PR 结构域蛋白 4; PRDM4
- PFM1
HGNC 批准的基因符号:PRDM4
细胞遗传学位置:12q23.3 基因组坐标(GRCh38):12:107,732,871-107,761,137(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
PR 结构域定义了参与细胞分化和肿瘤发生的转录因子家族。 该结构域首先被认为是 PRDI-BF1(PRDM1; 603423) 和 RIZ(PRDM2; 601196) 中的同源区域。 Yang和Huang(1999)以PRDM2的PR结构域为探针,通过EST数据库检索,鉴定出一种新的含有PR结构域的蛋白PRDM4,他们将其命名为PFM1。 PRDM4 编码推导的 796 个氨基酸的蛋白质,其中间部分有一个 PR 结构域,C 末端有 6 个锌指基序。 Northern 印迹分析在所有测试的组织中检测到大约 4.6 kb 的主要转录物,其中在卵巢和睾丸中水平最高。 另一种约 7.0 kb 的 mRNA 特异地存在于卵巢和睾丸中,另一种约 3.4 kb 的 mRNA 在外周血白细胞、结肠、卵巢、睾丸、前列腺和脾脏中以低水平存在。
▼ 生化特征
布里克纳罗娃等人(2011) 在人 PRDM4、PRDM6(616982)、PRDM7(609759)、PRDM9(609760)、PRDM11(616347) 和 PRDM11(616347) 中鉴定出约 20 个氨基酸的短锌指节基序(Cx2Cx7Cx2HGP,其中 x 是任何氨基酸) PRDM15(617692)。 锌指节基序位于 PR 结构域之前,而较长的 C2H2 样锌指位于 PR 结构域的 C 末端。 核磁共振波谱表明PRD4的PR锌指配位了锌。
▼ 基因功能
Yang 和 Huang(1999) 发现用 NGF(162030) 处理的 PC12 细胞中 PRDM4 mRNA 水平高度升高,表明 PRDM4 在 NGF 信号转导途径中发挥作用。
▼ 测绘
通过STS序列分析和体细胞杂交分析,Yang和Huang(1999)将PRDM4基因定位到染色体12q23-q24.1,该区域被认为含有肿瘤抑制基因。
Gross(2015) 根据 PRDM4 序列(GenBank AF144757) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 PRDM4 基因对应到染色体 12q23.3。