长非编码 RNA 13

lncRNA 13; LNC13

细胞遗传学定位：2q12.1 基因组坐标（GRCh38）：2:102,100,001-105,300,000

▼ 说明

长链非编码 RNA（lncRNA），如 LNC13，预计可调节基因表达（Castellanos-Rubio et al., 2016）。

▼ 克隆与表达

卡斯特利亚诺斯-卢比奥等人（2016） 克隆了小鼠 Lnc13，他们发现了支持同源人类基因组区域表达等效转录物的证据。 他们证实了 U937 骨髓细胞系中经过加工、聚腺苷酸化和加帽的人类 LNC13 转录物的表达。 LNC13 在人类和小鼠中均缺乏蛋白质编码潜力。 对永生化小鼠骨髓源性巨噬细胞（BMDM） 进行 Northern 印迹分析，检测到 2.8 kb Lnc13 转录物。 定量RT-PCR显示LNC13在20种人体组织中表达存在差异，其中在肾脏中表达最高，在肾上腺以及成人和胎儿脑中很少或没有表达。 RNA原位杂交揭示了人类肠道样本以及人类和小鼠巨噬细胞系中LNC13主要在核表达。 在分级细胞中，LNC13 几乎完全定位于染色质。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Castellanos-Rubio 等人（2016） 将 LNC13 基因对应到染色体 2q12.1。

▼ 基因功能

卡斯特利亚诺斯-卢比奥等人（2016） 发现脂多糖刺激导致人 U937 单核细胞、小鼠 BMDM 和永生化 BMDM 中 LNC13 的下调。 小鼠和人类细胞中的敲低和抑制剂研究表明，LNC13 下调取决于 MYD88（602170）、NF-kappa-B（参见 164011）和 RNA 脱帽蛋白 DCP2（609844）。 LNC13 的下调与多种炎症基因的表达呈负相关，RNA 反义纯化证实 IL1RN（147679）、MYD88、STAT1（600555） 和 TRAF2（601895） 是 LNC13 的直接靶标。 质谱分析显示，LNC13 与 hnRNPD（601324） 的 p42 同工型相互作用，并且 hnRNPD、LNC13 和 HDAC1（601241） 在 LNC13 靶基因的转录起始位点富集。 卡斯特利亚诺斯-卢比奥等人（2016） 提出 LNC13 作为 hnRNPD、HDAC1 和染色质之间的纽带来调节炎症基因子集的表达。

▼ 分子遗传学

有关 LNC13 基因变异与乳糜泻之间可能关联的讨论，请参阅 CELIAC8（612006）。