泛素结合酶 E2 W; UBE2W
- 泛素结合酶 2W
- UBC16,拟南芥,同源物; UBC16
HGNC 批准的基因符号:UBE2W
细胞遗传学位置:8q21.11 基因组坐标(GRCh38):8:73,780,096-73,878,862(来自 NCBI)
▼ 说明
泛素化是一种常见的翻译后修饰,在许多细胞途径和蛋白质降解中发挥作用。 泛素与底物蛋白的缀合需要 E1 泛素激活酶(例如,UBE1;314370)、E2 泛素缀合酶(例如,UBE2A;312180)和 E3 泛素蛋白连接酶(例如,UBE3A;601623)。 UBE2W 是一种 E2 泛素结合酶(Zhang 等人总结,2011)。
▼ 克隆与表达
Yin 等人通过对从人胎脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2006)克隆了UBE2W,他们将其称为UBC16。 推导的 162 个氨基酸蛋白具有大约 150 个氨基酸的催化核心,称为 E2 泛素结合酶(UBC) 结构域,其 C 末端包含 2 个核定位信号。 人类 UBC16 与拟南芥 Ubc16 具有 51% 的氨基酸同一性。 RT-PCR 检测到 UBC16 普遍存在,在心脏、大脑、肝脏和胰腺中表达最高。 荧光标记的 UBC16 定位于转染的 HEK293 细胞的细胞核。
▼ 基因功能
通过突变分析,Yin 等人(2006)表明人UBC在转染的HEK293细胞中的核定位需要核定位信号和酶活性。
使用酵母 2-杂交分析,Zhang 等人(2011) 表明小鼠 Ube2w 与 Fancl(608111) 相互作用,Fancl(608111) 是一种参与 DNA 损伤修复的 E3 泛素连接酶。 他们通过蛋白质下拉和免疫共沉淀分析证实了相互作用。 Fancl显示在不存在Ube2w的情况下普遍存在的细胞内定位以及在存在Ube2w的情况下的核定位。 Ube2w形成核同二聚体。 Ube2w 在体外表现出泛素结合活性并单泛素化 Fancl 的 PHD 结构域。 Ube2w 的泛素化需要其泛素结合域内有一个保守的活性位点半胱氨酸。 Ube2w 还单泛素化 Fancd2(613984)。 人类细胞系中UBE2W的下调显着减少了由紫外线照射引起的FANCD2单泛素化,但不减少由DNA交联剂丝裂霉素C引起的FANCD2单泛素化或通常在S期发生的FANCD2单泛素化。
▼ 基因结构
尹等人(2006) 确定 UBE2W 基因包含 7 个外显子,跨度 8.6 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Yin 等人(2006) 将 UBE2W 基因定位到染色体 8q13-q21.1。