丝氨酸/精氨酸重复基质蛋白 1; SRRM1
- 富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子相关核基质蛋白,160-KD
- SR 相关核基质蛋白,160-KD; SRM160
HGNC 批准的基因符号:SRRM1
细胞遗传学位置:1p36.11 基因组坐标(GRCh38):1:24,643,302-24,673,281(来自 NCBI)
▼ 说明
前 mRNA 的合成和加工涉及广泛分布在整个细胞核中的因子,集中在两种类型的焦点、斑点和卷曲体中。 斑点中剪接因子的子集与核基质相关。 其中之一 SRM160 与 SRM300(606032) 形成复合物,充当前 mRNA 特异性剪接协调子(Blencowe et al., 1998)。
有关富含丝氨酸/精氨酸剪接因子 SR 家族的背景信息,请参阅 600812。
▼ 克隆与表达
Blencowe等通过生化纯化、微肽序列分析、EST数据库检索、筛选单核细胞cDNA文库(1998) 分离出编码 SRM160(160 kD SR 相关基质蛋白)和几种亚型的 cDNA。 推导的 820 个氨基酸的蛋白质富含 SR/RS 重复序列和脯氨酸残基。 SRM160 还具有多个假定的磷酸化位点和 SH3 结合基序,但没有 RNA 识别域。 Northern 印迹分析揭示了普遍存在的、可变表达的 3.8-kb 转录本和更受限制的 6.0-kb 转录本的表达。 免疫印迹分析表明,重组蛋白在核提取物中表达为160 kD 蛋白,并且通过磷酸酶处理可将其还原为120 kD 蛋白。 共聚焦显微镜证实了核斑点中 SRM160 的表达。 免疫沉淀分析检测到 SRM160 与 SRM300(606032)(一种核基质抗原)以及其他 2 种 SR 蛋白 SRp40(600914) 和 SRp75(601940) 的相互作用。 EMSA 分析表明,SRM160/SRM300 与前 mRNA 结合,并通过与 SR 家族蛋白的相互作用促进剪接。 SRM160/SRM300 与前 mRNA 之间的关联依赖于 RNU1(180680),并由 RNU2(180690) 稳定。
▼ 测绘
国际辐射混合测绘联盟将 SRM160 基因测绘到 1 号染色体(RH40469)。