THADA 犰狳重复含有蛋白质; THADA
- 甲状腺腺瘤相关基因
- KIAA1767
HGNC 批准的基因符号:THADA
细胞遗传学位置:2p21 基因组坐标(GRCh38):2:43,230,851-43,596,038(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从大小分级的人脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2000) 克隆了 THADA,他们将其命名为 KIAA1767。 cDNA 的 5 引物末端含有重复元件,推导的蛋白质含有 894 个氨基酸。 RT-PCR ELISA 检测到肝脏中高表达,所有其他成人和胎儿组织中检测到中等表达。
Rippe 等人使用定位克隆和 3-prime RACE 来鉴定甲状腺腺瘤中染色体 2p21 畸变的基因破坏(2003) 克隆 THADA。 全长蛋白质含有 1,954 个氨基酸,计算分子量为 220 kD。 里佩等人(2003) 还鉴定了缺乏外显子 27 和 28 的 THADA 剪接变体。Northern 印迹分析检测到在所有检查的组织中 6.2-kb THADA 转录物的可变表达。
德里施纳等人(2007) 确定全长 THADA 蛋白包含用于蛋白质-蛋白质相互作用的 ARM 重复序列。 人类 THADA 与非洲绿猴、小鼠和鸡 Thada 的氨基酸相似度分别为 95.9%、78.2% 和 64.9%。 脊椎动物中 THADA 最保守的区域对应于人类 THADA 的氨基酸 1033 至 1415。
▼ 基因结构
里佩等人(2003) 确定 THADA 基因包含 38 个外显子,跨度约为 365 kb。 德里施纳等人(2007)指出THADA的起始密码子位于外显子2中。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Rippe 等人(2003) 将 THADA 基因定位到染色体 2p21。
▼ 细胞遗传学
大约 10% 的良性甲状腺肿瘤中发现了染色体 2p21 的重排。 里佩等人(2003) 发现 2 例以易位 t(2;20;3)(p21;q11.2;p25) 和 t(2;7)(p21;p15) 为特征的甲状腺腺瘤中的 2p21 断点分别发生在外显子中 THADA 基因的 28。 源自染色体 3p25 和 7p15 的序列似乎不包含编码区。 德里施纳等人。 Rippe 等人(2007) 确定,在甲状腺腺瘤中观察到 THADA 截短(2003) 破坏了脊椎动物中 THADA 蛋白最保守的区域。
▼ 进化
格林等人(2010) 发表了尼安德特人基因组序列草案。 将尼安德特人基因组与来自世界不同地区的 5 个现代人类的基因组进行比较,发现了许多可能受到现代人类祖先正选择影响的基因组区域,包括参与新陈代谢以及认知和骨骼发育的基因 。 格林等人(2010) 总共确定了 212 个包含假定选择性扫描的区域。 在 20 个最宽的区域中,有 5 个不包含蛋白质编码基因,其他区域包含 1 到 12 个基因。 最宽的区域位于 2 号染色体上,包含 THADA 基因,其中 336 kb 的区域耗尽了尼安德特人的衍生等位基因。 THADA 附近的 SNP 与 2 型糖尿病相关(125853),并且 THADA 表达在糖尿病患者和健康对照者之间存在差异(Parikh et al., 2009)。 格林等人(2010)还表明,尼安德特人与欧亚大陆的现代人类比与撒哈拉以南非洲的现代人类共享更多的遗传变异,这表明从尼安德特人到非非洲人祖先的基因流动发生在欧亚群体分化之前 来自彼此。