干扰素调节因子 2 结合蛋白 1; IRF2BP1
- IRF2 结合蛋白 1
HGNC 批准的基因符号:IRF2BP1
细胞遗传学位置:19q13.32 基因组坐标(GRCh38):19:45,883,608-45,886,141(来自 NCBI)
▼ 说明
IRF2(147576) 属于一个蛋白家族,该蛋白家族在响应病毒感染的 I 型干扰素(例如 IFNA;147660)的转录调节以及响应 I 型和 II 型干扰素( 例如,IFNG;147570)干扰素。 IRF2BP1 和 IRF2BP2(615332) 与 IRF2 的 C 端抑制结构域结合,并具有 IRF2 依赖性转录辅阻遏物的特性(Childs 和 Goodbourn, 2003)。
▼ 克隆与表达
通过使用 IRF2 C 端抑制域作为诱饵对胎盘 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选,Childs 和 Goodbourn(2003) 分离出了编码 IRF2BP1 和 IRF2BP2 2 个亚型的 cDNA。 预测的 584 个氨基酸的 IRF2BP1 蛋白包含 N 端 C4 锌指基序和 C 端 C3HC4 RING 指。 对转染细胞的细胞质和核提取物进行蛋白质印迹分析表明,IRF2BP1 和两种 IRF2BP2 亚型均定位于细胞核。
▼ 基因功能
Childs 和 Goodbourn(2003) 使用酵母 2-杂交分析表明,IRF2BP1 和两种 IRF2BP2 亚型与 IRF2 的 58 个 C 端氨基酸特异性相互作用,但不与 IRF1(147575) 或 IRF9(147574) 相互作用。 IRF2BP 蛋白无法与自身或彼此相互作用,表明无法形成二聚体。 免疫共沉淀分析证实了每个 IRF2BP 与 IRF2 的相互作用。 功能分析表明,IRF2BP 的转录抑制是通过 IRF2 招募到启动子而发生的,与组蛋白脱乙酰化无关。 缺少 val177 和 val178 的 IRF2 同工型不与 IRF2BP2 相互作用,表明 DNA 结合结构域和 IRF2 C 端区域的相对构象对于转录抑制至关重要。
Kimura(2008) 使用表位标记和免疫共沉淀分析进行确认,将 IRF2BP1 鉴定为 JDP2(608657) 结合蛋白。 IRF2BP1 增强了 JDP2 的泛素化,这需要 IRF2BP1 RING Finger 结构域。 如荧光素酶分析所示,IRF2BP1 抑制 ATF2(123811) 介导的转录激活,与 IRF2BP1 泛素连接酶活性无关。 蛋白质下拉分析表明 IRF2BP1 与 ATF2 直接相互作用。
▼ 测绘
Gross(2013) 根据 IRF2BP1 序列(GenBank BC038222) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 IRF2BP1 基因定位到染色体 19q13.32。