HAS2 反义 RNA 1; HAS2AS1
- 透明质酸合酶 2,反义; HASNT
HGNC 批准的基因符号:HAS2-AS1
细胞遗传学位置:8q24.13 基因组坐标(GRCh38):8:121,639,346-121,645,325(来自 NCBI)
▼ 说明
透明质酸(HA) 是一种线性、未修饰的糖胺聚糖聚合物,是细胞外基质的常见且必需的成分。 HA 由包括 HAS2(601636) 在内的酶家族合成。 HAS2AS1 是一种非编码 RNA,通过控制 HAS2 表达来调节 HAS2 酶活性(Chao 和 Spicer,2005)。
▼ 克隆与表达
通过EST数据库分析,Chao和Spicer(2005)发现了源自HAS2AS1基因的序列,他们将其称为HASNT,位于HAS2基因的相反链上。 他们鉴定了 HASNT 的短剪接变体和长剪接变体,分别称为 S-HASNT 和 L-HASNT。 S-HASNT的174个核苷酸和L-HASNT的257个核苷酸与HAS2转录起始位点附近的非编码区互补。 Chao 和 Spicer(2005) 还克隆了小鼠 S-Hasnt 和 L-Hasnt。 小鼠和人类 HASNT 序列都含有短 ORF,但这些 ORF 不保守且不太可能表达。 U2-OS 人骨肉瘤细胞和骨骼肌的 Northern 印迹分析检测到约 6.6 kb 的 HASNT 转录本。 骨骼肌还表达 2-kb HASNT 转录本。 半定量 RT-PCR 显示皮肤、前列腺、子宫和唾液腺中 HASNT 表达最高。 在人类细胞系、原代人真皮成纤维细胞和小鼠胚胎成纤维细胞系中检测到两种 HASNT 剪接变体。
▼ 基因功能
Chao 和 Spicer(2005) 发现 U2-OS 细胞中 L-HASNT 或 S-HASNT 的表达会降低 HAS2 表达和 HA 生物合成,并减缓细胞增殖。 添加外源HA并不能挽救增殖缺陷。 然而,HAS3(602428) 的表达使 HA 合成和细胞生长恢复到高于未转染 L-HASNT 或 S-HASNT 的对照细胞中测量的水平。
迈克尔等人(2011) 发现用 IL1B(147720) 或 TGF-β-1(TGFB1; 190180) 处理人肾近端肾小管上皮细胞(PTC) 后,HAS2 和 HAS2AS1 的表达均上调。 敲低和过表达研究表明,IL1B 通过 SP1(189906)/SP3(601804) 发挥作用,TGF-β-1 通过 SMAD2(601366)/SMAD3(603109) 发挥作用。 HAS2AS1 的敲低阻止了 IL1B 对 HAS2AS1 和 HAS2 表达的诱导,表明 HAS2AS1 可以稳定 HAS2 mRNA。 计算机分析表明,L-HAS2AS1 和 S-HAS2AS1 都可以与 HAS2 形成热力学稳定的双链体。 消化实验证实 PTC 细胞质 RNA 中存在核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶抗性 HAS2AS1-HAS2 双链体。 迈克尔等人(2011) 得出结论,HAS2AS1 可以稳定 HAS2 mRNA,并表明 HAS2AS1 的功能可能是细胞类型特异性的。
▼ 基因结构
Chao 和 Spicer(2005) 确定 HAS2AS1 基因至少包含 4 个外显子和 2 个聚腺苷酸化序列。
迈克尔等人(2011) 表明 HAS2AS1 具有功能性近端启动子,具有 SP1/SP3 和 SMAD 蛋白的结合位点。
▼ 测绘
Chao 和 Spicer(2005) 确定 HAS2AS1 基因位于 HAS2 基因的相反链上,对应到染色体 8q24.13。 HAS2AS1的外显子1与HAS2的内含子1的部分重叠,HAS2AS1的外显子2与HAS2的外显子1的部分重叠,HAS2AS1的外显子3和4与HAS2的近端启动子区域的部分重叠。