酰基辅酶A合成酶长链家族,成员6; ACSL6
- 脂肪酸辅酶A连接酶,长链6;FACL6
- 长链酰基辅酶 A 合成酶 2;LACS2
- 长链酰基辅酶A 合成酶 5;LACS5
- 酰基辅酶A 合成酶 2;ACS2
- KIAA0837
此条目中代表的其他实体:
包含 ACS2/ETV6 融合基因
HGNC 批准的基因符号:ACSL6
细胞遗传学位置:5q31.1 基因组坐标(GRCh38):5:131,949,973-132,012,213(来自 NCBI)
▼ 描述
长链酰基辅酶 A 合成酶(EC 6.2.1.3),例如 ACSL6,催化脂肪酸、ATP 和 CoA 形成酰基辅酶 A(Malhotra 等,1999)。
▼ 克隆和表达
Nagase 等人通过对从大小分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,(1998) 克隆了 ACSL6,他们将其命名为 KIAA0837。该转录本的3-prime区域含有重复元件,推导的745个氨基酸的蛋白质与大鼠脑长链脂肪酸CoA连接酶具有高度相似性。RT-PCR ELISA 检测到整个成人大脑和所有受检查的特定成人大脑区域中 ACSL6 表达非常高。心脏和胎儿大脑中的表达较低,在所有其他检查组织中的表达也低得多。
Yagasaki 等人在患有难治性贫血且原始细胞过多且嗜碱性粒细胞增多的患者、患有急性髓性白血病(AML) 并伴有嗜酸性粒细胞增多的患者以及患有急性嗜酸性粒细胞白血病(AEL) 的患者中(1999) 鉴定出 ACSL6(他们将其称为 ACS2)作为反复 t(5;12)(q31;p13) 易位中的 ETV6(600618) 融合伴侣。Northern印迹分析检测到大脑、胎肝和骨髓中ACS2高水平表达,并且发现该基因在人和大鼠中高度保守。
Malhotra 等人使用基于酰基辅酶 A 合成酶保守区域的简并引物(1999) 从 K562 红系细胞系 cDNA 文库中克隆了 ACSL6,他们将其称为 LACS5。推导的 697 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 77.6 kD。它具有跨膜区和预计延伸的 657 个氨基酸的细胞质尾。Northern 印迹分析检测到 K562 细胞、源自肝细胞的胎血、网织红细胞、骨髓和脐带血中 2.9-和 6.3-kb 转录物的可变表达。LACS5也在人脑中以9.4kb和2.9kb的转录本表达。人红细胞血影的蛋白质印迹分析检测到 LACS5 的表观分子质量为 78 kD。
Kee 等人使用小鼠 Pahx(PHYH; 602026) 的中心部分作为小鼠脑 cDNA 文库的酵母 2-杂交筛选中的诱饵(2003)克隆了Acsl6。推导的 722 个氨基酸的小鼠蛋白的计算分子量为 81 kD。Northern 印迹分析检测到 2.6 kb 转录物在大脑和睾丸中高表达,而在心脏和骨骼肌中表达较弱。在大脑中也检测到了约 6.5 kb 的转录本。6.5 kb 转录本在出生时就开始在大脑中表达,并在成年小鼠中增加到最高水平。蛋白质印迹分析在大脑、心脏和睾丸中检测到 95-kD Acsl6 蛋白。
通过在数据库中搜索包含酰基辅酶A合成酶基序1和2的序列,Watkins等人(2007) 鉴定了人类 ACSL6 的 2 个剪接变体,这些变体是由于使用替代外显子 11 而产生的。两种变体都编码 722 个氨基酸的蛋白质,这些蛋白质在酰基辅酶 A 合成酶基序 4 内部存在差异。系统发育分析表明,ACSL5 属于长链家族链酰基辅酶A合成酶。
▼ 基因结构
Watkins 等人(2007) 确定 ACSL6 基因包含 22 个外显子,其中包括 2 个替代外显子 11。
▼
通过序列分析进行绘图,Yagasaki 等人(1999) 将 ACSL6 基因定位到染色体 5q31。
▼ 基因功能
Malhotra 等人(1999)表明重组人LACS5具有棕榈酸、油酸和花生四烯酸的酰基辅酶A合成酶活性。
基等人(2003)发现在神经生长因子(参见162030)诱导的神经突生长期间PC12大鼠嗜铬细胞瘤细胞中Acsl6的表达增加。PC12细胞中Acs16的表达比棕榈酰辅酶A或油酰辅酶A更多地增加花生四烯酰辅酶A的形成。
马萨莱克等人(2005)发现分化的PC12细胞中Acs16的过度表达增强了二十二碳六烯酸(DHA)的内化、DHA向DHA-CoA的转化以及DHA-CoA的积累。
▼ 细胞遗传学
Yagasaki 等人在一名患有难治性贫血且原始细胞过多且嗜碱性粒细胞增多的患者、一名患有嗜酸性粒细胞增多的 AML 患者以及一名患有 AEL 的患者中(1999) 将 ACS2 鉴定为反复 t(5;12)(q31;p13) 易位中的 ETV6 融合伴侣。ETV6/ACS2 融合转录本显示,AEL 患者中 ETV6 外显子 1 与 ACS2 外显子 1 出现框外融合,AML 患者中 ETV6 外显子 1 与 ACS2 外显子 11 出现框外融合,以及难治性贫血患者中 ETV6 外显子 1 与 ACS2 3-prime 非翻译区的框内融合。在其中 2 个病例中发现了相互的 ACS2/ETV6 转录本。12p13 上有 ETV6 粘粒、5q31 上有 BAC 和 PI 的 FISH 表明 AML 和 AEL 病例的 5q31 断点涉及 ACS2 基因的 5-prime 部分,难治性贫血病例的 5q31 断点涉及 ACS2 基因的 3-prime 部分。除了难治性贫血病例中的 ACS2/ETV6 转录本之外,所得嵌合转录本均未产生融合蛋白。