含有三联基序的蛋白质 23;TRIM23

  • ADP-核糖化因子结构域蛋白 1; ARFD1; ARD1
  • ARF 结构域蛋白 1

HGNC 批准的基因符号:TRIM23

细胞遗传学位置:5q12.3 基因组坐标(GRCh38):5:65,589,690-65,624,333(来自 NCBI)

▼ 说明

TRIM23 属于 GTPases 的 ADP-核糖基化因子(ARF) 家族,包含 N 端 GTP 酶激活蛋白(GAP) 结构域和 C 端 ARF 结构域(Vitale 等,2000)。

▼ 克隆与表达

三岛等人(1993) 从人类和大鼠 cDNA 文库中分离出一种称为 ARD1 的基因。 ARD1 编码假定的 64 kD 蛋白质,该蛋白质在羧基末端包含 18 kD ADP 核糖基化因子结构域,并且比之前鉴定的其他单体鸟嘌呤核苷酸结合 ARF 蛋白质大得多。

▼ 基因功能

维塔莱等人(2000) 在人肝脏 cDNA 文库的酵母 2-杂交筛选中发现 cytohesin-1(PSCD1; 182115) 与 ARD1 相互作用。 ARD1-GDP 与 cytohesin-1 相互作用良好,但与 cytohesin-2(PSCD2; 602488) 相互作用较差,并且 cytohesin-1 加速不可水解的 GTP 类似物与 ARD1 的结合。 突变分析表明ARD1的ARF结构域的效应区与cytohesin-1的Sec7结构域相互作用。 这些结构域之间的物理关联高度依赖于实验条件,有利于 ARD1 核苷酸释放和无核苷酸 ARD1 形式积累的游离 Mg(2+) 浓度也有利于 ARD1 和 cytohesin-1 之间的相互作用。 在转染的COS-7细胞中,与囊泡结构相关的ARD1集中在细胞核周围并分散在整个细胞质中,分别对应于高尔基体和溶酶体。 ARD1 的组成型 GDP 结合形式显示出类似的分布,而 ARD1 的组成型 GTP 结合形式仅以类高尔基体分布集中在细胞核附近。 Cytohesin-1 分布在整个细胞中,也存在于细胞核中。 当 ARD1 或其 GDP 和 GTP 结合形式与 cytohesin-1 共表达时,只有 GDP 结合形式显示出与 cytohesin-1 的分布或共定位的任何变化。 在 90% 共表达这些蛋白质的细胞中,ARD1 的 GDP 结合形式分布在除细胞核外的整个细胞中,并且大部分与 cytohesin-1 共定位。 在不到 10% 的共表达蛋白质的细胞中,GDP 结合形式的 ARD1 和 cytohesin-1 共定位于溶酶体中。

▼ 测绘

Gross(2014) 根据 TRIM23 序列(GenBank AF230397) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 TRIM23 基因对应到染色体 5q12.3。