硒代半胱氨酸插入序列结合蛋白 2; SECISBP2
- SECIS 结合蛋白 2;SBP2
HGNC 批准的基因符号:SECISBP2
细胞遗传学定位:9q22.2 基因组坐标(GRCh38):9:89,318,500-89,367,117(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
在真核生物中,将 UGA 密码子解码为硒代半胱氨酸(sec) 需要在 mRNA 的 3-prime 非翻译区中插入 sec 插入序列(SECIS)。科普兰等人(2000)纯化了大鼠SECIS结合蛋白Sbp2,并获得了编码它的cDNA克隆。预测的 846 个氨基酸的 Sbp2 蛋白包含在核糖体蛋白中发现的推定 RNA 结合域和翻译终止的酵母抑制因子。大鼠组织的 Northern 印迹分析在所有测试的组织中检测到 4-和 3.5-kb 转录物。仅在睾丸中检测到 2.5 kb 的转录本。
Lescure 等人通过搜索 EST 数据库并筛选 HeLa 细胞 cDNA 文库(2002)克隆了人类SBP2。推导的蛋白质含有854个氨基酸,预测分子量为95.5 kD。人和大鼠 SBP2 共享 2 个结构域,氨基酸一致性为 92% 和 95%;后一个结构域包含 RNA 结合结构域。域间部分具有 55% 的同一性,而人类和大鼠 SBP2 序列的其余部分具有 65% 的同一性。Northern 印迹分析检测到除睾丸外所有测试组织中 4 kb 转录物的低表达,睾丸中 SBP2 高度过表达。在睾丸中还检测到了 3 至 3.5 kb 的额外转录物。
▼ 基因功能
通过紫外线交联和免疫沉淀,Copeland 等人(2000) 表明大鼠 Sbp2 在体外和体内都特异性结合硒蛋白 mRNA。他们开发了一种用于分析 sec 掺入的体外系统,其中硒蛋白 mRNA 的翻译既依赖于 Sbp2 又依赖于 SECIS 元件。裂解液中 Sbp2 的免疫耗竭消除了 sec 插入,当将重组 Sbp2 添加到反应中时,sec 插入又恢复了。这些结果表明,Sbp2 对于将 sec 共翻译插入到硒蛋白中至关重要。因此,Sbp2 的结合活性可能与防止 UGA/sec 密码子处的终止有关。
莱斯库尔等人(2002) 表明,小鼠硒蛋白特异性延伸翻译因子 SelB(607695) 可以刺激人 SBP2 与 SECIS RNA 的结合。
扎瓦茨基等人(2003) 指出真核生物使用 2 个不同的因素来解码 UGA 秒密码子。第一个蛋白 SBP2 与 mRNA 3 引物非翻译区的 SECIS 元件结合,并招募第二个蛋白 SELB。通过共沉淀研究,他们确定小鼠 SelB 的 C 端 64 个氨基酸足以与小鼠 Sbp2 相互作用。这种相互作用需要硒代半胱氨酸-tRNA;如果没有它,这两个因素不会共沉淀。硒代半胱氨酸-tRNA 稳定了 SelB 的 C 端结构域。扎瓦茨基等人(2003) 得出结论,耦合效应对于防止非生产性解码尝试至关重要,因此形成了有效的硒蛋白合成的基础。
▼ 分子遗传学
脱碘酶(DIO) 是催化碘甲状腺原氨酸脱碘的硒酶,在甲状腺激素激活和失活中发挥重要作用。硒代半胱氨酸位于硒酶的活性中心,是适当的酶活性所必需的。杜米特雷斯库等人(2005) 发现 SBP2 中的缺陷会产生与 DIO2(601413) 活性降低相关的特定甲状腺表型(THMA1; 609698)。他们确定了一个同胞,其中 7 个同胞中有 3 个有甲状腺激素代谢异常的临床证据。他们的成纤维细胞显示 DIO2 酶活性降低,与 DIO2 基因座无关。杜米特雷斯库等人(2005) 发现该家族受影响的成员在 SECISBP2 基因座上共享纯合单倍型。该基因 17 个外显子的测序鉴定出外显子 12 中的错义突变,导致 arg540 替换为 gln 氨基酸(607693.0001)。父母均为杂合子携带者。原生家庭是贝都因人后裔。杜米特雷斯库等人(2005) 在具有相似表型的爱尔兰血统家族中鉴定出 SECISBP2 的复合杂合缺陷(参见 607693.0002)。他们指出,这两个家族中受影响的个体的甲状腺表型与同时靶向破坏 Dio1 和 Dio2 的小鼠相似,尽管它们在这两个位点上都没有缺陷。就像 Dumitrescu 等人描述的主题一样(2005),这些小鼠的血清 T4 和 TSH 浓度较高,T3 浓度较低,而 rT3 浓度显着升高。与 Dio2 基因敲除的雄性小鼠一样,它们在 3 至 8 周龄时生长延迟,让人想起两个家庭的先证者。由于 SECIS 结合蛋白(SBP2) 对硒蛋白合成具有上位性,因此这些缺陷对硒蛋白具有普遍影响。SBP2 功能的不完全丧失被认为是导致相对温和的表型的原因。
Catli 等人对一名甲状腺激素代谢异常的 12.75 岁土耳其男孩进行了研究(2018) 鉴定了 1 bp 插入(607693.0004) 的纯合性,该插入与家族中的疾病分离。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Lescure 等人(2002) 将 SBP2 基因定位到 9 号染色体。
▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):
.0001 甲状腺激素代谢 1,
SECISBP2 异常,ARG540GLN
杜米特雷斯库等人(2005) 研究了一个贝都因沙特家庭,其中 7 个兄弟姐妹中有 3 个具有与 DIO2(601413) 活性降低相关的特定甲状腺表型(THMA1; 609698)。该沙特家族中受影响的个体在 SECISBP2 基因座上共享纯合单倍型,并被发现在 CpG 二核苷酸中携带 G 到 A 的转变,从而将密码子 540 从 CGG 更改为 CAG(R540Q)。父母均为杂合子携带者。
.0002 甲状腺激素代谢 1,异常
SECISBP2,LYS438TER
Dumitrescu 等人在一名甲状腺激素代谢异常的爱尔兰儿童(THMA1; 609698) 中进行了研究(2005) 发现 SECISBP2 基因突变的复合杂合性。先证者从其父亲那里继承了第 10 号外显子中的 A-T 颠换,导致 lys438-to-ter(K438X) 替换。先证者的母亲将剪接位点突变(IVS8DS+29G-A)遗传给了先证者及其同父异母的妹妹。该突变创建了一个替代的供体剪接位点,产生了一个将 26 bp 合并到外显子 8 中的替代转录本。异常剪接的转录本占淋巴细胞中突变母体等位基因生成的转录本的 52%,并改变了阅读框以产生假定的截短蛋白质。
.0003 甲状腺激素代谢 1,
SECISBP2 异常,IVS8DS,GA,+29
讨论 Dumitrescu 等人在甲状腺激素代谢异常患者(THMA1; 609698) 中以复合杂合状态发现的 SECISBP2 基因中的 IVS8+29G-A 突变(2005),参见 607693.0002。
.0004 甲状腺激素代谢 1,异常
SECISBP2,1-BP INS,800A
Catli 等人在一名患有甲状腺激素代谢异常(THMA1;609698)的 12.75 岁土耳其男孩中(2018) 鉴定了 SECISBP2 基因中 1 bp 插入(c.800_801insA) 的纯合性,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Lys267LysfsTer2)。他未受影响的父母和兄弟是该突变的杂合子。患者成纤维细胞的蛋白质印迹分析显示缺乏全长 SECISBP2 蛋白,并且 GPX1(138320) 水平大大降低。与其他家庭成员相比,血清 GPX 活性也显着降低。此外,与对照组相比,先证者的血清 GPX3(138321) 蛋白水平显着降低,其杂合父母和兄弟的血清 GPX3(138321) 蛋白水平也明显降低。