蛋白质 O-甘露糖基转移酶 2; POMT2
HGNC 批准的基因符号:POMT2
细胞遗传学位置:14q24.3 基因组坐标(GRCh38):14:77,274,956-77,320,883(来自 NCBI)
▼ 说明
POMT2 基因编码内质网(ER) 的整合膜蛋白,该蛋白与酿酒酵母的 O-甘露糖基转移酶蛋白家族具有显着的序列相似性。POMT1(606822) 和 POMT2 蛋白催化 α-肌营养不良聚糖(DAG1; 128239) 上发现的 O-甘露糖基聚糖合成的第一步(van Reeuwijk 等人总结,2005)。
▼ 克隆与表达
通过EST数据库搜索酵母Pmt序列作为查询,Willer等人(2002) 确定了 POMT2。他们从小脑 cDNA 文库中组装了全长 POMT2 cDNA。推导的 750 个氨基酸的蛋白质具有 7 次跨膜螺旋结构,其中央亲水结构域两侧是 5 个 N 端和 2 个 C 端跨膜区。与 Pmt 家族的其他已知成员一样,它缺乏典型的 ER 靶向或保留信号,并包含 5 个 N-糖基化位点。POMT2 与人 POMT1 具有 36% 的序列同一性,与小鼠 Pomt2 具有 91% 的序列同一性,与酵母 Pmt 酶具有 33% 至 37% 的序列同一性。系统发育分析显示与酵母 Pmt2 亚家族最相似。RNA点印迹分析检测到小鼠Pomt2在所有检查组织中的表达,其中睾丸的表达量比其他组织高约7倍。Northern blot分析检测到2.7 kb和4.7 kb的2种mRNA。较短的转录本存在于所有测试的小鼠体细胞组织中。较长的转录物仅在睾丸中表达并编码睾丸特异性亚型。小鼠睾丸的原位杂交和免疫定位表明,Pomt2 定位于成熟的精子细胞,并且在顶体内含量丰富。HEK 293 细胞中无法检测到 POMT2 的内源表达;然而,转染和表达后,POMT2 稳定表达为 83 kD 蛋白,在细胞分级后与膜结合。用糖苷内切酶 H 处理表明,5 个潜在 N-糖基化位点中至少有 2 个被利用。免疫定位显示与 ER 标记蛋白 ERp72(PDIA4; 620018) 共定位的强烈核周和网状染色。
▼ 基因结构
威勒等人(2002) 确定 POMT2 基因包含 21 个外显子,跨度 46 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Willer 等人(2002) 将 POMT2 基因定位到染色体 14q24.3。
▼ 分子遗传学
POMT2 基因突变可导致 3 种不同形式的肌营养不良-肌营养不良症(MDDG):一种严重的先天性脑部和眼部异常(A2 型;MDDGA2;613150),以前称为 Walker-Warburg 综合征(WWS) 或肌眼症-脑部疾病(MEB);智力发育受损的较轻的先天性类型(B2 型;MDDGB2;613156);以及较温和的肢带形式(C2 型;MDDGC2;613158),也称为 LGMDR14 和 LGMD2N。
范·雷乌韦克等人(2005) 对 6 个不相关的 Walker-Warburg 综合征家族(MDDGA2; 613150) 的 POMT2 基因进行了测序,并分别在 3 个家族中鉴定了纯合突变(607439.0001-607439.0003)。
布谢特等人(2007) 在 41 个家庭中的 13 个(32%) 中发现了 POMT1 基因突变(607423),其中至少有 1 个胎儿患有严重的 II 型无脑畸形。最低诊断标准包括脑积水、无脑脑膜、充满神经胶质异位的软脑膜增厚、皮质带紊乱和小脑发育不良。分别在 6 个(15%) 和 3 个(7%) 个家族中发现 POMGNT1(606822) 和 POMT2 基因突变。总体而言,研究中 41 个家庭中的 22 个家庭中发现了突变。在 FKRP(606596)、FKTN(607440) 或 LARGE(603590) 基因中未发现明确的致病性突变。
戈弗雷等人(2007) 在 92 名患者中发现了 10 名 POMT2 突变,这些患者因 α-肌营养不良聚糖的糖基化缺陷而患有肌营养不良症。7 名患者患有 MEB(MDDGA2;613150),2 名同胞患有先天性肌营养不良症伴智力迟钝(MDDGB2;613156),1 名患有肢带型肌营养不良症(MDDGC2;613158)(参见例如 607439.0004)。所有人的智商都很低,而且大多数人都有大脑结构异常。
麦库里等人(2009) 在 81 名患有肌聚糖病的意大利患者中,有 9 名(11%) 发现了 POMT2 突变。3 名患者的 MRI 变化正常或微小,3 名患者患有小脑发育不全,2 名患者患有 MEB,1 名患者患有 1 型 Chiari 畸形。所有患者均患有智力低下,除 1 名患者外,所有患者均患有小头畸形(参见例如 607439.0014-607439.0016)。没有观察到明确的基因型-表型相关性;然而,更严重的表型似乎与预计会导致基因严重破坏的突变有关。
柳泽等人(2009) 在 5 名不相关的先天性肌营养不良症和智力迟钝患者中鉴定出 POMT2 基因的 8 种不同突变(例如,607439.0004;607439.0017-607439.0019)。3 名患者和 1 名患者的同胞具有更严重的表型,与 MDDGA2 一致,2 名患者的表型稍轻,没有脑发育不良,与 MDDGB2 一致。其中两个突变是涉及基因多个外显子的缺失,另外两个突变是剪接位点突变。柳泽等人(2009)指出,标准测序可能会遗漏较大的基因内缺失和剪接位点突变。
▼ 等位基因变异体(19 个选定示例):
.0001 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,2
POMT2,ARG638TER
van Reeuwijk 等人在一名患有 Walker-Warburg 综合征(MDDGA2; 613150) 的近亲父母出生的摩洛哥患者中(2005) 鉴定了 POMT2 基因外显子 19 中 1912C-T 转换的纯合性,导致 arg638 至 ter(R638X) 取代。该突变之前有一个已知的多态性,1911G-T。在 170 条对照染色体中未发现该突变。
.0002 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,2
POMT2,IVS8DS,GA,+1
van Reeuwijk 等人在一名患有 Walker-Warburg 综合征(MDDGA2; 613150) 的巴基斯坦患者中,由近亲结婚生(2005) 鉴定了 POMT2 基因内含子 8 中 G 到 A 转变(1005+1G-A) 的纯合性,预计会导致供体位点破坏。在 290 条对照染色体中未发现该突变。
.0003 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,2
POMT2,1-BP DEL,1261C
van Reeuwijk 等人在 2 名患有 Walker-Warburg 综合征(MDDGA2;613150)的同胞中(2005) 鉴定出 POMT2 基因外显子 12 中 1 bp 缺失(1261delC) 的纯合性,导致提前终止密码子(T433X)。孟加拉人的表亲父母的突变是杂合的,在 140 条对照染色体中没有发现这种突变。
.0004 肌营养不良-肌营养不良症(先天性智力发育障碍),B 型,2 型
肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型、2 型,包括
POMT2、TYR666CYS
Yanagisawa 等人在 2 名患有先天性肌营养不良症和严重智力低下(MDDGB2;613156)的无关患者中(2007) 鉴定了 POMT2 基因外显子 19 中的纯合 1997A-G 转换,导致高度保守残基中的 tyr666 至 cys(Y666C) 取代。这些患者分别是摩洛哥和法国血统。单倍型分析表明存在创始人效应。另外两名具有相似表型的患者为 Y666C 和另一种致病性 POMT2 突变(W647X;607439.0005 和 W748R;607439.0006)的复合杂合子。
戈弗雷等人(2007) 在 2 位患有先天性肌营养不良症和低智商的同胞中发现了纯合 Y666C 替代。两名患者均在婴儿期发病且血清肌酸激酶升高。一个实现了行走,另一个实现了坐着。其中一名患有挛缩、肌肉肥大和小头畸形。另一人患有小脑发育不全、小阴茎和隐睾。
戈弗雷等人(2007) 在一名被归类为肌眼脑疾病(MDDGA2; 613150) 的患者中发现了纯合 Y666C 突变。据报道,该患者于 4 岁时发病,从未能够行走,并且血清肌酸激酶升高、肌肉肥大、小头畸形、智商低和脑膨出。另外两名患有肌眼脑疾病的患者是 Y666C 和另一种致病性 POMT2 突变的复合杂合子(参见例如 R413P;607439.0007)。
麦库里等人(2009) 在一位意大利患者中鉴定出 Y666C 和 G246D(607439.0016) 的复合杂合性,该患者患有先天性肌营养不良、小头畸形、智力低下,但脑部 MRI 正常,白质变化极小。
柳泽等人(2009)报道了 3 名不相关的法国患者,他们是 Y666C 突变和 POMT2 基因另一种致病性突变的复合杂合子。两名患有MDDGB2的患者是Y666C和另一种致病性突变的复合杂合子(参见例如607439.0017),而第三名患者具有更严重的MDDGA2表型并携带Y666C和POMT2基因的几个外显子的缺失。
.0005 肌营养不良-肌营养不良症(先天性智力发育受损),B 型,2
POMT2,TRP647TER
Yanagisawa 等人在一名患有先天性肌营养不良症和智力发育障碍(MDDGB2; 613156) 的 14 岁男孩中(2007) 鉴定了 POMT2 基因中 2 个突变的复合杂合性:Y666C(607439.0004) 和外显子 19 中的 1941G-A 转变,导致 trp647-to-ter(W647X) 取代。他患有先天性肌张力低下、挛缩、小头畸形、轻度近视、脑萎缩和小脑发育不全。他只做到了坐着。
.0006 肌营养不良-肌营养不良症(先天性智力发育受损),B 型,2
POMT2,TRP748ARG
Yanagisawa 等人在一名患有先天性肌营养不良症和智力发育障碍的 6 岁法国男孩中(MDDGB2;613156)(2007) 鉴定了 POMT2 基因中 2 个突变的复合杂合性:Y666C(607439.0004) 和外显子 21 中的 2242T-C 转变,导致 trp748 到 arg(W748R) 的取代。他患有先天性肌张力低下、挛缩、小头畸形、轻度斜视、脑萎缩和小脑发育不全。他只做到了坐着。
.0007 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,2
POMT2,ARG413PRO
Godfrey 等人在患有肌眼脑疾病(MDDGA2; 613150) 的患者中(2007) 鉴定了 POMT2 基因中 2 个突变的复合杂合性:外显子 11 中的 1238G-C 颠换,导致 arg413 到 pro(R413P) 取代,以及 Y666C(607439.0004)。虽然临床细节有限,但该患者在 7 个月大时发病,从未坐立,并有挛缩、远视、脑积水、脑白质改变和小脑囊肿。
.0008 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,2
POMT2,VAL373PHE
Godfrey 等人在患有肌眼脑疾病(MDDGA2; 613150) 的患者中(2007) 鉴定了 POMT2 基因中 2 个突变的复合杂合性:外显子 10 中的 1117G-T 颠换导致 val373-to-phe(V373F) 取代,以及外显子 5 中的 593T-A 颠换导致 ile198-to -asn(I198N; 607439.0009) 替换。患者新生儿发病,血清肌酸激酶升高、挛缩、肌肉肥大、脊柱侧弯。他只能坐着。其他特征包括先天性白内障、低智商、小头畸形、癫痫发作、脑干异常、脑积水和脑白质变化。
.0009 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,2
POMT2,ILE198ASN
讨论 Godfrey 等人在患有肌眼脑疾病(MDDGA2; 613150) 的患者中以复合杂合状态发现的 POMT2 基因中的 ile198-to-asn(I198N) 突变(2007),参见 607439.0008。
.0010 肌营养不良-肌营养不良病(肢带),C 型,2
POMT2,THR184MET
Biancheri 等人对一名患有肢带型肌营养不良症(MDDGC2; 613158) 的 5 岁意大利女孩进行了研究(2007) 鉴定出 POMT2 基因外显子 5 中的纯合 551C-T 转换,导致蛋白质活性位点的保守残基发生 thr184 至met(T184M) 取代。在 200 名对照者中未发现该突变。她在出生第一年就表现出正常的精神运动发育,但在 18 个月大时才学会走路。体格检查显示小腿肥大,血清肌酸激酶升高,轻度肌无力。肌肉活检显示营养不良变化、炎症变化和α-肌营养不良聚糖严重减少。脑部 MRI、眼科检查和认知发育均正常。
在患有肢带型肌营养不良症的患者中,戈弗雷等人(2007) 鉴定了 POMT2 基因中 2 个突变的复合杂合性:T184M 和外显子 21 中的 2243G-C 颠换,导致 trp748-to-ser(W748S; 607439.0011) 取代。尽管临床细节有限,但该患者于 18 个月时发病,血清肌酸激酶升高、肌肉肥大、智商低,超声心动图显示右束支传导阻滞,并能行走。未进行 MRI 检查。
.0011 肌营养不良-肌营养不良病(肢带),C 型,2
POMT2,TRP748SER
讨论 Godfrey 等人在肢带型肌营养不良症(MDDGC2; 613158) 患者中以复合杂合状态发现的 POMT2 基因中的 trp748-to-ser(W748S) 突变(2007),参见 607439.0010。
.0012 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,2
POMT2,GLY353SER
Mercuri 等人对一名患有肌眼脑疾病(MDDGA2; 613150) 的 11 岁意大利女孩进行了研究(2006) 鉴定了 POMT2 基因中 2 个突变的复合杂合性:外显子 9 中的 1057G-A 转换导致 gly353 至 Ser(G353S) 取代,以及外显子 21 中的 2177G-A 转换导致 gly726 至 Ser(G353S) 取代。 -glu(G726E; 607439.0013) 取代。孕28周时产前超声检查发现脑室扩张、小脑蚓部发育不全。出生后,她的肌张力低下,从未实现孤立坐立。她表现出生长发育不良、呼吸功能不全、严重智力低下、只会说话、小头畸形、严重肌无力、巨舌、挛缩、下肢肌肉肥大。脑部 MRI 显示小脑蚓部和脑桥发育不全,
.0013 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,2
POMT2,GLY726GLU
Mercuri 等人讨论了 POMT2 基因中的 gly726-to-glu(G726E) 突变,该突变在肌眼脑疾病(MDDGA2;613150) 患者的复合杂合状态下被发现(2006),参见 607439.0012。
.0014 肌营养不良-肌营养不良症(先天性智力发育受损),B 型,2
POMT2,GLY353SER
Mercuri 等人在一名患有先天性肌营养不良、小脑发育不全、小头畸形和智力发育受损的意大利患者中(MDDGB2; 613156)(2009) 鉴定了 POMT2 基因中 2 个突变的复合杂合性:外显子 9 中的 1057G-A 转换导致 gly353 到 Ser(G353S) 取代,以及外显子 21 中的 2177G-A 转换导致 gly726- to-glu(G726E; 607439.0015) 取代。
.0015 肌营养不良-肌营养不良症(先天性智力发育受损),B 型,2
POMT2,GLY726GLU
讨论 Mercuri 等人在患有先天性肌营养不良、小脑发育不全、小头畸形和智力发育受损(MDDGB2; 613156) 的患者中以复合杂合状态发现的 POMT2 基因中的 gly726-to-glu(G726E) 突变(2009),参见 607439.0014。
.0016 肌营养不良-肌营养不良症(先天性智力发育受损),B 型,2
POMT2,GLY246ASP
讨论 Mercuri 等人在患有先天性肌营养不良、小头畸形和智力发育受损(MDDGB2; 613156) 的患者中以复合杂合状态发现的 POMT2 基因中的 gly246-to-asp(G246D) 突变(2009),参见 607439.0004。
.0017 肌营养不良-肌营养不良症(先天性智力发育受损),B 型,2
POMT2,IVS1DS,GC,+5
Yanagisawa 等人在一名患有先天性肌营养不良症、小头畸形和智力发育障碍(MDDGB2; 613156) 的 4 岁法国男孩中进行了研究(2009) 鉴定了 POMT2 基因中 2 个突变的复合杂合性:Y666C(607439.0004) 和内含子 1 中的 G-C 颠换,导致异常剪接和过早的蛋白质截断。患者患有智力低下、小头畸形、先天性肌张力低下和血清肌酸激酶升高,但可以无支撑地坐着。他没有脑发育不良,也没有眼部、脑干或小脑异常,但影像学显示顶叶枕区有一些白质异常。
.0018 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,2
POMT2,IVS12AS,GA,-14
Yanagisawa 等人对一名患有先天性肌营养不良症并伴有大脑和眼睛异常的 5 岁葡萄牙男孩(MDDGA2; 613150) 进行了研究(2009) 在 POMT2 基因的内含子 12(133-14G-A) 中鉴定出纯合的 G 到 A 转变,从而产生新的剪接受体位点,并预测在外显子 12 和 13 之间插入 4 个氨基酸。在来自阿根廷血统无关家族的 2 名 MDDGA2 同胞中,作者鉴定了 IVS12 突变和 1445G-T 颠换的复合杂合性,导致第三个保守残基中的 gly482 至 val(G482V;607439.0019)取代MIR 域。3例患者均患有小头畸形、严重智力低下、脑发育不良、小脑发育不全、先天性肌张力低下,只能坐立。
.0019 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,2
POMT2,GLY482VAL
Yanagisawa 等人讨论了 POMT2 基因中的 gly482-to-val(G482V) 突变,该突变在伴有脑部和眼部异常的先天性肌营养不良症(MDDGA2; 613150) 患者的复合杂合状态下发现(2009),参见 607439.0018。