Shisa 家族,成员 5; SHISA5
- SCOTIN
HGNC 批准的基因符号:SHISA5
细胞遗传学位置:3p21.31 基因组坐标(GRCh38):3:48,467,876-48,504,810(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
张等人(2000) 从 CD34(142230) 阳性造血干/祖细胞中克隆了编码 Scotin 的 cDNA,他们将其称为 HSPC217。推导的 170 个氨基酸蛋白质包含 MYB(189990) DNA 结合域重复特征。5种造血细胞系的微阵列分析检测到NB4和Jurkat细胞中低水平表达Scotin,但在HL60、K562和U937细胞中未检测到表达。
布尔登等人(2002) 通过对整个动物进行伽马射线照射后正常小鼠和 p53(191170) 缺失小鼠的脾脏和胸腺的差异显示来鉴定小鼠 Scotin。诱导的 1.85 kb 转录物编码推导的 235 个氨基酸的蛋白质。Bourdon 等人通过使用小鼠序列作为探针,然后使用 5-prime 和 3-prime RACE 搜索 EST 数据库(2002) 从胎盘 cDNA 文库中克隆了编码 Scotin 的全长 cDNA。推导的 240 个氨基酸的人类蛋白与小鼠 Scotin 具有 70% 的同一性。人和小鼠蛋白均含有 N 端信号序列、由 18 个疏水氨基酸组成的中央跨膜结构域和脯氨酸/酪氨酸结构域,并且通过蛋白质印迹分析显示,两者的表观分子质量均为 25 kD。外源表达 Scotin 的免疫定位揭示了与内质网(ER) 标记物的共定位。通过突变分析,Bourdon 等人(2002) 确定富含脯氨酸的结构域是 ER 定位所必需的。
Furushima 等人通过对发育中的小鼠进行原位杂交(2007) 在胚胎第 6.5 天(E6.5) 检测到 Shisa5 在胚胎外外胚层中的表达。在E7.75时,Shisa5在绒毛膜中表达,在卵黄囊中表达较弱,在E8.0时,Shisa5在前肠和卵黄囊中表达。E9.5 未检测到 Shisa5 表达。古岛等人(2007) 指出小鼠 Shisa5 有 2 个剪接变体。
Pei 和 Grishin(2012) 报道,推导的 240 个氨基酸的人 SHISA5 蛋白具有 SHISA 蛋白的典型结构域结构,包括 N 端信号肽,随后是富含半胱氨酸的结构域、跨膜结构域和 C-末端富含脯氨酸区域。SHISA5 的跨膜结构域后面有几个保守的半胱氨酸,并且可能经过脂质修饰。SHISA5 属于包含 SHISA4(617326) 的 SHISA 亚家族。
▼ 基因功能
布尔登等人(2002) 指出,小鼠胸腺和脾细胞在紫外线照射或暴露于放线菌素 D 后经历了大规模的 p53 依赖性细胞凋亡。他们发现 Scotin mRNA 与细胞凋亡同时被诱导,并且仅在受照射的野生型小鼠的脾脏和胸腺中表达,而在受辐射的 p53 缺失小鼠的脾脏或胸腺。使用电泳迁移率变动分析,他们证实了 p53 和 Scotin 之间的直接结合,并使用由小鼠 Scotin 启动子驱动的荧光素酶报告质粒,他们证实了剂量依赖性 p53 反式激活。此外,布尔登等人(2002)表明p53/Scotin途径诱导的细胞凋亡是半胱天冬酶依赖性的。
金等人(2016) 在用抗病毒细胞因子 IFNB(147640) 处理的 Huh7 人肝细胞癌细胞中观察到 SCOTIN 表达上调,但在用炎性细胞因子 IL1B(147720) 或 IL6(147620) 处理的细胞中则没有。SCOTIN 的过度表达限制丙型肝炎病毒(HCV;参见 609532)的复制和病毒颗粒的产生。SCOTIN 还促进非结构蛋白 5A(NS5A)(一种位于内质网的 HCV 蛋白)的自噬体降解。SCOTIN通过自噬抑制HCV复制,但它并没有直接改变一般的自噬过程。SCOTIN 通过其跨膜/富含脯氨酸的结构域结合 NS5A,与自噬体中的 LC3(MAP1LC3A;601242) 共定位,并且其本身通过自噬过程被降解。金等人(2016) 得出结论,IFNB 诱导的 SCOTIN 将 HCV NS5A 募集至自噬体进行降解,
▼ 基因结构
通过基因组序列分析,Bourdon 等人(2002)确定人类Scotin基因含有6个外显子。他们在小鼠 Scotin 启动子中鉴定出了 9 个十聚体的 p53 响应元件。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Zhang 等人(2000) 将人类 Scotin 基因对应到 3 号染色体。通过基因组序列分析,Bourdon 等人(2002) 将 Scotin 基因定位到染色体 3p21.3。他们还在染色体 Xq13.1-q13.3 上发现了 Scotin 假基因。