碳水化合物磺基转移酶11； CHST11

软骨素4-磺基转移酶1；C4ST1
C4ST

HGNC 批准的基因符号：CHST11

细胞遗传学位置：12q23.3 基因组坐标（GRCh38）：12:104,456,948-104,762,014（来自 NCBI）

▼ 描述

软骨素 4-磺基转移酶，如 CHST11，催化硫酸盐从 3-磷酸腺苷 5-磷酸磷酸转移到软骨素中 N-乙酰半乳糖胺残基的 4 位（Yamauchi 等，2000）。

▼ 克隆和表达

通过在 EST 数据库中搜索与 HNK1ST（CHST10; 151290）相似的序列，Hiraoka 等人（2000）鉴定了 CHST11，他们将其命名为 C4ST1。推导的 352 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 41.5 kD。C4ST1 具有一个 N 端跨膜结构域和 4 个与其他磺基转移酶同源的区域：一个 5 引发磷酸硫酸结合位点、一个 3 引发磷酸结合位点和靠近 C 末端的 2 个 α 螺旋结构域。Northern 和斑点印迹分析表明 C4ST1 在白细胞和造血组织中高表达。

山内等人（2000）克隆小鼠和大鼠 Chst11。小鼠组织的 Northern 印迹分析检测到脑和肾中表达最高，心脏、脾脏和肺中表达较低。

▼ 基因结构

Schmidt 等人（2004）指出 CHST11 基因包含 4 个外显子，跨度 302 kb。第一个外显子是非编码的。

▼

通过辐射混合分析进行绘图，Hiraoka 等人（2000）将 CHST11 基因定位到染色体 12q23。

▼ 基因功能

Hiraoka 等人（2000）发现转染的中国仓鼠卵巢细胞表达的C4ST1增加了放射性标记的硫酸盐掺入软骨素、4-O-硫酸软骨素、6-O-硫酸软骨素和脱硫硫酸皮肤素中。C4ST1 不使用被 HNK1ST 硫酸化的底物或其他检查的受体底物。仅当受体中的葡萄糖醛酸和N-乙酰半乳糖胺均不含硫酸基时，C4ST1才将硫酸盐掺入软骨素中N-乙酰半乳糖胺的4位。在脱硫硫酸皮肤素中，在N-乙酰半乳糖胺的4位上添加了硫酸盐。

▼ 细胞遗传学

施密特等人（2004）在（12;14）（q23;32）报道了一名患有 B 细胞慢性淋巴细胞白血病的白人男性的易位。14 号染色体中的断点位于 Jh（IGHJ; 147010）/C-mu（IGHM; 147020）下游和 C-γ-1（IGHG1; 147100）或 C- 上游的免疫球蛋白重基因座（IGH; 参见 147100）内。 γ-3（IGHG3；147120）。12 号染色体上的断点位于 CHST11 基因的内含子 2 内。检测到两种不同的 IGH-CHST11 融合 cDNA。在这两种情况下，转录都从 IGH 的 C-γ-1 区域开始，方向与正常转录相反，并且都包含 CHST11 外显子 3 和 4。还检测到了相互的 CHST11-IGH 融合，其中主要部分CHST11 外显子 2 的部分连接到源自 C-γ-3 和 C-γ-1 之间区域的 IGH 衍生序列。

乔普拉等人（2015）报道了一名 46 岁的爱尔兰裔女性，患有手脚畸形和淋巴组织增生性疾病，他们在该女性的 12 号染色体（chr12:104,948,000-105,003,000, GRCh37）上发现了一个 55 kb 的缺失，其中包括外显子CHST11 基因的 2 以及嵌入的 microRNA MIR3922。在 3 个未受影响的同胞或千人基因组计划数据库中未发现该删除；从先证者已故的患有类似疾病的妹妹身上无法获得 DNA。作者认为，仅 CHST11 缺失就可以解释先证者的骨畸形，但指出缺失对她的 T 细胞淋巴瘤的影响尚不清楚。

▼ 分子遗传学

在一个患有骨软骨发育不良、短指畸形和手指重叠畸形的巴基斯坦近亲家庭中（OCBMD；618167），Shabbir 等人（2018）鉴定了 CHST11 基因（610128.0001）中 15 bp 框内缺失的纯合性，该基因与疾病分离，并且在公共变异数据库中未发现。与 Chopra 等人报道的家族相反，这个家族没有癌症史（2015）具有相似的表型，但缺失较大（参见细胞遗传学）。

▼ 等位基因变异体（1 个选定的示例）：

.0001 骨软骨发育不良、短指畸形和手指重叠畸形（1 个家族）
CHST11、15-BP DEL、NT467
患有骨软骨发育不良、短指畸形和手指重叠畸形的巴基斯坦近亲家族（OCBMD；618 167），沙比尔等人（2018）在 CHST11 基因的外显子 3 中鉴定出纯合 15 bp 缺失（c.467_481del, NM_001173982.1），导致管腔拓扑结构域内 5 个高度保守的残基（Leu156_Asn160del）缺失。该突变在家族中随疾病分离，在 ExAC、1000 基因组计划或 ESP6500 数据库中未发现。