天冬氨酸氨基转移酶,数量性状基因座 1 的血清水平
ASTQTL1
GOT1 基因(138180) 的变异会导致血清谷氨酸草酰乙酸转氨酶(也称为天冬氨酸转氨酶(AST))降低。
▼ 测绘
沉等人(2011) 对遗传和表型干预心脏研究的 866 名阿米什参与者进行了血清 AST(EC 2.6.1.1) 活性的全基因组关联研究,并确定了 AST 活性与位于染色体 10q24 上的一组 SNP 之间的显着关联(峰值 相关性为 rs17109512;p = 2.80 x 10(-14)),位于编码胞质 AST 的 GOT1 基因附近。 与野生型等位基因的 856 名纯合子相比,10 名相关 SNP 杂合子受试者的 AST 水平显着降低。
▼ 分子遗传学
鉴于相关 SNP 的频率较低、其与 GOT1 的接近性以及关联的效应量非常大,Shen 等人(2011) 假设 rs17109512 可能标记 GOT1 中的功能性 SNP。 GOT1 的测序揭示了第 389 位(138180.0001) 处编码天冬酰胺的 3 个核酸的框内缺失。 该删除与 rs17109512 完全连锁。 与缺失非携带者的纯合子相比,缺失携带者的 AST 活性水平显着降低(平均值 +/- SD:10.0 +/- 2.8 vs 18.8 +/- 5.2 微升;p = 2.80 x 10(-14))。 对 1,932 个其他阿米什样本中的缺失进行进一步基因分型,确定了另外 20 个携带者(次要等位基因频率 = 0.0052)。 在 647 名近交白种人中未检测到该缺失。 密码子 389 处的天冬酰胺在已知的哺乳动物细胞质 AST(cAST) 中是保守的。 野生型和突变型 cAST 的体外瞬时转染测定表明,突变型 cAST 蛋白在细胞中几乎检测不到。 此外,即使在校正 cAST 表达后,突变体 cAST 的酶活性也显着降低。 值得注意的是,缺失与代谢特征(包括血清空腹血糖或胰岛素、空腹和餐后血脂、炎症标志物或心血管疾病的亚临床标志物)之间没有关联。