TCF3 融合伙伴; TFPT
- FB1
- AMIDA,老鼠,同源物
此条目中代表的其他实体:
包含 TFPT/E2A 融合基因
HGNC 批准的基因符号:TFPT
细胞遗传学位置:19q13.42 基因组坐标(GRCh38):19:54,107,020-54,115,657(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
布兰比拉斯卡等人(1999) 在一些儿科前 B 细胞急性淋巴细胞白血病病例中,通过与 E2A(TCF3; 147141) 的融合,鉴定出了 TFPT,他们将其称为 FB1。 通过对脐带血RNA进行5-prime RACE,他们克隆了全长cDNA。 推导的蛋白质含有253个氨基酸。 Northern blot 分析检测到所有 6 个测试组织中 1.1-kb 和 1.2-kb 转录物的差异表达。 1.2-kb 转录本在肝脏和结肠以及骨髓白血病细胞系中占主导地位,而 1.1-kb 转录本在脑中占主导地位。 两种转录本在 B 细胞系和 T 细胞系中均等表达。 RT-PCR 在所有检查的细胞系和组织中均检测到 FB1。
▼ 基因功能
入江等人(2000) 对大鼠 Tfpt 进行了描述,他们将其命名为 Amida,以佛教神灵的名字命名,相信它可以提供舒适的死亡。 他们发现 Amida 在转染 COS-7 细胞后引起细胞凋亡。 入江等人(2000) 在 Amida 中发现了 2 个核定位信号(NLS),它们指导蛋白质的核积累,并且他们确定 NLS 之间的中心域促进细胞死亡。 Amida 与 Arc(605235) 相互作用,Arc 可以抑制 Amida 过表达诱导的细胞死亡。
▼ 基因结构
布兰比拉斯卡等人(2001) 确定 TFPT 基因包含 6 个外显子,跨度约为 10 kb。 启动子区域没有 TATA 框,但有 13 个 Ikaros(ZNFN1A1;603023) isoform-2 的推定结合位点、1 个 Ikaros isoform-1 和 8 个 Ets 蛋白的结合位点(参见 ETS1;164720)。
▼ 测绘
通过 YAC 分析和 FISH,Brambillasca 等人(1999) 将 TFPT 基因定位到染色体 19q13.4。 布兰比拉斯卡等人(2001) 确定 TFPT 基因定向为端粒到着丝粒,并且 TFPT 的启动子区域与 PRPF31 基因的 5 引物侧翼序列重叠(606419)。
▼ 细胞遗传学
布兰比拉斯卡等人(1999) 鉴定了 4 例显示 E2A/FB1 嵌合转录本的急性淋巴细胞白血病病例,这些转录本似乎源自 19 号染色体的隐秘重排。E2A 的 5-prime 部分在外显子 13 或 14 内的不同位置处中断并与 FB1 融合。 1 例融合符合读框,其余病例显示框外融合,导致 FB1 中出现终止密码子或导致预测的嵌合产物截断。 布兰比拉斯卡等人(1999)没有发现相互嵌合转录物的证据。