肿瘤抑制剂候选物3; TUSC3
- 推定的前列腺癌肿瘤抑制剂
- N33
- D8S1992
HGNC 批准的基因符号:TUSC3
细胞遗传学位置:8p22 基因组坐标(GRCh38):8:15,417,188-15,852,091(来自 NCBI)
▼ 说明
TUSC3 基因编码参与脊椎动物质膜镁离子转运系统的蛋白质(Zhou 和 Clapham,2009)。
▼ 克隆与表达
麦克格罗根等人(1996) 在染色体 8p22 的一个区域内分离出了 TUSC3 基因,他们将其称为 N33,其中纯合性缺失与转移性前列腺癌相关(Bova 等人,1996)。预测的 347 个氨基酸蛋白与匿名线虫基因(ZK686.3) 具有 43% 的同一性,与酵母 OST3 基因(寡糖转移酶 34-kD 亚基)具有 20% 的同一性。该蛋白预计具有 4 个跨膜结构域,并在大多数非淋巴细胞和检查组织(包括前列腺、肺、肝脏和结肠)中以 1.5 kb mRNA 的形式表达。
Zhou 和 Clapham(2009) 指出,选择性剪接产生 2 种 TUSC3 亚型:TUSC3-1 和 TUSC3-2。TUSC3-1和TUSC3-2分别含有348和347个氨基酸,仅在其末端C末端不同,TUSC3-1以序列DLDFE结尾,TUSC3-2以FLIK结尾。两种异构体都有一个 N 端信号序列和 4 个 C 端跨膜结构域。RT-PCR 分析显示,TUSC3 在卵巢、子宫颈、胎盘、前列腺、睾丸、脂肪和肺中表达最高,而在其他检查组织中几乎没有表达。
▼ 基因结构
麦克格罗根等人(1996)确定TUSC3基因含有11个外显子。
▼ 测绘
TUSC3 基因定位于染色体 8p22(MacGrogan 等,1996)。
▼ 基因功能
MacGrogan 等人在某些肿瘤系中,包括 15 种结肠直肠系中的 14 种(1996)无法检测到N33的表达。在这些情况下,研究人员发现该基因 5-prime 末端的 CpG 簇高度甲基化。
皮尔斯等人(2005) 指出,染色体 8p22 杂合性缺失在上皮性肿瘤中很常见,包括卵巢癌(167000)。他们使用定量RT-PCR对该区域的8个基因(包括N33)在58个原发性卵巢癌组织和38个卵巢癌细胞系中进行表达分析。与较低级别的肿瘤相比,N33 在 3 级肿瘤中的表达显着较低。与正常对照和较低级别的肿瘤相比,另一种基因 EFA6R 在 3 级肿瘤中表现出较低的表达。EFA6R 和 N33 的低表达似乎对生存产生负面影响,特别是当这两个基因的组合表达用作预测因素时。EFA6R 和 N33 在几种卵巢癌细胞系中表现出完全表达缺失。皮尔斯等人。
Zhou 和 Clapham(2009) 表明,人 MAGT1(300715) 或 TUSC3-2(但不是 TUSC3-1)可以补充 Mg(2+) 转运蛋白 Alr1 缺陷的酵母。MAGT1和/或TUSC3的敲低降低了人HEK293和Jurkat细胞中总的和游离的细胞内Mg(2+)浓度。Zhou和Clapham(2009)假设MAGT1和TUSC3可能在介导细胞Mg(2+)摄取中协同发挥作用。
▼ 分子遗传学
Molinari 等人在 2 名患有智力发育障碍 7(MRT7; 611093) 的法国同胞中(2008) 鉴定了 TUSC3 基因中的纯合突变(601385.0001)。这些发现暗示了 N-糖基化在高级脑功能中的作用。
Garshasbi 等人在患有 MRT7 的伊朗近亲大家庭的受影响成员中(2008) 在染色体 8p22 上发现了 120 至 150 kb 的纯合缺失,包括 TUSC3 基因的第一个外显子。所有未受影响的患者父母都是这种缺失的杂合子,而在 192 名不相关的伊朗对照中未检测到这种缺失。
Garshasbi 等人通过全基因组连锁分析和候选基因测序(2011) 在 3 名患有常染色体隐性 MRT7 的伊朗同胞中发现了 TUSC3 基因(Q55X; 601385.0002) 的纯合截短突变。
在与 MRT7、Al-Amri 等人有近亲关系的阿曼人中受影响的成员(2016) 鉴定了 TUSC3 基因中的纯合移码突变(c.222delA; 601385.0003)。该突变是通过纯合性作图和全外显子组测序相结合发现的,与该家族中的疾病分离。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究,但预计该突变将导致功能完全丧失。
▼ 动物模型
Zhou 和 Clapham(2009) 发现,吗啉介导的斑马鱼胚胎中 Magt1 和/或 Tusc3 的敲低显着抑制了它们的成熟和孵化。
▼ 等位基因变异体(3 个选定示例):
.0001 智力发育障碍,常染色体隐性遗传 7
TUSC3,1-BP INS,787C
Molinari 等人在 2 名患有非综合征常染色体隐性智力发育障碍 7(MRT7; 611093) 的法国同胞中(2008) 在 TUSC3 基因的外显子 6 中发现了纯合 1-bp 插入(787insC),导致移码和蛋白质过早终止。在 250 条对照染色体中未发现该插入。患者成纤维细胞显示 TUSC3 mRNA 水平降低,但没有证据表明血清蛋白糖基化异常。
.0002 智力发育障碍,常染色体隐性遗传 7
TUSC3,GLN55TER
Garshasbi 等人在来自伊朗近亲家庭的 3 名患有常染色体隐性智力发育障碍 7(MRT7; 611093) 的同胞中(2011) 鉴定了 TUSC3 基因外显子 2 中的纯合 163C-T 转换,导致 gln55 到 ter(Q55X) 取代。加尔沙斯比等人(2011) 推测由于 TUSC3 损伤导致的镁水平紊乱可能在智力发育受损的发病机制中发挥作用。
.0003 智力发育障碍,常染色体隐性遗传 7
TUSC3,1-BP DEL,222A
在患有常染色体隐性遗传性智力发育障碍 7(MRT7;611093)的阿曼近亲亲属的受影响成员中,Al-Amri 等人(2016) 在 TUSC3 基因的外显子 2 中发现了纯合 1-bp 缺失(c.222delA, NM_006765.3),导致移码和提前终止(Arg74fs)。该突变是通过纯合性作图和全外显子组测序相结合发现的,并通过桑格测序证实,与该家族中的疾病分离。在 ExAC 数据库或 50 个阿曼对照 DNA 中未发现该突变。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究,但预计该突变将导致功能完全丧失。