跨膜内耳表达基因; TMIE
HGNC 批准的基因符号:TMIE
细胞遗传学位置:3p21.31 基因组坐标(GRCh38):3:46,693,778-46,710,886(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
纳兹等人(2002) 确定 TMIE 基因编码推导的 156 个氨基酸的蛋白质,与小鼠同源物具有 92% 的序列同一性。Northern印迹分析表明TMIE基因在许多人体组织中表达并编码大约2.5 kb的转录本。对来自人类视网膜和各种其他组织的 cDNA 进行重复 RACE 实验,产生了大约 1.7 kb 的转录本;没有发现其他 TMIE 转录本。序列分析预测了细胞内 N 末端、由细胞外环分隔的 2 个跨膜区域和细胞内 C 末端。信号肽的切割将产生胞外 N 末端和单个跨膜结构域。
▼ 基因结构
纳兹等人(2002)指出TMIE基因包含4个外显子。
▼ 测绘
西尔马奇等人(2009) 指出 TMIE 基因定位于染色体 3p21。
▼ 基因功能
纳兹等人(2002) 指出,导致小鼠和人类耳聋的功能丧失突变的鉴定表明该基因在听觉系统中具有保守的关键作用。受影响的旋转小鼠的内耳病理表明,Tmie 是耳蜗中感觉毛细胞出生后正常成熟所必需的,包括静纤毛束的正确发育(Mitchem 等,2002)。
▼ 分子遗传学
纳兹等人(2002) 证明了近亲家庭受影响成员的 TMIE 基因中有 5 种不同的纯合隐性突变,孤立出严重至极重的语前耳聋,并与 3p 上的 DFNB6(600971) 区域连锁。
▼ 动物模型
米切姆等人(2002) 证明新基因 Tmie 中的 2 个孤立突变是“旋转”小鼠听力损失和前庭功能障碍的原因。“旋转”突变对应到 9 号染色体的一个区域,该区域与人类 3p 染色体显示同线性。因此,对应到 3p21 的 DFNB6 被认为是人类的相应疾病。
▼ 等位基因变异体(6 个精选示例):
.0001 耳聋,常染色体隐性遗传 6
TMIE,4-BP INS,125CGCC
在一个来自印度(I-51) 对应到 DFNB6(600971) 区域的家庭中,Naz 等人(2002) 在 TMIE 基因外显子 2 的第 125 位发现了 4 个核苷酸 CGCC 的纯合插入。预计插入会导致移码,取代 72 个不正确的氨基酸,然后导致蛋白质过早终止。
.0002 耳聋,常染色体隐性遗传 6
TMIE,ARG81CYS
Naz 等人在一个耳聋家族(PKSR22B) 中对应到 DFNB6(600971) 区域(2002) 鉴定了 TMIE 基因外显子 3 中的纯合 241C-T 转换,导致预测的细胞质结构域中的 arg81 到 cys(R81C) 突变。
.0003 耳聋,常染色体隐性遗传 6
TMIE,ARG84TRP
Fukushima 等人将一个患有非综合征性耳聋(5020-22) 的印度近亲家庭对应到 3p 染色体(DFNB6; 600971)(1995),纳兹等人(2002) 鉴定了 TMIE 基因外显子 3 中的 250C-T 转变,导致预测的细胞质结构域中出现 arg84 到 trp(R84W) 突变。
西尔马奇等人(2009) 在 51 个患有常染色体隐性耳聋的土耳其家庭中,有 4 个发现了 R84W 突变的纯合性。进一步分析发现,在另外分析的 207 个家族中,有 3 个家族存在纯合 R84W 突变。在 R84W 和 W57X 纯合的 2 个聋人婚姻的 2 个受影响的孩子中发现了 R84W 的复合杂合性和外显子 2 中的 170G-A 转换,导致 trp57-to-ter(W57X; 607237.0006) 取代。分别。94 名对照个体中的一名是 R84W 突变杂合子。表型包括先天性/语前发病的严重至极重度感音神经性听力损失,无内耳异常。在土耳其各地患有听力损失但没有 GJB2(121011) 突变的家庭中,R84W 突变的频率为 3.1%,但增加到 12 个。安纳托利亚东南部为 2%。单倍型分析表明,R84W 是大约 1,250 年前源自共同祖先的创始人突变。
.0004 耳聋,常染色体隐性遗传 6
TMIE,ARG92TRP
在一个耳聋对应到 DFNB6(600971) 区域的家族(PKDF76) 中,Naz 等人(2002) 鉴定了 TMIE 基因中的 274C-T 转变,导致 arg92 到 trp(R92W) 突变。
.0005 耳聋,常染色体隐性 6
TMIE,6-BP DEL/1-BP INS
在一个耳聋对应到 DFNB6(600971) 区域的家族(PKSN21) 中,Naz 等人(2002) 鉴定了一种缺失/插入突变,涉及从 TMIE 基因内含子 1 的剪接受体位点删除 6 个核苷酸并插入单个 C(IVS-2_98delAGCCCAGinsC)。由于突变去除了外显子 2 之前的预测受体剪接位点,因此该外显子可能会被跳过,从而导致移码。或者,可以利用外显子 2 中预测的隐藏剪接位点,从而从 TMIE 的推定胞外结构域中删除 21 个核苷酸并去除 7 个氨基酸。
.0006 耳聋,常染色体隐性遗传 6
TMIE,TRP57TER
Sirmaci 等人讨论了 TMIE 基因中的 trp57-to-ter(W570X) 突变,该突变在患有常染色体隐性耳聋 6(DFNB6; 600971) 的同胞中以复合杂合状态发现(2009),参见 607237.0003。