核因子 KAPPA-B 抑制剂,ε; NFKBIE
- NFKB 抑制剂、ε
- B 细胞中 KAPPA 轻链基因增强剂的核因子抑制剂,ε
- B 细胞中 KAPPA 轻链基因增强子的抑制剂,ε; IKBE
HGNC 批准的基因符号:NFKBIE
细胞遗传学定位:6p21.1 基因组坐标(GRCh38):6:44,258,166-44,265,551(来自 NCBI)
▼ 说明
NFKB1(164011) 或 NFKB2(164012) 与 REL(164910)、RELA(164014) 或 RELB(604758) 结合形成 NFKB 复合体。 NFKB 复合物受到 I-kappa-B 蛋白(NFKBIA,164008 或 NFKBIB,604495)的抑制,该蛋白通过将 NF-kappa-B 捕获在细胞质中来使其失活。 I-kappa-B 蛋白上的丝氨酸残基被激酶(IKBKA,600664 或 IKBKB,603258)磷酸化,标记它们通过泛素化途径被破坏,从而激活 NF-kappa-B 复合物。 激活的 NFKB 复合物易位到细胞核中,并在 kappa-B 结合基序处结合 DNA,例如 5-prime GGGRNNYYCC 3-prime 或 5-prime HGGARNYYCC 3-prime(其中 H 是 A、C 或 T;R 是 A 或 G 嘌呤;Y 是 C 或 T 嘧啶)。 对于某些基因,激活需要 NFKB 与其他转录因子相互作用,例如 STAT(参见 STAT6, 601512)、AP1(JUN, 165160)和 NFAT(参见 NFATC1, 600489)。
▼ 克隆与表达
Whiteside 等人使用酵母 2-杂交系统筛选人类 PBL 衍生的 cDNA 文库(1997) 鉴定了一个新的 I-kappa-B 家族成员 NFKBIE,他们将其命名为 I-kappa-B ε。 NFKBIE 表达为 45 kD 蛋白质,在静息细胞中以多种磷酸化亚型存在,并主要与 RELA 和 REL 形成复合物。 推导的 361 个氨基酸的蛋白质在第 18 和 22 位包含 6 个紧密间隔的锚蛋白重复序列和 2 个丝氨酸残基,但没有 C 端 PEST 残基。 用 LPS 或佛波酯刺激细胞会导致 NFKBIE 的蛋白水解降解。 Northern 印迹分析揭示了所有测试细胞中 2.2-kb 转录物的表达。
Li 和 Nabel(1997) 孤立克隆了 NFKBIE。 他们通过 Northern blot 分析检测了 NFKBIE 的 2.2 kb 和 2.8 kb 转录本,发现该蛋白与 RELA 和 REL 相互作用最强,而且与 NFKB1 和 NFKB2 相互作用最强。
▼ 基因功能
Hoffmann 等人使用电泳迁移率变动分析(EMSA)(2002) 表明,用 TNFA(191160) 持续刺激 T 细胞、单核细胞或成纤维细胞会导致 IKBA、IKBB 和 IKBE 的协调降解、合成和定位,这是产生特征性 NFKB 激活谱所必需的。
▼ 动物模型
霍夫曼等人(2002)通过同源重组产生了 Ikbb 和 Ikbe 缺陷的小鼠,并将它们与 Ikba 缺陷的小鼠杂交,产生仅含有 1 个 Ikb 同工型的胚胎成纤维细胞。 Ikba 成纤维细胞的 TNFA 刺激导致高度振荡的 Nfkb 反应,而在 Ikbb 和 Ikbe 成纤维细胞中,核 Nfkb 单调增加。 霍夫曼等人(2002) 得出结论,IKBA 介导 NFKB 的快速激活和强负反馈调节,而 IKBB 和 IKBE 对 IKK 激活的反应较慢,并起到抑制 NFKB 反应的长期振荡的作用。 计算和 EMSA 分析揭示了与刺激持续时间相关的双峰信号处理特征,从而能够产生 IP10(CXCL10; 147310) 和 RANTES(CCL5; 187011) 基因表达的特异性。 在一篇评论中,Ting 和 Endy(2002)将信号的持续时间与按下钢琴键(导致锤子敲击琴弦)产生可听音调进行了比较。 敲击琴弦的力度,以及琴键释放后是否持续琴弦振动,都可以通过踩下脚踏板来改变,就像信号传导路径被环境中的信息激活和改变一样。