锌指蛋白 278; ZNF278

  • 含 POZ、AT Hook 和锌指的蛋白质;PAZ
  • MAZ 相关因素;MAZR
  • 锌指肉瘤基因;ZSG

本条目中代表的其他实体:
ZNF278/EWS 融合基因,包括
ZNF278/UQCRH 融合基因,包括

HGNC 批准的基因符号:PATZ1

细胞遗传学位置:22q12.2 基因组坐标(GRCh38):22:31,325,804-31,346,346(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

BTB/POZ(广泛复合体、有轨电车、小马驹/痘病毒和锌指)结构域指导特定的蛋白质-蛋白质相互作用,并且经常存在于转录因子中。Fedele 等人使用酵母 2 杂交筛选,以环指蛋白 4(RNF4;602850)为诱饵,然后筛选乳腺癌 cDNA 文库(2000) 分离出编码 ZNF278 的 cDNA,他们将其称为 PATZ(POZ-AT 钩子锌指蛋白)。预测的 537 个氨基酸 ZNF278 蛋白包含 N 端 BTB/POZ 结构域、HMG1 蛋白典型的 AT 钩 DNA 结合结构域(参见 163905)和 7-锌指结构域。前 4 个锌指是 C2H2 型,而后 3 个锌指具有疏水残基取代,可以稳定锌指的形成。费德勒等人。

Kobayashi 等人使用酵母 2-杂交筛选,以 Bach2 的 BTB/POZ 结构域(参见 BACH1;602751)作为诱饵(2000) 分离出编码 Znf278 的小鼠 cDNA,他们将其称为 Mazr(MAZ(600999) 相关因子)。通过搜索序列数据库,Kobayashi 等人(2000) 鉴定了编码 ZNF278 的人类基因组序列,其与小鼠 Znf278 具有 99% 的氨基酸同一性。Northern 印迹分析检测到小鼠胸腺、胎儿肝脏和骨髓以及其他组织中的 Znf278 转录物水平较低。

马斯特兰杰洛等人(2000) 通过 5-prime RACE、cDNA 文库和数据库筛选以及 PAC 克隆的序列分析,克隆了 ZNF278,他们将其称为 ZSG。RT-PCR 分析表明,外显子 5 发生选择性剪接,从而产生在 C 末端具有 4 或 6 个 C2H2 锌指的蛋白质。Northern 印迹分析揭示了 3-kb 和 4-kb 转录本的普遍表达。

▼ 基因功能

通过色谱和免疫共沉淀分析,Fedele 等人(2000)表明ZNF278在体外和体内均与RNF4相互作用。作者发现 POZ 结构域负责抑制基础转录以及抑制 RNF4 介导的激活。免疫荧光分析表明 ZNF278 与 RNF4 在核基质中共定位。

小林等人(2000) 发现小鼠 Znf278 是 c-myc(190080) 启动子的转录激活因子,并且在 Bach2 存在的情况下转录激活得到增强;Znf278 和 Bach2 的相互作用通过 BTB/POZ 结构域发生。

在小鼠中,至少 5 个 Cd8 顺式作用增强子(单独或组合)直接在 T 细胞谱系中表达,并且删除特定增强子会导致双阳性中 Cd8a(186910)/Cd8b(186730) 异二聚体的多样化表达胸腺细胞。比利奇等人(2006) 表明,增强子缺失导致的 Cd8 杂色与表观遗传“关闭”状态相关,将 Cd8 增强子功能与 Cd8a 和 Cd8b 染色质重塑联系起来。锌指蛋白 Mazr 结合 Cd8 增强子,并通过其 N 末端结构域与双阴性胸腺细胞中的 Ncor1(600849) 复合物相互作用。Mazr 在双阳性和 Cd8 单阳性胸腺细胞中下调。T 细胞发育过程中 Mazr 的组成型表达导致双阳性胸腺细胞中 Cd8 的多样化表达。比利奇等人。

▼ 基因结构

马斯特兰杰洛等人(2000) 确定 ZNF278 基因包含 6 个外显子,跨度为 20 kb。

▼ 测绘

小林等人(2000) 在 22q12 中鉴定出编码 ZNF278 的人类序列;他们使用辐射混合面板证实了这种定位。

▼ 细胞遗传学

马斯特兰杰洛等人(2000) 描述了小圆形细胞肉瘤中 22q 染色体的亚显微倒位,具有 at(1;22)(p36.1;q12) 易位。所得嵌合转录物含有与 ZNF278 基因的外显子 1 框内融合的尤文肉瘤基因(EWS; 133450) 的外显子 8,从而产生了 EWS 的反式激活结构域与 ZNF278 的锌指结构域融合的蛋白质。马斯特兰杰洛等人(2000) 发现 ZNF278 基因位于 EWS 远端 2 Mb 处,并以相反方向转录。因此,他们得出结论,为了产生活性 EWS-ZNF278 融合基因,应该发生 22q12 的旁心倒位。

摩德纳等人(2003) 描述了一个易位 t(1;22)(p34;q12),该易位与小圆形细胞肉瘤中 22q12 染色体的中心倒位相关。他们之前已经证明(Mastrangelo 等,2000)染色体 22q12 的倒位产生了 EWS/ZSG 融合基因。摩德纳等人(2003) 发现 t(1;22)(p34;q12) 中断了 UQCRH 基因(613844),断点在内含子 3 中,并在 der(22) 上的 EWS 和 der(1 上的 ZSG) 上创建了融合基因)。肿瘤 cDNA 和基因组 DNA 的 PCR 分析检测到 5-prime-UQCRH/EWS-3-prime、5-prime-ZSG/UQCRH-3-prime 和 5-prime-EWS/ZSG-3-prime。只有 5-prime-EWS/ZSG-3-prime 产生框内转录本。相反,5-prime-UQCRH/EWS-3-prime 和 5-prime-ZSG/UQCRH-3-prime 产生包含过早终止密码子的框外转录本。