锌指蛋白 398; ZNF398
- ZER6
HGNC 批准的基因符号:ZNF398
细胞遗传学位置:7q36.1 基因组坐标(GRCh38):7:149,126,408-149,183,042(来自 NCBI)
▼ 说明
ZNF398 是一种乳腺特异性锌指转录因子,受雌激素受体(ER)-α(ESR1;133430) 调节(Conroy 等,2002)。
▼ 克隆与表达
Conroy等人通过酵母2-杂交筛选人乳腺上皮细胞cDNA文库来鉴定ER-α相互作用蛋白,然后筛选MCF7人乳腺癌cDNA文库和5-prime RACE(2002)克隆了 ZNF398 的 2 个变体,他们将其称为 ZER6,它们的 5 素末端不同。 ZER6 的 p71 同工型含有 642 个氨基酸,计算分子量为 52 kD。 它包含一个 N 端 HUB1(ZNF282; 603397) 同源结构域,随后是一个 Kruppel 相关框(KRAB) 结构域和 6 个完整的 C2H2 锌指。 ZER6 的 p52 同工型含有 471 个氨基酸,计算分子量为 52 kD。 它包含p71的6个完整的C2H2锌指,但缺少HUB1结构域和部分KRAB结构域。 RNA点印迹分析显示ZER6主要在乳腺中表达,在肾脏中表达水平较低,在其他48个人体组织中的表达可以忽略不计。 转染的 COS-7 细胞的免疫荧光分析显示两种 ZER6 亚型均位于核内,并具有微弱的细胞质表达。
▼ 基因结构
康罗伊等人(2002)确定ZNF398基因至少含有6个编码外显子。
▼ 测绘
Gross(2019) 根据 ZNF398 序列(GenBank AK290499) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ZNF398 基因对应到染色体 7q36.1。
▼ 基因功能
Conroy 等人使用下拉分析(2002) 证实,在 17-β-雌二醇存在的情况下,ZER6 的 p52 同工型与 ER-α 同型二聚体发生强烈相互作用,但在 17-β-雌二醇不存在的情况下则不然。 相反,无论配体存在或不存在,p71 都不与 ER-α 相互作用,表明 p71 的 HUB1 结构域抑制 ER-α 结合。 PCR 和报告基因分析表明,两种 ZER6 亚型均通过富含 GC 的 ZER6 结合元件(ZBE) 结合 DNA 来激活转录。 然而,与 ER-α 共转染抑制了 p52 反式激活,但不抑制 p71 反式激活。 ER-α 阳性 MCF7 细胞中 p52 的过度表达消除了 p71 的反式激活。