锌指蛋白 397; ZNF397

HGNC 批准的基因符号:ZNF397

细胞遗传学位置:18q12.2 基因组坐标(GRCh38):18:35,241,034-35,259,227(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Wu等人通过数据库分析,然后对培养的肝癌细胞进行RT-PCR扩增(2003) 鉴定出 ZNF397。 它编码 534 个氨基酸的全长蛋白,具有 N 端 SCAN 结构域和 9 个串联 C 端 C2H2 锌指重复序列。 选择性剪接产生 198 个氨基酸的截短蛋白质,缺少锌指。 两种 ZNF397 蛋白具有相同的 N 端区域,由 185 个氨基酸组成,其中包含 1 个 SCAN 结构域。 Northern 印迹分析检测到 9.0、7.0、2.5 和 1.7 kb 的 ZNF397 转录本。 在睾丸中表达较强,在骨骼肌、胰腺和前列腺中表达中等,在心脏、胎盘、肝脏、肾脏、脾脏、胸腺和小肠中表达较弱。 免疫组织化学显示全长蛋白质定位于细胞核,而截短的蛋白质广泛定位于整个细胞。

▼ 基因功能

使用免疫共沉淀,Wu 等人(2003) 表明全长和截短的 ZNF397 蛋白形成同二聚体,也可以彼此形成异二聚体。 荧光素酶测定表明,ZNF397 的截短亚型(而非全长蛋白)可以充当转录阻遏蛋白。 缺失分析表明,缺少锌指区域的全长 ZNP397 蛋白可以激活转录。

▼ 基因结构

吴等人(2003) 确定 ZNF397 基因包含 4 个跨度为 6 kb 的外显子。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Wu 等人(2003) 将 ZNF397 基因定位到染色体 18q12。