细胞色素 c 氧化酶组装因子 6; COA6
- 1 号染色体开放解读码组 31;C1ORF31
HGNC 批准的基因符号:COA6
细胞遗传学定位:1q42.2 基因组坐标(GRCh38):1:234,373,456-234,385,080(来自 NCBI)
▼ 说明
COA6 基因编码线粒体细胞色素 c 氧化酶(复合物 IV)的组装因子(Ghosh 等人总结,2014)。
▼ 克隆与表达
Szklarczyk 等人使用数据库分析和蛋白质分析来鉴定酵母细胞色素 C 氧化酶(COX) 组装蛋白的人类直系同源物(2012) 鉴定出 C1ORF31。推导的蛋白质包含假定的线粒体靶向信号。
Baerling 等人在 HEK293 细胞中(2015) 发现 COA6 是一种可溶性线粒体蛋白,定位于膜间隙。
▼ 基因功能
斯克拉奇克等人(2012) 发现 C1ORF31 与 C7ORF44(COA1; 614769) 共纯化,C7ORF44 是一种假定的 COX 组装因子。
戈什等人(2014) 证明 Coa6 是酿酒酵母线粒体呼吸和细胞色素 c 氧化酶组装所必需的。人成纤维细胞中 COA6 的敲低导致线粒体复合物 IV 的 COX2(MTCO2; 516040) 亚基特异性减少以及复合物 IV 组装缺陷。补充铜可使 COX2 蛋白水平恢复正常,并挽救 COA6 缺失细胞的呼吸生长缺陷。研究结果表明 COA6 在铜稳态和向复合物 IV 的转运中发挥作用。
在体外研究中,斯特劳德等人(2015) 证明 COA6 参与 COX2 的铜依赖性生物合成,从而影响复合物 IV 组装的早期步骤。HEK293 细胞中 COA6 的敲低会导致严重的生长缺陷,这是由于 COX2 生物发生受损以及随后复合物 IV 组装中间体的积累引起的复合物 IV 缺陷。COA6 还被证明可以结合铜并与线粒体铜伴侣 SCO1(603644) 结合。
在酵母和人类细胞中,Pacheu-Grau 等人(2015) 证明 COA6 与 COX2 相互作用,并且是 COX2 生物发生所特别需要的。COA6 还与 SCO2(604272) 进行了交互。研究结果表明 COA6 是线粒体铜中继系统的组成部分。
▼ 测绘
Hartz(2012) 根据 C1ORF31 序列(GenBank BC025793) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 C1ORF31 基因对应到染色体 1q42.2。
▼ 分子遗传学
Ghosh 等人在患有线粒体复合物 IV 缺陷核型 13(MC4DN13; 616501) 的男性婴儿中表现为致命的婴儿心脑肌病(2014) 鉴定了 COA6 基因中的复合杂合突变(614772.0001 和 614772.0002)。
Baerling 等人在阿拉伯血统近亲父母所生的女婴中,携带 MC4DN13 表现为致命性婴儿心脑肌病(2015) 鉴定了 COA6 基因中的纯合错义突变(W66R; 614772.0003)。
▼ 等位基因变异体(3 个选定示例):
.0001 线粒体复合物 IV 缺陷,核 13 型
COA6,TRP59CYS
Ghosh 等人在一名患有线粒体复合物 IV 缺陷核型 13(MC4DN13; 616501) 并患有致命性婴儿心脑肌病的男性婴儿中(2014) 鉴定了 COA6 基因中的复合杂合突变:半胱氨酸基序内的保守残基上的 trp59-to-cys(W59C) 和 glu87-to-ter(E87X; 614772.0002),导致缺乏第四个的截短蛋白质半胱氨酸,也在高度保守的半胱氨酸基序内。对酵母同系物的研究表明,突变导致突变 Coa6 的线粒体水平降低,并且突变蛋白无法挽救 Coa6 缺失酵母中的线粒体呼吸生长缺陷,这与功能丧失一致。斑马鱼胚胎中 coa6 基因的吗啡啉敲低会导致心脏发育和功能缺陷。Calvo 等人之前曾报道过该患者(2012)(患者 31) 合并氧化磷酸化缺陷,心脏组织中复合物 I 和 IV 的活性显着降低。
斯特劳德等人(2015) 发现 Ghosh 等人报道的患者心脏组织中几乎不存在复合物 IV(2014)和卡尔沃等人(2012),而成纤维细胞中的表达与对照相似。体外研究表明,W59C 突变体的表达只能部分恢复缺乏 COA6 的细胞中的复杂 IV 组装,表明 W59C 是一个亚等位基因。额外半胱氨酸残基的存在很可能损害最佳折叠和/或成熟,导致复杂 IV 生物发生的缺陷。
帕切-格劳等人(2015) 证明突变型 W59C 蛋白无法与 SCO2(604272) 或 COX2(MTCO2; 516040) 相互作用,并且被错误定位到线粒体基质。
.0002 线粒体复合物 IV 缺陷,核 13 型
COA6,GLU87TER
Ghosh 等人讨论了 COA6 基因中的 glu87-to-ter(E87X) 突变,该突变在患有线粒体复合物 IV 缺陷核型 13(MC4DN13; 616501) 的婴儿中以复合杂合状态发现(2014),参见 614772.0001。
.0003 线粒体复合物 IV 缺陷,核 13 型
COA6,TRP66ARG
Baerling 等人在一名阿拉伯血统近亲父母所生的女婴中,患有线粒体复合物 IV 缺陷核型 13(MC4DN13; 616501),并患有致命的婴儿心脑肌病(2015) 鉴定了 COA6 基因中的纯合 c.196T-C 转换(c.196T-C, NM_001012985.2),导致保守残基处的 trp66 到 arg(W66R) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在 dbSNP(版本 137)、1000 基因组计划或外显子组变异服务器数据库中未发现该突变。患者成纤维细胞缺乏 COA6 蛋白,线粒体复合物 IV 减少。用铜治疗患者成纤维细胞导致复合物 IV 及其亚基稳定增加,这表明了一种可能的治疗选择。