VPS29 复写蛋白复合组件； VPS29

液泡蛋白分选 29，酵母，
逆转录酶蛋白
PEP11
DC7
DC15的同源物

HGNC 批准的基因符号：VPS29

细胞遗传学位置：12q24.11 基因组坐标（GRCh38）：12:110,491,083-110,502,111（来自 NCBI）

▼ 描述

逆转录酶是一种膜相关外壳复合物，在膜蛋白的内体到高尔基体修复中发挥作用。逆转录体由 2 个不同的子复合体组成，一个包含 VPS35（601501）、VPS29 和 VPS26（参见 605506）的货物选择性子复合体，以及一个分选连接蛋白 SNX1（601272）和 SNX2（605929）的子复合体，可调节内体膜（Seaman 等人的总结，2009）。

▼ 克隆与表达

Edgar 和 Polak（2000）使用酿酒酵母序列在 EST 数据库中搜索同源人类序列。从该搜索中获得的序列用于开发引物，通过 PCR 从人肺 cDNA 文库中克隆 VPS29。推导的 20.5-kD VPS29 蛋白是亲水性的，并且具有预测的混合 α 螺旋和 β 折叠结构。它具有 2 个聚腺苷酸化信号和一个含有保守 NPGS 氨基酸基序的带电 C 末端。Northern印迹分析检测到对应于2个聚腺苷酸化信号的2个0.8和2kb的转录物。较长的转录本更丰富，在心脏、骨骼肌和肾脏中表达最高，在脑、结肠和肝脏中表达中等，在胸腺、脾脏、小肠、胎盘、肺和白细胞中表达最低。Edgar 和 Polak（2000）还通过 PCR 从小鼠肺 cDNA 文库克隆了小鼠 Vps29。除了 C 端丝氨酸外，小鼠蛋白与人类蛋白相同。

▼ 基因功能

Haft 等（2000）使用酵母 2-杂交测定、突变分析和哺乳动物细胞表达来定义 VPS29 和酵母液泡蛋白分选蛋白 VPS26、SNX1 和 VPS35 的其他人类直向同源物之间的结合相互作用。他们的结果与 VPS29 在多聚体复合物中与 VPS35 结合的模型一致。哈夫特等人（2000）确定了 VPS35 内与 VPS29 相互作用的离散结构域。COS-7 细胞的凝胶过滤层析显示，重组和内源 VPS 蛋白均作为 220 至 240 kD 复合物共洗脱，并且在不存在 VPS35 的情况下，复合物中未发现 VPS26 和 VPS29。

西曼等人（2009）发现 VPS35/VPS29/VPS26 逆转录子复合体与小 GTP 酶 RAB7（602298）相互作用，并且需要 RAB7 来招募到内体。该子复合物与 GTP 锁定的 RAB7 突变体相互作用，但 GDP 锁定的 RAB7 突变体抑制 VPS26 招募到内体膜。HeLa 细胞中 RAB7 的敲低使 VPS26 和 VPS35 从膜重新分配到细胞质，并降低了膜蛋白从内体到高尔基体的修复效率。西曼等人（2009）还发现 GTP 酶激活蛋白 TBC1D5（615740）导致 RAB7 从核内体解离，并抑制 VPS26 募集到核内体膜。

McNally 等人在人类细胞中使用蛋白质组学分析（2017）鉴定了一种进化上保守的多蛋白复合物，由于其结构和功能与逆转录酶复合物相似，他们将其称为猎犬。猎犬复合物是由 DSCR3（VPS26C; 605298）、C16ORF62（VPS35L; 618981）和 VPS29 组成的异二聚体。检索器复合物与 COMMD（参见 607238）/CCDC22（300859）/CCDC93（CCC）和 WASH（参见 613632）复合物相关，并定位于核内体，通过与货物转换因子偶联来驱动不依赖逆转录酶的检索和回收大量货物蛋白质 SNX17（605963）。

▼ 生化特征

晶体结构

耶罗等人（2007）报道了 VPS29-VPS35 亚复合物的晶体结构，显示了金属磷酸酯酶折叠亚基 VPS29 如何充当 VPS35 C 端一半的支架。VPS35形成马蹄形、右旋、α螺旋螺线管，其凹面完全覆盖VPS29的金属结合位点，而凸面暴露出一系列疏水性螺旋间凹槽。电子显微镜显示完整的VPS26-VPS29-VPS35复合物是棒状的柔性结构，长约21纳米。来自晶体结构、电子显微镜、相互作用研究和生物信息学的混合结构模型表明，α-螺线管折叠延伸了 VPS35 的全长，并且 VPS26 结合在 VPS29 的另一端。

▼ 基因结构

Edgar 和 Polak（2000）确定，VPS29 基因以单拷贝形式存在于人类基因组中，包含 5 个外显子，长度为 10.5 kb。他们还确定了上游 CpG 岛和潜在的 TATA 框。

▼ 测绘

Edgar 和 Polak（2000）根据 VPS29 基因与对应到 12q24 的基因组克隆之间的序列相似性，将 VPS29 基因对应到染色体 12q24。