TRAF 相互作用蛋白； TRAIP

TRIP
环指蛋白 206；RNF206

HGNC 批准的基因符号：TRAIP

细胞遗传学位置：3p21.31 基因组坐标（GRCh38）：3:49,828,601-49,856,564（来自 NCBI）

▼ 说明

肿瘤坏死因子受体 1（TNFR1; 191190）和 CD95/FAS（134637）通过其死亡结构域与信号转导伙伴相互作用，例如 FADD（602457）、TRADD（603500）和 TNFR 相关因子（TRAF）的成员）家庭（例如，TRAF2；601895）。TRAF 反过来与下游信号转导器（例如 TRIP）相互作用，通过激活核因子 kappa-B（NFKB；参见 164011）导致细胞凋亡（Lee 等人，1997）。

▼ 克隆与表达

Lee等人使用TRAF1（601711）或TRAF2作为诱饵对小鼠胸腺细胞cDNA文库进行酵母2杂交筛选，然后筛选人和小鼠胸腺细胞cDNA文库以及小鼠T细胞cDNA文库（1997）分离出编码人和小鼠 TRIP（TRAF 相互作用蛋白）的全长 cDNA。序列分析预测，这种由 469 个氨基酸组成的人类蛋白（与小鼠蛋白有 76% 的一致性）具有 N 末端环指基序和推定的卷曲螺旋结构域。Northern 印迹分析显示，2.1 kb 转录物在小鼠睾丸、胸腺和脾脏中表达最高。Trip 的表达在活化的淋巴细胞中减少。

▼ 测绘

Gross（2016）根据 TRAIP 序列（GenBank BC000310）与基因组序列（GRCh38）的比对，将 TRAIP 基因对应到染色体 3p21.31。

▼ 基因功能

Lee 等人的结合分析（1997）表明，当与 TRAF 共表达时，TRIP 的 N 端卷曲螺旋区域与 TRAF1 或 TRAF2 的 N 端 TRAF 结构域相互作用，并与 TNFR2（191191）或 CD30（153243）相互作用。TRIP 的过表达会抑制 TNF 诱导的 NFKB 激活（191160），但不会抑制 IL-1 诱导的 NFKB 激活（参见 147760）。

Regamey 等人通过以 CYLD（605018）作为诱饵进行酵母 2-杂交筛选，然后进行 Far Western 印迹和共免疫沉淀分析（2003）发现 TRIP 的 C 末端与 CYLD 的中心结构域相互作用。CYLD 下调 TNF 诱导的 NFKB 激活，这种下调依赖于 CYLD-TRIP 相互作用和 CYLD 的去泛素化活性。

Harley 等人通过 GFP 标记的 TRAIP 实时成像（2016）观察到，在紫外激光微照射后，无论是否添加 BrdU 作为 DNA 损伤敏化剂，DNA 损伤位点都会快速重新定位。邻近连接分析显示，TRAIP 与未受损细胞中的 PCNA（176740）非常接近，表明它可以存在于未受损细胞的复制灶处。这种关联在 UV-C 照射后显着增强，与 TRAIP 与 PCNA 定位在 DNA 损伤位点一致。TRAIP 蛋白水平也受到 DNA 损伤的调节，在紫外线处理后的较晚时间点观察到蛋白酶体介导的降解。HeLa 细胞研究表明，TRAIP 是 H2AX（601772）和 RPA2（179836）最佳磷酸化所必需的，以响应 S 期遇到的紫外线诱导损伤。对复制叉动力学的分析表明，特别需要 TRAIP 来防止复制叉在 UV 损伤处停滞。

吴等人（2019）表明，E3 泛素连接酶 TRAIP 是 NEIL3（608934）途径和 Fanconi 贫血途径（参见 227650）链间交联修复所必需的。当 2 个复制体在链间交联处汇聚时，TRAIP 泛素化复制 DNA 解旋酶 CMG（CDC45（603465）、MCM（参见 MCM7、600592）和 GINS（参见 610608）的复合物）。短泛素链通过直接结合招募 NEIL3，而 p97 ATP 酶（VCP；601023）卸载 CMG 则需要较长的链，从而实现 Fanconi 贫血途径。因此，TRAIP 控制复制耦合链间交联修复的 2 种已知途径之间的选择。吴等人（2019）的结论是，他们的结果确立了 TRAIP 作为 CMG 卸载和复制体对障碍物反应的主要调节因子。

▼ 分子遗传学

Harley 等人在 3 名患有 Seckel 综合征 9（SCKL9; 616777）的无关儿童中（2016）鉴定了 TRAIP 基因中无义突变（R185X; 605958.0001）或错义突变（R18C; 605958.0002）的纯合性。这些突变在每个家族中随疾病而分离，并且在对照或公共变异数据库中未发现。

▼ 等位基因变异体（2 个选定示例）：

.0001 塞克尔综合症 9
TRAIP，ARG185TER

Harley 等人在一名患有宫内生长迟缓、小头侏儒症和智力低下（SCKL9; 616777）的意大利女孩和英国男孩中进行了研究（2016）鉴定了 TRAIP 基因中 c.553C-T 转换（c.553C-T, NM_005879.2）的纯合性，导致 arg185 到 ter（R185X）取代。每个家系中未受影响的父母都是杂合突变，在 380 条对照染色体或 1000 基因组计划、外显子组变异服务器或 ExAC 数据库中均未发现这种突变。据了解，双方父母都不是近亲，而且这些家庭也没有已知的关系；然而，高密度全基因组 SNP 基因分型表明，两名患者的 TRAIP 周围均存在纯合性区域，这与每个家庭中未被识别的亲本相关性一致。另外还有一个4. TRAIP 周围区域的每个家族的先证者之间共享 3-Mb 纯合单倍型，这表明尽管地理上相隔，但在许多代之前就具有共同祖先的遥远家族联系。Harley 等人使用 RT-PCR 评估转录水平（2016）观察到意大利女孩的永生化淋巴母细胞系和英国男孩的原代成纤维细胞系中 TRAIP mRNA 显着减少，残留全长 mRNA 水平较低，并且存在可变剪接转录本。免疫印迹表明，两名患者的细胞系中 TRAIP 蛋白表达均大大降低；长时间的免疫印迹暴露揭示了 TRAIP 蛋白变体的大小（47 kD）与野生型 TRAIP（53 kD）相似。哈雷等人（2016）表明 R185X 变体是一种严重的亚型，可能会损害但不会完全消除 TRAIP 细胞功能。患者成纤维细胞的倍增时间明显慢于传代匹配的对照成纤维细胞，并且与野生型TRAIP的互补挽救了缓慢生长的表型，表明细胞周期延长可能是侏儒症表型的基础。BrdU 脉冲追踪流式细胞术时程实验表明晚期 S 期和/或 G2 细胞有所增加，这与细胞周期延迟的复制起源一致。哈雷等人（2016）还观察到紫外线照射后患者细胞中复制叉停滞的频率显着增加，并且具有显着的不对称性，表明叉子进展超过庞大的 UV 加合物时存在问题；该表型通过与野生型 TRAIP 的互补得以挽救，确定 TRAIP 是防止 UV 损伤处的叉停顿所特别需要的。

.0002 塞克尔综合征 9
TRAIP，ARG18CYS

Harley 等人在一名推定诊断为 Seckel 综合征（SCKL9; 616777）的土耳其男孩中（2016）鉴定了 TRAIP 基因中 c.52C-T 转换（c.52C-T, NM_005879.2）的纯合性，导致 RING 指中高度保守残基处的 arg18 到 cys（R18C）取代领域。R18C 的改变对转录水平没有影响，但导致原代患者成纤维细胞中 TRAIP 蛋白水平显着降低，表明蛋白稳定性降低。患者成纤维细胞的倍增时间明显慢于传代匹配的对照成纤维细胞，并且与野生型TRAIP的互补挽救了缓慢生长的表型，表明延长的细胞周期可能是患者侏儒症表型的基础。哈雷等人。