RNA，U6 小核，1； RNU6-1

• RNA，U6 小核；RNU6
• snRNA、U6A
• RNA、U6A 小核，以前；RNU6A，以前

HGNC 批准的基因符号：RNU6-1

细胞遗传学位置：15q23 基因组坐标（GRCh38）：15:67,839,940-67,840,045（来自 NCBI）

▼ 基因功能

Kandels-Lewis 和 Seraphin（1993） 研究了 U6 snRNA 在 5 素剪接位点选择中的作用。Lesser 和 Guthrie（1993） 对酿酒酵母中剪接体的研究表明，U6 snRNA 中的突变会改变剪接位点特异性。

加诺等人（1999） 证明 U6 snRNA 中正确的 2-prime-O-甲基化和假尿苷化位点的识别依赖于靶位点周围的短核苷酸序列。他们表明，指导 U6 snRNA 在所有 2-prime-O-甲基化和假尿苷化位点修饰的反式作用因子（例如 SNORD6（618943））在核仁中存在且具有功能活性。

人类 snRNA 启动子包含基础转录所需的近端序列元件（PSE） 和激活转录所需的远端序列元件（DSE）。PSE 招募多亚基因子 SNAPC（参见 605076），而 DSE 招募 OCT1（164175）。当 OCT1 和 SNAPC 各自的结合位点通过涉及确定的蛋白质-蛋白质接触的机制移动到附近时，它们会协同结合 DNA。赵等人（2001） 表明，在天然 U6 启动子上，OCT1 和 SNAPC 的协同结合是由位于 DSE 和 PSE 之间的定位核小体介导的。这种协同结合需要与裸露 DNA 上紧密间隔位点的协同结合相同的蛋白质-蛋白质接触，并介导转录激活。

Valadkhan 和 Manley（2001） 证明，2 个 snRNA U2（180690） 和 U6 的无蛋白复合物可以结合并定位包含内含子分支位点序列的小 RNA，并激活分支腺苷以攻击催化关键酶。 U6 结构域参与与剪接第一步相关的反应。Valadkhan 和 Manley（2001） 得出结论，他们的数据为剪接体 snRNA 的催化潜力提供了直接证据。

U6 snRNA 在转录后被 TUT1（610641） 寡尿苷酰化，并且约 90% 的 U6 snRNA 的最后一个核苷酸被修饰以形成稳定性所需的末端 2-prime,3-prime-环状磷酸盐。Mroczek 等人使用基因筛选（2012） 发现人类 USB1 补充了酵母中 Usb1 的损失，恢复了细胞生长和测试前 mRNA 的剪接。添加 U6 snRNA 也部分修复了酵母中的 Usb1 缺陷。通过小干扰 RNA 敲低 HeLa 细胞中的 USB1 不会改变 U6 snRNA 水平或显着影响前 mRNA 剪接，但由于 TUT1 3-prime 尿苷化，与对照相比，U6 snRNA 分子的长度变得更加异质。USB1 的丢失也略微降低了 U6 snRNA 的稳定性。莫罗泽克等人。

希尔琴科等人（2013） 表明 USB1 逐渐修剪 U6 snRNA 中的 3 素聚（A） 和聚（U），并在 U6 snRNA 的 3 素末端生成 2 素、3 素环磷酸。USB1读取U6 snRNA的核苷酸A102作为暂停信号并停止修剪下游的5个尿苷。Hilcenko 等人在来自因 USB1 突变而导致中性粒细胞减少症（PN; 604173） 的皮肤异色症患者的淋巴母细胞中（2013） 发现 U6 snRNA 具有异常的非模板 3 引物寡（A） 尾部，这是核 RNA 监视目标的特征。他们得出结论，USB1 在转录后 3-prime 末端加工中发挥作用，保护 U6 snRNA 免受核外泌体的定向破坏。

▼ 生化特征

叶恩等人（2000） 表明酵母 U6 snRNA 特异性结合二价金属离子（可能是镁），这是催化第一步剪接所必需的。使用镁，用硫取代了核苷酸 U80 的 2 个非桥接磷酰氧的 U6 snRNA 重建了完全组装但催化失活的剪接体。添加亲硫离子（例如锰）可以发生第一次酯交换反应，但不能发生第二次。镁竞争性抑制锰拯救反应，表明野生型剪接体中存在U6/U80处的金属结合位点，并且该位点改变了剪接体中活性的金属需求。叶恩等人（2000） 得出结论，U6 snRNA 通过金属离子协调有助于前体 mRNA 剪接，

晶体结构

朱奥等人（2003） 报道了包含 BRF1（604902） 同源结构域 II、TBP（600075） 保守区和 U6 启动子 DNA 的 19 个碱基对的三元复合物的 2.95 埃分辨率晶体结构。该结构揭示了转录因子 IIIB 组装的核心界面，并证明了松散堆积的 BRF1 结构域如何与 TBP 的凸面和侧面实现显着的结合特异性。