谷氨酰-tRNA 酰胺转移酶,C 亚基; GATC
- 谷氨酰-tRNA-GLN 酰胺转移酶,C 亚基,线粒体
HGNC 批准的基因符号:GATC
细胞遗传学位置:12q24.31 基因组坐标(GRCh38):12:120,446,444-120,463,749(来自 NCBI)
▼ 说明
GATC 基因编码谷氨酰-tRNA(Gln) 酰胺转移酶蛋白复合物(GatCAB) 的一个亚基,该亚基在线粒体谷氨酰胺酰 mt-tRNA(mt-tRNA(Gln)) 的正确氨酰化中发挥作用。 酶复合物中的其他 2 个亚基是 GATA(QRSL1;617209) 和 GATB(603645)。 该复合物在线粒体翻译和蛋白质合成中发挥着重要作用(Friederich 等人总结,2018)。
▼ 基因功能
长尾等人(2009) 发现重组人线粒体 GLURS(EARS2; 612799) 作为一种非歧视性 glu-tRNA 合成酶发挥作用,可谷氨酰化来自牛肝或人胎盘的线粒体 tRNA(glu)(MTTE; 590025) 和 tRNA(gln)(MTTQ; 590030) 形成丙氨酰化 glu-tRNA(gln) 和正确氨酰化 gln-tRNA(gln)。 在第二个反应中,由 QRSL1、GATB 和 GATC 组成的三聚体 glu-tRNA(gln) 酰胺转移酶复合物在酰胺供体(gln 或 NH( 4+))。 HeLa 细胞中酰胺转移酶复合物的任何亚基的敲低,或缺乏酰胺供体,都会导致 glu-tRNA(gln) 的积累。
▼ 测绘
Hartz(2016) 根据 GATC 序列(GenBank AK094319) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 GATC 基因对应到染色体 12q24.31。
▼ 分子遗传学
Friederich 等人在来自 2 个据称不相关的德鲁兹血统近亲家庭(家庭 4 和 5)的 6 名患者中,合并氧化磷酸化缺陷 42(COXPD42;618839)(2018) 在 GATC 基因(M78R; 617210.0001) 的中等保守残基处发现了纯合错义突变。 该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在两个家族中都与该疾病分离。 分子模型预测该突变可能会干扰 GATC 和 QRSL1 之间的相互作用。 患者来源的成纤维细胞显示 GatCAB 复合物和 GATC 蛋白水平降低(对照的 20%),以及 QRSL1 和 GATB 蛋白水平降低。 GATC mRNA 水平正常,表明单个亚基在未纳入 GatCAB 复合体时不稳定。 对患者成纤维细胞的体外研究表明,mt-tRNA(Gln)的氨酰化受损,并且线粒体蛋白质合成存在普遍缺陷,这种缺陷在应激条件下会加剧。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 联合氧化磷酸化缺陷 42
GATC、MET78ARG
Friederich 等人在来自 2 个据称不相关的德鲁兹血统近亲家庭(家庭 4 和 5)的 6 名患者中,合并氧化磷酸化缺陷 42(COXPD42;618839)(2018) 鉴定了 GATC 基因中的纯合 c.233T-G 颠换(c.233T-G,NM_176818),导致中等保守残基处的 met78 到 arg(M78R) 取代。 该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在两个家族中都与该疾病分离。 该变体已根据公共数据库进行过滤。 分子模型预测该突变可能会干扰 GATC 和 QRSL1 之间的相互作用。 患者来源的成纤维细胞显示 GatCAB 复合物和 GATC 蛋白水平降低(对照的 20%),以及 QRSL1 和 GATB 蛋白水平降低。 GATC mRNA 水平正常,表明单个亚基在未纳入 GatCAB 复合体时不稳定。 对患者成纤维细胞的体外研究表明,mt-tRNA(Gln)的氨酰化受损,并且线粒体蛋白质合成存在普遍缺陷,这种缺陷在应激条件下会加剧。