细胞色素 C 氧化酶组装因子 3; COA3
- 含有卷曲螺旋结构域的蛋白质 56;CCDC56
- 细胞色素 c 氧化酶 12 的线粒体翻译调节组装中间体; MITRAC12
HGNC 批准的基因符号:COA3
细胞遗传学位置:17q21.2 基因组坐标(GRCh38):17:42,797,625-42,798,704(来自 NCBI)
▼ 说明
COA3 基因编码参与线粒体复合物 IV(COX) 组装的蛋白质(Mick et al., 2012)。
▼ 克隆与表达
Peralta 等人通过在人类数据库中搜索与果蝇 Ccdc56 相似的序列(2012) 鉴定了 COA3,他们将其称为 CCDC56。推导的 106 个氨基酸蛋白包含一个中央单程跨膜结构域和一个 C 端卷曲螺旋结构域。人类 CCDC56 与果蝇蛋白有 42% 的同一性。数据库分析显示 CCDC56 在后生动物中保守,但在酵母或植物中则不然。
Szklarczyk 等人使用数据库分析和蛋白质分析来鉴定酵母细胞色素 C 氧化酶(COX) 组装蛋白的人类直系同源物(2012) 孤立鉴定了 COA3。
米克等人(2012) 发现 HEK293 细胞中线粒体外膜的破坏导致 MITRAC12 C 末端暴露,表明 MITRAC12 是一种线粒体内膜蛋白,其 C 末端暴露于膜间隙。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Peralta 等人(2012) 将 COA3 基因定位到染色体 17q21.31。
▼ 基因功能
通过 HEK293 细胞的免疫沉淀分析,Mick 等人(2012) 发现 MITRAC12 与细胞色素 c 氧化酶组装蛋白 SURF1(185620) 以及呼吸复合物 IV 的一个亚基 COX1(MTCO1; 516030) 相关。通过小干扰 RNA 消除 HEK293 细胞中的 MITRAC12 会导致生长缺陷、新合成的复合物 IV 含量减少以及细胞色素 c 氧化酶活性降低。定量亲和纯化和质谱分析表明 MITRAC12 与中心复合物 IV 亚基和多个复合物 IV 组装因子相互作用。
▼ 分子遗传学
Ostergaard 等人在一名患有线粒体复合物 IV 缺陷核型 14(MC4DN14; 619058) 的 34 岁女性中表现为运动不耐受和周围神经病变(2015) 鉴定了 COA3 基因中的复合杂合突变(614775.0001 和 614775.0002)。
▼ 动物模型
佩拉尔塔等人(2012) 发现果蝇中纯合的 Ccdc56 敲除导致发育迟缓,随后在第三幼虫阶段停滞并在蛹化前死亡。主要的生化表型是严重的孤立性COX复合物IV缺陷。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 线粒体复合物 IV 缺陷,核 14 型(1 名患者)
COA3,1-BP DUP,199C
Ostergaard 等人在一名患有线粒体复合物 IV 缺陷核型 14(MC4DN14; 615098) 的 34 岁女性中表现为运动不耐受和周围神经病变(2015) 鉴定了 COA3 基因中的复合杂合突变:外显子 1 中的 1 bp 重复(c.199dupC, NM_001040431.2),导致移码和提前终止(Leu67ProfsTer21),以及 c.215A-G 转变,导致跨膜结构域中高度保守的残基处由 tyr72 替换为 cys(Y72C; 614775.0002)。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。在外显子组测序项目(ESP6500) 数据库的 8,600 个等位基因中,有 3 个发现了 Y72C 变体(rs139877390)。患者成纤维细胞显示 COA3 蛋白稳态水平下降(约 50%),没有检测到 COX14(614478),并且复合物 IV 的合成减少。野生型 COA3 的转染挽救了复杂的 IV 组装缺陷。尽管患者骨骼肌仅显示17%残留复合物IV缺乏,但表型相对较轻;奥斯特加德等人(2015) 假设组织特异性缺陷主要影响肌肉而不是其他器官系统。
.0002 线粒体复合物 IV 缺陷,核 14 型(1 名患者)
COA3,TYR72CYS(rs139877390)
讨论 COA3 基因中的 c.215A-G 转变(c.215A-G,NM_001040431.2),导致 tyr72 至 cys(Y72C) 取代,该取代在患有以下疾病的患者中以复合杂合状态发现:线粒体复合物 IV 缺陷核型 14(MC4DN14; 619058),Ostergaard 等人(2015),参见 614775.0001。