菱形域包含 1; RHBDD1

  • 菱形相关蛋白 4;RRP4
  • 菱形样蛋白 4;RHBDL4

HGNC 批准的基因符号:RHBDD1

细胞遗传学位置:2q36.3 基因组坐标(GRCh38):2:226,800,159-226,999,210(来自 NCBI)

▼ 说明

RHBDD1 属于膜内丝氨酸蛋白酶的菱形家族(Lemberg 和 Freeman,2007)。RHBDD1 定位于内质网(ER),并在具有不稳定跨膜螺旋的新生膜蛋白的 ER 相关降解中发挥作用(Fleig et al., 2012)。

▼ 克隆与表达

通过数据库分析,Lemberg 和 Freeman(2007) 鉴定出了人类 RHBDD1,他们将其称为 RHBDL4。RHBDL4 具有分泌酶 B 型酶的特征,具有 6 个跨膜结构域、胞质 N 和 C 末端,以及保守 GxSxxxF 基序内的催化丝氨酸。它还具有可能的线粒体靶向信号。在所有脊索动物基因组以及拟南芥和水稻中都检测到了 RHBDL4 的直系同源物。培养的哺乳动物细胞的免疫组织化学分析表明 RHBDL4 在分泌途径中发挥作用。弗莱格等人(2012) 表明推导的 315 个氨基酸的人 RHBDL4 蛋白在跨膜结构域 4 中具有催化基序 GFSG,在跨膜结构域 6 中具有活性位点 H。在 HEK293 细胞中,内源性和荧光标记的 RHBDL4 与 ER 标记共定位,而不是与线粒体共定位。

▼ 测绘

Hartz(2017) 根据 RHBDD1 序列(GenBank AL512717) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 RHBDD1 基因对应到染色体 2q36.3。

▼ 基因功能

Fleig 等人使用 HEK293T 细胞(2012) 发现衣霉素会引起 ER 应激并诱导未折叠蛋白反应,从而提高 RHBDL4 mRNA 和蛋白的表达。弗莱格等人(2012) 发现 RHBDL4 切割跨膜底物蛋白的一个子集,这些蛋白在其跨膜结构域中表现出特定的螺旋不稳定特征,例如碱性残基。RHBDL4 在 ER 膜平面上剪切底物蛋白,并需要底物泛素化。RHBDL4 还催化非跨膜片段的裂解,所有片段均从 ER 中脱位,并通过泛素-蛋白酶体途径在胞质溶胶中进一步降解。突变分析表明,RHBDL4 具有 C 端泛素结合基序,与泛素化底物蛋白中的泛素修饰结合可增强 RHBDL4 依赖性蛋白降解。RHBDL4 的 C 端区域还直接与 AAA+ ATP 酶 p97(VCP; 601023) 相互作用,后者在胞质泛素-蛋白酶体途径中发挥作用。弗莱格等人(2012) 得出结论,RHBDL4 有助于 ER 相关降解(ERAD) 中异常膜蛋白的识别和周转。

Wunderle 等人通过活细胞成像和免疫荧光分析(2016) 证实内源性和异位表达的人类 RHBDL4 位于多个细胞系的 ER 中。基于细胞的测定表明,RHBDL4 触发 TGFA(190170)(一种表皮生长因子受体(EGFR;131550) 配体)的 37 kD 全长前体形式的分泌。在稳态条件下,大多数 pro-TGFA 不会离开 ER,并被 ERAD 降解。然而,在存在异位表达的 RHBDL4 或蛋白酶体抑制的情况下,pro-TGFA 从 ERAD 中被拯救出来,并被重定向到增加 ER 输出和分泌。截短分析表明,TGFA 前体的 ER 输出和分泌是由其细胞质 PDZ 结合域介导的。RHBDL4促进分泌的能力不限于pro-TGFA,因为 RHBDL4 增强了多种 I 型膜蛋白(包括 CD44)的 ER 至高尔基体的转移(107269)。梯度分析显示,微泡中的细胞分泌pro-TGFA和CD44,其由RHBDL4促进并通过反式激活调节。

帕什科夫斯基等人(2016) 发现人 RHBDL4 与内质网中的淀粉样前体蛋白(APP; 104760) 相互作用并裂解,导致细胞内产生多个 APP N 端和 C 端片段。这些 APP 片段既不是由经典分泌酶生成也不是由经典分泌酶降解,很可能也不是由其他蛋白酶生成或降解。RHBDL4 活性导致分泌的β-淀粉样蛋白水平显着降低。结果确定 RHBDL4 对 APP 的加工是绕过经典淀粉样蛋白生成途径的替代 APP 加工途径。此外,作者发现 RHBDL4 还裂解其他 APP 家族成员,包括 APLP1(104775) 和 APLP2(104776)。

帕什科夫斯基等人(2018) 发现细胞胆固醇水平调节 RHBDL4 介导的 APP 处理,胆固醇水平升高会对 RHBDL4 活性产生负面影响,而胆固醇水平降低则会触发 RHBDL4 活性。尽管 APP 本身与胆固醇结合,但胆固醇与 APP 的直接结合并不能调节底物识别。相反,作者在 RHBDL4 中发现了胆固醇结合基序,进一步分析表明 RHBDL4 结合胆固醇,并且这种相互作用调节 RHBDL4 活性。

通过 HEK293T 细胞中的底物筛选,Knopf 等人(2020) 鉴定了寡糖转移酶(OST) 复合体亚基,包括 STT3A(601134),作为 RHBDL4 底物。RHBDL4 是 OST 复合物稳态所必需的,因为 RHBDL4 的裂解导致底物错位到细胞质中,并随后被蛋白酶体降解。RHBDL4 在 2 个不同的管腔环处裂解 STT3A,这是由 RHBDL4 的带负电荷的跨膜片段协助底物招募来促进的。HEK293T 细胞的敲除分析表明,通过裂解功能性 OST 复合物,RHBDL4 调节细胞的 ER 糖基化能力。