磷脂酰肌醇聚糖锚生物合成 U 类蛋白; PIGU

  • 细胞分裂周期 91,酿酒酵母,同源样 1;CDC91L1

HGNC 批准的基因符号:PIGU

细胞遗传学位置:20q11.22 基因组坐标(GRCh38):20:34,560,542-34,677,092(来自 NCBI)

▼ 说明

许多真核蛋白通过糖基磷脂酰肌醇(GPI) 锚定在细胞表面,GPI 在内质网的 GPI 转酰胺酶翻译后连接到其 C 末端。PIGU 是哺乳动物 GPI 转酰胺酶的一个关键亚基(Hong 等,2003)。

有关 PIG 基因家族以及 PIG 蛋白在 GPI 生物合成中的作用的信息,请参阅 PIGA(311770)。

▼ 克隆与表达

Hong 等人通过对大鼠 cDNA 表达文库进行功能筛选,寻找补充 GPI 生物合成缺陷的仓鼠细胞系的克隆(2003)克隆大鼠皮古。通过数据库分析,然后对成纤维细胞 cDNA 文库进行 PCR,他们克隆了人类 PIGU。推导的 435 个氨基酸蛋白包含 9 个假定的跨膜结构域,与大鼠 Pigu 具有 97% 的同一性。SDS/PAGE 分析表明 PIGU 的表观分子质量为 38 kD。

郭等人(2004) 发现 CDC91L1 普遍表达。

▼ 基因功能

通过对表达表位标记的 GPI 转酰胺酶亚基 Gpi8(605087) 的中国仓鼠卵巢细胞进行亲和层析,Hong 等人(2003)纯化了仓鼠GPI转酰胺酶复合物并证实了复合物中Pigu的存在。缺乏 Pigu 的细胞形成复合物,但无法切割 GPI 附着信号肽,而这是蛋白质 C 端 GPI 修饰的先决条件。通过定点诱变,Hong 等人(2003) 鉴定了一个短的功能重要区域(氨基酸 273 至 289),与长链脂肪酸延伸酶中的保守区域相似。

▼ 基因结构

洪等人(2003) 确定 CDC91L1 基因包含 12 个外显子,跨度约为 110 kb。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Hong 等人(2003) 将 CDC91L1 基因对应到染色体 20q11。

郭等人(2004) 在 20q11.22 处鉴定了 CDC91L1 基因,这是来自膀胱癌患者的易位断点位点。

▼ 分子遗传学

郭等人(2004) 在患有复发性尿上皮癌和其他恶性肿瘤的家族中发现 CDC91L1 紧邻种系易位 t(5;20)(p15;q11)。在该区域检查的所有基因中,CDC91L1 在先证者的尿上皮细胞中显示出最高水平的过度表达。易位断点对应到 CDC91L1 的推定启动子区域,表明该基因是受易位影响的主要靶标。CDC91L1 在大约三分之一的膀胱癌细胞系和原发性肿瘤以及用人乳头瘤病毒 E7 转化的致癌尿路上皮细胞中扩增和过表达。在体外和体内强制过度表达 CDC91L1 恶性转化的 NIH 3T3 成纤维细胞。

伴有大脑异常、癫痫发作和脊柱侧弯的神经发育障碍

Knaus 等人在来自 3 个不相关家庭的 5 名患有神经发育障碍(伴有脑部异常、癫痫发作和脊柱侧弯)的患者中(NEDBSS; 618590)(2019) 鉴定了 PIGU 基因中的纯合错义突变(I70K, 608528.0001 和 N383K, 608528.0002)。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,在两个家族中都与疾病分离。患者粒细胞的流式细胞术分析显示出特征性模式,CD16(参见例如146740)和CD24(600074)的细胞表面表达减少,但CD55(125240)或CD59(107271)的细胞表面表达没有减少。此外,患者 B 细胞显示出由特定抗体 T5 确定的游离 GPI 锚的表达增加。研究结果表明 PIGU 突变降低了 GPI 转酰胺酶复合物的功能,导致游离 GPI 锚在细胞表面积累。与野生型相比,PIGU 缺陷细胞中 N383K 变体的表达显示出对 GPI-AP 表达的拯救效率较低,这与该突变蛋白的功能受损一致。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):

.0001 神经发育障碍,伴有大脑异常、癫痫发作和脊柱侧弯
Pigu,ILE70LYS

Knaus 等人在 2 名同胞中,由近亲土耳其父母出生(家庭 1),患有神经发育障碍,伴有脑部异常、癫痫发作和脊柱侧凸(NEDBSS; 618590)(2019) 在 PIGU 基因的外显子 3 中鉴定出纯合 c.209T-A 颠换(c.209T-A,NM_080476.4),导致第一个 ER 管腔结构域中的 ile70 到 lys(I70K) 替换跨膜结构域 1 和 2。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与该家族中的疾病分离,并且在 gnomAD 数据库中未发现。

.0002 伴有大脑异常、癫痫发作和脊柱侧弯的神经发育障碍
Pigu,ASN383LYS

Knaus 等人在来自 2 个不相关家庭(家庭 2 和 3)的欧洲和挪威血统的 3 名患者中,患有神经发育障碍,伴有脑部异常、癫痫发作和脊柱侧凸(NEDBSS; 618590)(2019) 在 PIGU 基因的外显子 11 中鉴定出纯合 c.1149C-A 颠换(c.1149C-A,NM_080476.4),导致跨膜之间的 ER 腔结构域中 asn383 替换为 lys(N383K)结构域 9 和 10。该突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,在两个家族中与该疾病分离。它仅在 gnomAD 数据库中以低频率杂合状态被发现(277,194 个等位基因中的 7 个)。与野生型相比,PIGU 缺陷细胞中 N383K 变体的表达显示出对 GPI-AP 表达的拯救效率较低,这与突变蛋白功能受损一致。