U2小核RNA辅助因子 1-LIKE 4
U2AF1L4编码一种RNA结合蛋白,其功能相当于mRNA前剪接因子(Shepard等,2002)。
细胞遗传学位置:19q13.12
基因座标(GRCh38):19:35,742,463-35,745,417
▼ 克隆和表达
------
Hatada等(1991)通过限制性地标基因组扫描分离了印迹的小鼠基因U2af1rs1(601079)。该基因与RNA剪接所需的人核糖核蛋白辅助因子(U2AF1; 191317)相关。北川等(1995)分离了小鼠U2af1rs1的3个人类同源物,包括U2af1rs3。这组作者没有从人脑文库中分离出该基因的cDNA,并建议它可能代表假基因。
Shepard等(2002)克隆了小鼠U2af26,并通过数据库分析鉴定了其人类直系同源物。小鼠U2af26蛋白的计算分子量为26 kD,与小鼠U2af35(U2AF1; 191317)具有76%的同一性,其中包括187个N末端残基中的89%的同一性。U2af26包含2个N末端锌指,一个非规范的RNA识别基序以及U2af35与U2af65相互作用的几个保守残基(U2AF2; 191318)。与U2af35相比,U2af26的C端区域包含较少的RS和RE二肽束,所有这些都不相邻,并且它没有甘氨酸束且富含脯氨酸。Northern印迹分析揭示了小鼠U2af26的普遍表达。U2af26与U2af35的表达比例在脑中最高,在肝中最低。免疫荧光显微镜证实U2af26有斑点的核表达。
Heyd等(2008)从小鼠成纤维细胞克隆了缺少外显子7或缺少外显子6和7的小鼠U2af26的2个剪接变体。缺少外显子6和7的变异体有移码,似乎是次要变异体。与全长U2af26的核定位相反,缺少外显子7的变体在转染的细胞中表现出胞质定位。Heyd等(2008年)确定了U2af26外显子7和8中的核定位序列,不同于U2AF35中的核定位序列。
Didych等(2013)指出,U2AF1L4和PSENEN(607632)基因处于头对头方向,只有短序列分隔了它们的第一个外显子。尽管存在不同的剪接形式,但U2AF1L4的水平可能被低估了,RT-PCR分析显示了这两个基因的中等组织特异性。
▼ 基因结构
------
Shepard等(2002)确定U2AF26基因包含8个外显子。
Didych等(2013年)确定了由U2AF1L4和PSENEN基因共享的双向启动子。
▼ 测绘
------
北川等(1995)通过荧光原位杂交将U2AF1RS3基因定位于19p13.2染色体。
Didych等(2013)指出,U2AF1L4和PSENEN基因呈头对头方向,只有157 bp的第一个外显子分开。
▼ 基因功能
------
使用凝胶过滤分析,Shepard等(2002年)表明,小鼠U2af26与人U2AF65形成1:1的复合体。小鼠U2af26充当pre-mRNA剪接因子,可以替代人U2AF35并增强人U2AF65与弱3引物剪接位点的结合。Shepard等(2002年)提出U2AF26参与调控替代剪接。
Heyd等(2008)发现p32(C1QBP; 601269)与小鼠U2af26的C端核定位序列相互作用。U2af26的核定位需要这种相互作用。Heyd等(2008年)提出U2AF26和U2AF35有2种不同的核输入途径,它们可以孤立地控制其向拼接机械的分布和可用性,也可能有助于替代拼接的调节。
Didych等(2013)克隆了一个包含U2AF1L4和PSENEN的第一个外显子起始部分的269 bp片段,并使用荧光素酶分析和荧光显微镜观察,发现两个基因同时表达。Didych等(2013年)得出结论,PSENEN和U2AF1L4基因之间的短DNA区域起着双向启动子的作用,该启动子结合了几个特征性转录因子。他们指出,U2AF1L4和PSENEN均参与T细胞活性的调节。