遗传性前列腺癌,6
- HPC6
细胞遗传学位置:22q12.3 基因组坐标(GRCh38):22:31,800,001-37,200,000
有关遗传性前列腺癌的一般讨论,请参阅 176807。
▼ 测绘
徐等人(2005) 对 269 个前列腺癌家族(至少有 5 个受影响成员)进行了全基因组连锁分析,发现染色体 22q12 存在显着连锁(lod 评分,3.57)。
坎普等人(2006) 指出,至少有 8 项其他研究指出染色体 22q12.3 在前列腺癌中具有特别重要的意义,对数值范围为 1.50 至 3.57。 他们使用谱系特异性重组作图方法对 14 个信息丰富的高风险犹他州谱系进行了精细作图和区域定位。 选择这 14 个谱系是因为它们要么是“连锁”谱系,要么是“单倍型共享”谱系,或者两者兼而有之。 “连锁”谱系是那些具有指向 22q12.3 区域的显着谱系特异性连锁证据的谱系,无论共享分离单倍型的前列腺癌病例数量如何。 “单元型共享”谱系是指至少有 5 个前列腺癌病例在 22q12.3 区域共享分离单元型的谱系,无论连锁证据如何。 Camp 等人使用这种方法(2006) 将 22q12.3 标记 D22S1265 和 D22S277 之间的片段确定为最有可能包含 22q 前列腺癌易感基因的区域。 为了进一步完善前列腺癌与染色体 22q12.3 的联系,Camp 等人(2007) 在他们之前的研究中,在 14 个犹他州血统中添加了 40 个新的前列腺癌血统。 当考虑所有 54 个谱系时,共有区域缩小到侧翼为 D22S281 和 D22S683 的 2.2 Mb 区域,其中包括 11 个基因。
约翰内森等人(2008) 使用来自 42 个高风险家族的单倍型和重组数据进行精细作图,发现当使用所有家族时不存在明确的一致区间。 然而,在每个家庭有 5 名或以上受影响男性的 14 个家庭的子集中,他们发现了一个 2.53 Mb 的共享共识片段,与之前发布的间隔重叠; 将他们的结果与早期数据相结合,将染色体 22q12.3 的关键区域减少到大约 1.36 Mb。
约翰内森等人(2010) 使用 22q12 区域的 SNP 进行基于家族的关联测试,重新评估 Johanneson 等人确定的 2 个孤立队列中的 42 个患有前列腺癌的家族(2008)。 有 150 名患有前列腺癌的男性有可用的 DNA。 与 506 个不相关的白种人对照相比,最强的关联被发现与 APOL3(607253) 基因 5 素端的 2 个 SNPS:rs2097465 和 rs2017329(p 值均约为 7.0 x 10(-5))。 APOL3 基因的测序发现了一个上游 SNP(rs132660),也显示出相关性。 研究结果将候选区域细化至 15 kb。 另一个包含 1,320 名患者和 1,266 名对照的数据集证实了与 rs132660 的关联; 然而,在 1,176 例病例和 1,105 例对照的额外样本中,与 rs132660 或 rs2097465 没有关联。