DNAJ/HSP40 同源物,亚科 C,成员 13; DNAJC13

  • 受体介导的内吞作用 8,线虫,同源物;RME8
  • KIAA0678

HGNC 批准的基因符号:DNAJC13

细胞遗传学位置:3q22.1 基因组坐标(GRCh38):3:132,417,502-132,539,032(来自 NCBI)

▼ 描述

DNAJC13 基因编码一种定位于内体系统膜的蛋白质,在囊泡形成和转移中发挥作用(Vilarino-Guell 等人的总结,2014)。

▼ 克隆和表达

Ishikawa 等人通过对从大小分级的成人脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(1998) 获得了部分 DNAJC13 克隆,他们将其命名为 KIAA0678。RT-PCR检测到DNAJC13在所有检查组织中表达,其中卵巢中表达量最高,胰腺和脾脏中表达量最低。

通过寻找 3 号染色体区域中与青少年肾痨(NPHP3; 604387) 和 Senior-Loken 综合征(SLSN3; 606995) 相关的基因,Volz 等人(2002) 确定了 KIAA0678。推导的蛋白质包含 DnaJ 同源结构域和保守的 his-pro-asp(HPD) 基序,该基序可能参与 HSP70(参见 HSPA1A;140550)ATP 酶活性的调节。

Girard 等人通过在数据库中搜索与大鼠 Rme8 相似的序列(2005) 获得了人类 DNAJC13 的全长序列,他们将其称为 RME8。推导的 2,243 个氨基酸的蛋白质具有一个中央 DnaJ 结构域,两侧各有 2 个 IWN 重复序列。它还具有 4 个潜在的网格蛋白重链(CHC 或 CLTC;118955)相互作用基序。COS-7 细胞和 HeLa 细胞的共聚焦免疫荧光分析显示,内源性 RME8 以点状分布,在核周区域积累并与内体标记物重叠。对大鼠组织和几种细胞系(包括 HEK293 和 HeLa 细胞)进行蛋白质印迹分析,检测到表观分子质量为 220 kD 的 RME8。大鼠肾脏的分级分离和蛋白质提取实验表明,Rme8 是一种与微粒体相关的外源性膜蛋白。

▼ 基因功能

Girard 等人(2005) 表明,人 RME8 的分离 DnaJ 结构域以 ATP 依赖性方式结合大鼠肾 Hsc70(HSPA8;600816)。COS-7 细胞中 Rme8 的敲低会破坏 Egfr(131550)、Cimpr(IGF2R; 147280) 和组织蛋白酶 D(CTSD; 116840) 的内吞转移。

▼ 基因结构

Girard 等人(2005)确定DNAJC13基因含有56个外显子。

通过辐射混合分析进行绘图,Ishikawa 等人。Volz 等(1998) 将 DNAJC13 基因对应到 3 号染色体(2002) 通过基因组序列分析将 DNAJC13 基因定位到染色体 3q21-q22。吉拉德等人(2005) 通过基因组序列分析将 DNAJC13 基因定位到染色体 3q22.1。

▼ 分子遗传学

关联有待确认

有关 DNAJC13 基因变异在抽动秽语综合征/慢性抽动障碍中可能发挥的作用的讨论,请参阅 137580。

有关 DNAJC13 基因变异与帕金森病之间可能关联的讨论,请参阅 PARK21(616361) 和 614334.0001。

▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):

.0001 重新分类 - 意义未知的变异体
DNAJC13,ASN855SER
该变异体以前名为帕金森病 21,已根据 Deng 等人的研究结果重新分类(2016)。

Vilarino-Guell 等人在患有常染色体显性帕金森病 21(PARK21; 616361) 的荷兰/德国/俄罗斯血统的第四代门诺派大家族(SK1) 的受影响成员中(2014) 在 DNAJC13 基因中鉴定出杂合的 c.2564A-G 转换(c.2564A-G,NM_015268.3),导致高度保守残基处的 asn855 到 Ser(N855S)取代。该突变是通过外显子组测序发现的,与家族中的表型分离,并且在 2,676 名对照个体或任何公共变异数据库中均未发现。对另外 2,928 名帕金森病患者进行测序,发现另外 5 名先证者具有相同的突变,其中 2 人有该疾病的家族史。所有携带该突变的个体均报告有荷兰/德国/俄罗斯门诺派血统,单倍型分析与创始人效应一致。

Vilarino-Guell 等人报道了来自同一家族的 13 名受影响个体(2014),邓等人(2016) 鉴定了 TMEM230 基因中的杂合错义变体(R141L; 617019.0001)。