长基因间非编码 RNA 958; LINC00958
- lincRNA 958
- 膀胱癌相关转录 2; BLACAT2
HGNC 批准的基因符号:LINC00958
细胞遗传学位置:11p15.3 基因组坐标(GRCh38):11:12,979,534-12,989,548(来自 NCBI)
▼ 说明
长基因间非编码 RNA,例如 LINC00958,是超过 200 个核苷酸的转录物,没有编码潜力。 LINC00958 促进膀胱癌(109800) 相关的淋巴管生成和淋巴转移(He et al., 2018)。
▼ 克隆与表达
He 等人使用微阵列分析(2018) 发现了 LINC00958,他们将其称为 BLACAT2,基于与邻近正常组织相比,其在高级肌肉浸润性膀胱癌组织中的上调。 RACE 表明,全长 BLACAT2 在人膀胱癌细胞系中含有 1,120 个核苷酸。 原位杂交和亚细胞分级显示BLACAT2主要定位于膀胱癌细胞的细胞核。 数据库分析表明,BLACAT2 表达在多种类型的人类癌症中显着上调。
▼ 基因功能
He 等人使用定量 RT-PCR 和数据库分析(2018) 发现,与相应的对照相比,BLACAT2 在高级别膀胱癌、淋巴结(LN) 阳性膀胱癌和 LN 转移性肿瘤中过度表达。 原位杂交显示,BLACAT2在正常膀胱组织中表达较低,在非淋巴结转移性膀胱癌中表达中等,在淋巴结转移性膀胱癌中表达强。 BLACAT2过表达与瘤内和瘤周淋巴管密度相关,促进膀胱癌细胞的淋巴结转移。 在培养的膀胱癌细胞系和小鼠模型中,BLACAT2 过表达诱导淋巴管生成并增加细胞侵袭性。 基因分析显示,BLACAT2 有助于膀胱癌细胞中 VEGFC(601528)、SNAI2(602150) 和 MMP9(120361) 的上调。 BLACAT2 在 VEGFC 启动子中形成具有 2 个结合位点的三链体,并通过招募 WDR5(609012) 来调节启动子的组蛋白 H3(参见 602810)lys4(H3K4) 甲基化。 阻断人淋巴内皮细胞(HLEC) 和小鼠模型中的 VEGFC 信号传导可消除 BLACAT2 诱导的淋巴管生成和淋巴结转移。
▼ 测绘
他等人(2018) 指出 LINC00958 基因对应到染色体 13p15.2。 然而,Gross(2019) 根据 LINC00958 序列(GenBank NR_038904) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 LINC00958 基因对应到染色体 11p15.3。