真核翻译起始因子 5B; EIF5B

  • 翻译起始因子 IF2; IF2

HGNC 批准的基因符号:EIF5B

细胞遗传学位置:2q11.2 基因组坐标(GRCh38):2:99,337,389-99,401,326(来自 NCBI)

▼ 正文

翻译起始需要将起始甲硫氨酸 tRNA 递送至 40S 核糖体亚基。 起始子蛋氨酸 tRNA 由异源三聚体复合物 EIF2(参见 603908)与 GTP 形成三元复合物来递送,GTP 与 40S 亚基相互作用。 然后生成的复合物与 mRNA 结合并扫描 AUG 起始密码子。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过筛选大脑 cDNA 文库中编码大于 50 kD 的蛋白质的 cDNA(1998)分离出编码 IF2 的 cDNA,他们将其称为 KIAA0741。 他们确定这个 1,220 个氨基酸的蛋白质与假定的 GTP 结合蛋白(GenBank AJ006412) 100% 相同。 RT-PCR 分析检测到 KIAA0741 在除脾脏之外的所有测试组织中表达,其中脑中水平最高,其次是心脏和睾丸。

Lee等人通过以酵母IF2蛋白为探针搜索EST数据库,然后筛选睾丸cDNA文库(1999)分离出编码人IF2的cDNA。 序列分析预测,1,220 个氨基酸的人 IF2 蛋白与酵母蛋白有 44% 的同一性,包含 3 个 GTP 结合蛋白特征的基序,并具有长的 N 端聚谷氨酸和聚赖氨酸延伸。 人类 IF2 的 GTP 结合域与酵母和古细菌 IF2 蛋白的 GTP 结合域分别具有 70% 和 54% 的同一性。 Northern 印迹分析显示 4.5 kb IF2 转录物广泛表达,在睾丸和骨骼肌中表达水平最高。 免疫印迹分析显示 175 kD 蛋白质的表达。 功能分析确定人IF2可以替代酵母IF2。 突变分析表明完整的 GTP 结合域是翻译促进所必需的。 李等人(1999) 提出 IF2 指导 met-tRNA 与核糖体 P 位点的结合。

Wilson 等人使用酵母 2 杂交筛选 T 细胞 cDNA 文库,并以人类免疫缺陷病毒 1(HIV-1) 基质蛋白为诱饵,然后筛选 HeLa 细胞 cDNA 文库(1999)分离出编码IF2的cDNA。 免疫沉淀和结合分析表明,IF2 的 C 端一半与酵母 IF2 的 C 端有 53% 相同,可与 HIV-1 基质蛋白相互作用。

▼ 基因功能

王等人(2019) 在纯化酵母(酿酒酵母)翻译系统中使用体外单分子荧光显微镜方法来直接实时监测晚期翻译起始和延伸过渡的途径。 该真核系统中的这种转变比报道的大肠杆菌中的转变要慢。 缓慢进入延伸是由单个核糖体亚基连接后 eIF5B 在 80S 核糖体上的较长停留时间定义的,这一过程是由这种普遍保守的起始因子催化的。 连接核糖体亚基后,抑制 eIF5B 的 GTP 酶活性可阻止 eIF5B 从 80S 复合物解离,从而阻止延伸。 王等人(2019) 得出的结论是,他们的研究结果说明了 eIF5B 的解离如何充当从起始到延伸转变的动力学检查点,以及其释放如何受到触发 GTP 水解的核糖体复合物构象变化的控制。

▼ 测绘

长濑等人(1998) 指出 EIF5B 基因(他们将其命名为 KIAA0741)对应到 2 号染色体。