无名指蛋白180; RNF180
- 神经干细胞中的无名指蛋白; RINES
HGNC 批准的基因符号:RNF180
细胞遗传学位置:5q12.3 基因组坐标(GRCh38):5:64,165,351-64,372,869(来自 NCBI)
▼ 说明
RNF180 是一种内质网(ER) 蛋白,可作为泛素 E3 连接酶和与 E2 泛素结合酶 UBE2E1(602916) 相互作用的平台(Okawa 等人,2008)。
▼ 克隆与表达
小川等人(2008) 克隆了小鼠 Rnf180,他们将其称为 Rines,并通过数据库分析,他们在脊椎动物(包括人类)中鉴定了 Rines 的直系同源物。 推导的 591 个氨基酸的小鼠和人类蛋白在 N 末端附近包含一个双特异性蛋白磷酸酶结构域,随后是一个基本卷曲螺旋结构域、一个 C3HC4 型锌结合环指结构域、一个跨膜结构域和一个短链结构域。 C末端尾部。 Northern印迹分析检测到小鼠大脑中Rines表达最强,其次是肾脏、睾丸和子宫。 在肺和胸腺中检测到弱表达,但在其他检查组织中未检测到。 Rines 表达在胚胎第 10.5 天(E10.5) 时开始在发育中的小鼠中表达,在 E13.5 左右达到峰值,此后下降。 原位杂交显示 Rines 主要存在于 E13.5 至 E17.5 胚胎的侧脑室中。 在胚胎晶状体形成细胞、嗅球、第四脑室以及丘脑中也检测到了表达。 表位标记的 Rines 定位于转染细胞的 ER,N 末端面向细胞质。
▼ 基因功能
Okawa 等人使用酵母 2-杂交、蛋白质下拉和免疫沉淀分析(2008) 发现小鼠 Rines 与 Zic2(603073)(一种核锌指蛋白)相互作用。 Rines 还与 Ubch6(UBE2E1)(一种 E2 泛素结合酶)发生特异性相互作用。 Rines 和 Ubch6 在哺乳动物细胞系中的共表达导致 Zic2 泛素化和蛋白酶体降解。 Rines 本身也被泛素化且不稳定。
张等人(2012) 发现高甲基化使胃肿瘤和细胞系中的 RNF180 基因沉默,但在结肠癌或肝癌中则不然。 在胃癌患者的血浆中也检测到了沉默的 RNF180 DNA(参见 613659)。 RNF180 在 AGS 胃癌细胞系中的重新表达抑制 AGS 集落形成并诱导细胞凋亡。
▼ 基因结构
张等人(2012) 发现 RNF180 启动子和转录起始位点位于 CpG 岛内。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Cheung 等人(2012) 将 RNF180 基因对应到 11 号染色体。然而,Hartz(2014) 根据 RNF180 序列(GenBank AK090756) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 RNF180 基因对应到染色体 5q12.3。