GDP-甘露糖4,6-脱水酶; GMDS
- GMD
HGNC 批准的基因符号:GMDS
细胞遗传学定位:6p25.3 基因组坐标(GRCh38):6:1,623,806-2,245,605(来自 NCBI)
▼ 说明
GDP-甘露糖 4,6-脱水酶(GMD;EC 4.2.1.47)催化 GDP-甘露糖转化为 GDP-4-酮-6-脱氧甘露糖,这是从 GDP-甘露糖合成 GDP-岩藻糖的第一步,使用 NADP+ 作为辅助因子。 该途径的第二步和第三步由单一酶 GDP-酮-6-脱氧甘露糖 3,5-差向异构酶、4-还原酶(在人类中指定为 FX)催化(137020)。
▼ 克隆与表达
通过 BLAST 搜索,Sullivan 等人(1998) 鉴定了与大肠杆菌 GMD 同源的部分小鼠 cDNA。 他们使用基于蛋白质保守区域的引物进行 PCR,孤立出编码人 GMD 的早幼粒细胞系 cDNA。 预测的人类蛋白质序列与大肠杆菌 GMD 的序列有 61% 的同一性。 Northern 印迹分析显示,GMD 在所有检查的组织中均以 1.7 kb 转录物的形式表达。 沙利文等人(1998) 证明人类 GMD cDNA 可以弥补 Lec13 的缺陷,Lec13 是一种缺乏 GMD 活性的中国仓鼠卵巢细胞系。 作者使用纯化的 GMD 和 FX 表明,仅这 2 种蛋白质就足以在体外将 GDP-甘露糖转化为 GDP-岩藻糖。 沙利文等人(1998) 表明这 2 种酶之一的突变可能导致 II 型白细胞粘附缺陷(LAD2; 266265),因为来自 2 名 LAD2 患者的细胞似乎在该途径中存在特定缺陷。 大山等人(1998) 还分离了 GMD cDNA。 通过 Northern 分析,他们表明 Lec13 细胞中不存在 GMD mRNA。
▼ 测绘
通过荧光原位杂交,Sullivan 等人(1998) 将 GMDS 基因定位到染色体 6p25。
▼ 分子遗传学
在对染色体 6p25.3 拷贝数变异的分析中,Aldinger 等人(2009) 检查了 12 名染色体 6pter-p24 缺失综合征个体的脑成像研究(612582)。 所有患者的 MRI 均有异常,显示典型或轻度 Dandy-Walker 畸形、巨大小脑延髓池或小脑蚓部发育不全。 表型数据显示,与小缺失相比,大缺失个体的表型始终更严重,这表明该区域有超过 1 个致病基因的贡献; 此外,所有 12 个缺失均涉及 FOXC1 基因加上至少 2 个 GMDS 基因的外显子,表明这些基因中的一个或两个在小脑发育中具有先前未被认识到的作用。