GTP 酶激活蛋白,RAN,1; RANGAP1

  • RAN GTP 酶激活蛋白 1

HGNC 批准的基因符号:RANGAP1

细胞遗传学位置:22q13.2 基因组坐标(GRCh38):22:41,244,779-41,302,369(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

RAS 相关的小 GTP 结合蛋白(GTPBP),例如 RAN(601179),参与各种细胞内信号转导途径。GTP 结合形式通常代表蛋白质的活性信号传导形式。GTPBP 中潜在的 GTP 酶活性被激活后,GTP 就会水解为 GDP 和磷酸盐,并将其恢复到非活性、GDP 结合状态。这种潜在的 GTP 酶活性是在 GTP 结合的 GTPBP 与 GTP 酶激活蛋白(GAP) 相互作用时诱导的。比肖夫等人(1994) 从 HeLa 细胞提取物中纯化出 GAP。该蛋白质被命名为 RanGAP1,是一种同源二聚体 65-kD 多肽。RanGAP1 特异性诱导 RAN 的 GTPase 活性,但不诱导 RAS(190020) 的 GTPase 活性超过 1,000 倍。比肖夫等人(1994) 认为 RanGAP1 是 RCC1(179710) 的直接拮抗剂,

比肖夫等人(1995) 从人 HeLa 细胞中纯化了 65 kD RanGAP1 蛋白。他们使用基于 RanGAP1 肽序列的简并引物进行 PCR,从 HeLa 细胞文库中克隆了相应的 cDNA。RANGAP1 基因编码 587 个氨基酸的多肽。该序列与其他 RAS 相关蛋白的 GTP 酶激活剂的序列无关,但与酵母 Rna1p 的鼠同源物 Fug1 有 88% 的同一性。比肖夫等人(1995) 提出 RanGAP1 和 RCC1 控制细胞核和细胞质之间的 RAN 依赖性转移。

▼ 基因功能

RAN 是一种类似 RAS 的核 GTP 酶,是蛋白质和核糖核蛋白穿过核孔复合体(NPC) 双向转运所必需的。RanGAP1 是 RAN GTP/GDP 循环的关键调节因子。马图尼斯等人(1996) 报道了 RanGAP1 的一种新形式的鉴定和定位。他们表明,RanGAP1 的 70-kD 未修饰形式完全是细胞质的,而 90-kD 修饰形式则与 NPC 的细胞质纤维相关。这种修饰形式似乎也与有丝分裂期间的有丝分裂纺锤体相关。这些发现对 RAN 功能具有特定的意义,并对泛素样修饰的蛋白质调节具有广泛的意义。

RANGAP1 通过 SUMO1(601912) 的缀合进行修饰,并且这种修饰是 RANGAP1 与核孔复合物结合所必需的。大隈等人(1999) 表明人 SUA1(SAE1; 613294)、UBA2(613295) 和 UBC9(UBE2I; 601661) 在体外两步反应中催化 RANGAP1 的苏酰化。

C9ORF72 基因(614260.0001) 中的六核苷酸重复扩增(HRE) GGGGCC(G4C2) 是肌萎缩侧索硬化症和额颞叶痴呆(FTDALS1;参见 105550) 的最常见原因。为了发现对 G4C2 介导的神经发生进行基因修饰的 RNA 结合蛋白,Zhang 等人(2015) 在表达 30 个 G4C2 重复的果蝇中进行了基于候选的遗传筛选。他们发现 RanGAP(人类 RanGAP1 的果蝇直系同源物)是核细胞质转移的关键调节因子,是神经退行性变的有效抑制剂。增强蛋白质的核输入或抑制核输出也可以抑制神经变性。RanGAP 与 HRE RNA 发生物理相互作用,并在表达 HRE 的果蝇、来自 C9ORF72 ALS 患者来源的诱导多能干细胞(iPSC 来源的神经元)的神经元中错误定位,以及 C9ORF72 ALS 患者的脑组织。果蝇模型和 C9ORF72 iPSC 衍生神经元中的 HRE 表达导致核输入受损,而这些缺陷可以通过针对 HRE G 四链体的小分子和反义寡核苷酸来弥补。张等人(2015) 表明核细胞质转运缺陷可能是 ALS 和 FTD 的基本途径,并且适合药物治疗干预。

▼ 生化特征

晶体结构

西瓦尔德等人(2002) 提出了基态和过渡态模拟中 Ran-RanBP1-RanGAP 三元复合物的三维结构。结构和生化实验表明,RanGAP 不通过精氨酸指起作用,快速 GTP 水解的基本机制完全由 Ran 提供,并且催化谷氨酰胺的正确定位对于催化至关重要。

伯尼尔-维拉莫尔等人(2002) 对哺乳动物 UBC9 和 RANGAP1 C 末端结构域(2.5 埃) 之间的复合物进行了晶体学分析。这些实验揭示了识别 SUMO 缀合蛋白中共有 SUMO 修饰序列的结构决定因素。UBC9 和 RANGAP1 基于结构的诱变和生化分析揭示了 p53(191170)、NFKBIA(164008) 和 RANGAP1 的底物结合和 SUMO 修饰所需的不同基序。

Reverter 和 Lima(2005) 描述了 UBC9、NUP358/RANBP2(601181) E3 连接酶结构域(IR1-M) 和与 RANGAP1 羧基末端结构域缀合的 SUMO1 的 4 蛋白复合物的 3.0 埃晶体结构。结构见解与通过其他底物获得的生化和动力学数据相结合,支持了一个模型,其中 NUP358/RANBP2 通过结合 SUMO 和 UBC9 将 SUMO-E2-硫酯定位在最佳方向以增强缀合,从而充当 E3。