ISTHMIN 2; ISM2

  • ISTHMIN 2,斑马鱼,同源物
  • 血小板反应蛋白 1 型结构域蛋白 3; THSD3
  • 含有血小板反应蛋白和 AMOP 的 Isthmin 样 1; TAIL1

HGNC 批准的基因符号:ISM2

细胞遗传学位置:14q24.3 基因组坐标(GRCh38):14:77,474,394-77,498,816(来自 NCBI)

▼ 说明

Isthmins(包括 ISM2)代表一个分泌蛋白家族,具有多种功能,例如细胞粘附、细胞血管生成和神经系统发育模式。

▼ 克隆与表达

Rossi等人通过EST数据库分析寻找含有血小板反应蛋白1型重复(TSR)结构域的基因(2004) 识别了 ISM2,他们将其称为 TAIL1。 推导的 571 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 63.9 kD。 大多数 EST 对应于缺乏外显子 2 并编码 571 个氨基酸亚型的转录本,并且还鉴定了缺乏外显子 2 和 5 的另一种 292 个氨基酸亚型。 ISM2 包含一个 26 个氨基酸的 N 端疏水信号肽、17 个假定的糖基化位点、一个带负电残基簇的中心区域、一个带有 WSXW 肝素结合基序的 TSR 结构域和一个 C 端粘附相关结构域 存在于 MUC4(158372) 和其他蛋白质(AMOP) 中。 对人体组织的 RT-PCR 分析表明,在胎盘中高表达,在胰腺、肾和脑中中等表达,在心脏、肝脏、肺和骨骼肌中低表达。 外显子侧翼 PCR 引物的分析支持了组织特异性可变剪接转录本的存在。

▼ 基因结构

罗西等人(2004) 确定 ISM2 基因包含 8 个外显子,跨度为 24.4 kb,外显子 2 和 5 具有选择性剪接。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Rossi 等人(2004) 将 ISM2 基因定位到染色体 14q24.3。

▼ 分子遗传学

排除研究

罗西等人(2004) 发现 3 名 ARVD1 患者的 ISM2 基因没有突变(107970)