炎症性肠病 15; IBD15
细胞遗传学定位:10q21 基因组坐标(GRCh38):10:51,100,001-68,800,000
有关炎症性肠病(包括克罗恩病(CD) 和溃疡性结肠炎(UC))遗传异质性的一般描述和讨论,请参阅 IBD1(266600)。
▼ 测绘
在一项涉及 988 名回肠克罗恩病患者和 1,007 名对照者 DNA 样本的全基因组关联研究中,Rioux 等人(2007) 发现与位于染色体 10q21 基因间区域的 rs224136 显着相关。 两个孤立的复制队列,分别涉及 530 名回肠 CD 患者及其父母以及 353 名 CD 患者和 207 名对照者,证实了这种关联(合并 p 小于 10(-10))。
Fisher 等人使用为 Wellcome Trust Case Control Consortium(2007) 定制的阵列和分阶段实验设计(2008) 对总共 3,133 名无关的溃疡性结肠炎患者和 4,494 名对照患者进行了基因分型,发现 rs10761659 处存在关联,作者将其描述为染色体 10q21 上的“基因荒漠”。
弗兰克等人(2008) 在德国样本中调查了 50 个先前报告的易感位点,其中包括 1,850 名克罗恩病患者、1,103 名溃疡性结肠炎患者和 1,817 名对照者,并观察到 CD 与 rs10761659 显着相关(p = 8.25l x 10(-5))和 UC(p = 0.0052)。
Weersma 等人在一项涉及 2,731 名荷兰和比利时 IBD 患者(包括 1,656 名 CD 患者和 1,075 名 UC 患者)和 1,086 名对照者的研究中(2009) 重复了 rs10761659 与 CD 的关联(校正 p = 3.58 x 10(-3);比值比,0.75),但没有发现与 UC 显着关联。
对 3 项克罗恩病研究的数据进行荟萃分析,涉及总共 3,230 例病例和 4,829 名对照(Rioux 等人,2007 年、Wellcome Trust 病例对照联盟,2007 年和 Libioulle 等人,2007 年),并在 3,664 名孤立受试者中重复 案例,巴雷特等人(2008) 发现与 10q21 处的 rs10995271 显着相关(合并 p = 4.46 x 10(-20);病例对照比值比,1.25)。
格拉斯等人(2009) 试图复制 Rioux 等人的北美全基因组回肠克罗恩病关联研究的结果(2007) 在一项欧洲队列中,该队列涉及 854 名德国 CD 患者、476 名溃疡性结肠炎患者和 1,503 名健康对照者。 格拉斯等人(2009) 即使在对 529 名具有回肠 CD 表型的德国患者进行亚分析后,也发现 CD 与 rs224136(染色体 10q21.1 基因间区域的 SNP)之间没有关联; 他们的结论是,这些发现可能是由于北美和欧洲 IBD 人群之间的种族差异造成的。
在炎症性肠病中的可能作用
有关 SIRT1 基因在映射至染色体 10q21 的炎症性肠病中可能作用的讨论,请参阅 604479.0001。