DIS3 样 3-PRIME-5-PRIME 外核糖核酸酶 2; DIS3L2
DIS3 有丝分裂控制,酿酒酵母,同源样 2
HGNC 批准的基因符号:DIS3L2
细胞遗传学位置:2q37.1 基因组坐标(GRCh38):2:231,961,713-232,344,350(来自 NCBI)
▼ 说明
RNA 外泌体是一种大约 400 kD 的多聚核糖核酸复合物,参与 RNA 加工和多种 RNA 底物降解中的核酸内切和 3-prime/5-prime 外切核酸活性。DIS3L2 与具有 3-prime/5-prime 核酸外切活性的催化外泌体亚基具有高度序列相似性(Tomecki 等人总结,2010)。
▼ 克隆与表达
Staals 等人通过在人类基因组数据库中搜索与 DIS3L(614183) 相似的序列(2010) 鉴定了 DIS3L2 的 5 种潜在剪接变体。最长的推导蛋白质含有 885 个氨基酸,计算分子量为 99.2 kD。它具有保守性较差的 N 端 PIN 结构域,随后是冷休克结构域、推定的 RNB 核酸外切酶催化结构域和可能的 C 端 S1 RNA 结合结构域。
▼ 生化特征
晶体结构
添加到 pre-let7 的oligoU 尾(参见 MIRLET7A1, 605386)充当 pre-let7 被 DIS3L2 快速降解的信号。为了研究 DIS3L2 底物识别的机制,Faehnle 等人(2014) 确定了小鼠 Dis3l2 与oligoU RNA 复合物的晶体结构,以模拟 pre-let7 的尿苷化尾部。三个 RNA 结合结构域在催化结构域的一个面上形成一个开放漏斗,使 RNA 能够通过不同于其外泌体对应物的路径到达活性位点。由此产生的路径揭示了尿嘧啶特异性相互作用的广泛网络,跨越寡聚尾RNA的前12个核苷酸。法恩勒等人(2014) 确定了 3 个 U 特异性区域,解释了 DIS3L2 如何在 LIN28(611043)-LET7 途径的最后一步中识别、结合和处理尿苷化前 LET7。
▼ 测绘
Hartz(2011) 根据 DIS3L2 序列(GenBank BC030113) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 DIS3L2 基因对应到染色体 2q37.2。
▼ 基因功能
在转染的 COS-7 和 HeLa 细胞中,Astuti 等人(2012) 观察到 DIS3L2 主要位于细胞质中。使用转染的 HEK293 细胞进行的 RNA 降解测定表明 DIS3L2 具有核酸外切酶活性。HeLa 细胞中的敲除研究表明,DIS3L2 失活与有丝分裂异常和有丝分裂检查点蛋白的表达改变相关,其中 TTK(604092)、aurora B(AURKB; 604970) 和磷酸化 CDC25C(157680) 的表达降低,但细胞周期蛋白的表达上调B1(CCNB1;123836)、RAD21(606462)和 securin(PTTG1;604147)。DIS3L2 过表达抑制了人类癌细胞系的生长,而敲低则增强了这些细胞的生长。阿斯图蒂等人(2012) 得出结论,DIS3L2 在 RNA 代谢中发挥着关键作用,对于细胞生长和分裂的调节至关重要。
多能性因子 LIN28(611043) 通过与 pre-LET7 RNA 结合并招募 RNA 尿苷基转移酶 ZCCHC11(613692) 和 ZCCHC6(613467) 使 pre-LET7 尿苷酸化,从而阻断发育过程中未分化细胞中 LET7(605386) microRNA 的表达。降解尿苷化 pre-LET7 的 RNase 的身份尚不清楚。张等人(2013) 鉴定出 Dis3l2 是负责小鼠胚胎干细胞中尿苷化 pre-let7 衰变的 3-prime-5-prime 核酸外切酶。生化重建测定表明,3-prime 寡尿苷化可在体外刺激 Dis3l2 活性,而小鼠胚胎干细胞中 Dis3l2 的敲低可导致 pre-let7 的稳定。张等人。
▼ 分子遗传学
Astuti 等人在来自 6 个患有 Perlman 综合征(PRLMNS; 267000) 家族的 8 名受影响个体中(2012) 鉴定了 DIS3L2 基因突变的纯合性或复合杂合性(614184.0001-614184.0004)。
▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):
.0001 帕尔曼综合症
DIS3L2、82.8-KB DEL、EX6DEL
Astuti 等人在来自巴基斯坦近亲家庭的一对患有帕尔曼综合征(267000) 的兄妹中(2012) 鉴定了 DIS3L2 基因外显子 5 和 7 之间 82.8 kb 缺失(367-41553_602+40962del) 的纯合性,导致 258 个氨基酸的截短蛋白质。HEK293 细胞的功能研究表明,缺乏外显子 6 的突变体 DIS3L2 核糖核酸酶活性显着降低。该突变在家族中随疾病分离,并且在至少 300 个祖先匹配的样本中未发现。哥哥在 3.5 岁时去世,妹妹在 2 个月大时去世。
.0002 帕尔曼综合症
DIS3L2、22-KB DEL、EX9DEL
Henneveld 等人先前报道,来自 2 个荷兰家庭的 3 名患有 Perlman 综合征的患者(267000)(1999),以及一名患有这种综合征的无关荷兰婴儿,Astuti 等人(2012) 鉴定了 DIS3L2 基因外显子 8 和 10 之间大约 22 kb 缺失(951-?_1124+?del) 的纯合性,导致 RNB 结构域(gln318_arg375del) 丢失。HEK293 细胞的功能研究表明,缺乏外显子 9 的突变体 DIS3L2 核糖核酸酶活性显着降低。该突变在两个家族中随疾病分离,并且在至少 300 个祖先匹配的样本中未发现。4 名荷兰患者全部在婴儿期死亡。此外,在来自帕尔曼综合征男性患者 30 周羊水样本的细胞系中,
.0003 帕尔曼综合症
DIS3L2, CYS489TYR
讨论 Astuti 等人在 Perlman 综合征(267000) 患者的复合杂合状态下发现的 DIS3L2 基因中的 cys489-to-tyr(C489Y) 突变(2012),参见 614184.0002。
.0004 帕尔曼综合症
DIS3L2,IVS19,GA,+5
Neri 等人先前报道,在取自一名患有 Perlman 综合征(267000) 的 14 岁女孩的细胞系中(1984),阿斯图蒂等人(2012) 在 DIS3L2 基因的外显子 19(2394+5G-A) 中发现了杂合性 G 到 A 的转变,预计会导致外显子 19 的跳跃或缺失。该突变随家族中的疾病而分离,但并不存在。在至少 300 个祖先匹配的对照样本中发现。虽然没有检测到第二个突变,但只发现了缺少外显子 19 的转录本,这表明存在另一种可能废除转录或导致 mRNA 不稳定的突变。