ADAT3 基因中的纯合 c.382G-A 转变,导致高度保守残基处的 val128 到met(V128M) 取代。分子模型表明,突变发生在从蛋白质表面突出的钩子中,并且会破坏该突出物。该突变是通过纯合性作图和外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,在所有家族中都与该疾病分离,并且在几个大型对照外显子组数据库或 580 个种族匹配的等位基因中没有发现。单倍型分析表明存在创始人效应,估计发生在 65 至 111 代之前。大多数患者还患有内斜视和发育迟缓;核磁共振检查显示,一些人患有小头畸形和轻度脑畸形。

在 11 个明显与 NEDBGF 无关的阿拉伯家庭的 15 名受影响成员中,El-Hattab 等人(2016) 鉴定出 ADAT3 基因中相同 V128M 创建者突变的纯合性。埃尔-哈塔布等人(2016) 指出,除了 1 个具有这种突变的家族外,所有家族都来自沙特阿拉伯。

沙基亚等人(2019) 在 2 个兄弟姐妹中发现了纯合 V128M 突变,这些兄弟姐妹都是阿拉伯近亲父母所生,患有 NEDBGF。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

.0002 神经发育障碍,伴有大脑异常、生长不良和面部畸形
ADAT3、8-BP DUP、NT99

Salehi Chaleshtori 等人通过对一名 6 岁女孩进行靶向测序,该女孩由伊朗近亲父母所生,患有神经发育障碍,伴有大脑异常、生长不良和面容畸形(NEDBGF; 615286)(2018) 鉴定出 ADAT3 基因中 8 bp 重复(c.99_106dupGAGCCCGG) 的纯合性,导致预计会导致提前终止的移码(Glu36GlyfsTer44)。ExAC、1000 基因组计划或 EVS 数据库中未发现该突变。